TSG101

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KPP, 1KPQ, 1M4P, 1M4Q, 1S1Q, 2F0R, 3IV1, 3OBQ, 3OBS, 3OBU, 3OBX, 3P9G, 3P9H, 4EJE, 4YC1, 4ZNY

Ідентифікатори

Символи

TSG101, TSG10, VPS23, tumor susceptibility 101

Зовнішні ІД

OMIM: 601387 MGI: 106581 HomoloGene: 4584 GeneCards: TSG101

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • calcium-dependent protein binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor coactivator activity • virion binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • multivesicular body • ендосома • late endosome • мембрана • late endosome membrane • клітинна мембрана • early endosome • ядерце • endosome membrane • екзосома • ESCRT I complex • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • early endosome membrane • Flemming body
Біологічний процес	• GO:0046795 intracellular transport of virus • диференціація клітин • positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis • regulation of extracellular exosome assembly • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • endosome to lysosome transport • multivesicular body assembly • protein monoubiquitination • viral budding • keratinocyte differentiation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0000046 autophagosome maturation • regulation of cell growth • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • regulation of MAP kinase activity • positive regulation of exosomal secretion • клітинний цикл • regulation of growth • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0022415 viral process • exosomal secretion • macroautophagy • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0015915 транспорт • extracellular transport • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7251


22088

Ensembl


ENSG00000074319


ENSMUSG00000014402

UniProt


Q99816


Q61187

RefSeq (мРНК)


NM_006292


NM_021884 NM_001348088 NM_001348089

RefSeq (білок)


NP_006283


NP_068684 NP_001335017 NP_001335018

Локус (UCSC)

Хр. 11: 18.47 – 18.53 Mb

Хр. 7: 46.54 – 46.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TSG101 (англ. Tumor susceptibility 101) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 944^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVSESQLKK	MVSKYKYRDL	TVRETVNVIT	LYKDLKPVLD	SYVFNDGSSR
ELMNLTGTIP	VPYRGNTYNI	PICLWLLDTY	PYNPPICFVK	PTSSMTIKTG
KHVDANGKIY	LPYLHEWKHP	QSDLLGLIQV	MIVVFGDEPP	VFSRPISASY
PPYQATGPPN	TSYMPGMPGG	ISPYPSGYPP	NPSGYPGCPY	PPGGPYPATT
SSQYPSQPPV	TTVGPSRDGT	ISEDTIRASL	ISAVSDKLRW	RMKEEMDRAQ
AELNALKRTE	EDLKKGHQKL	EEMVTRLDQE	VAEVDKNIEL	LKKKDEELSS
ALEKMENQSE	NNDIDEVIIP	TAPLYKQILN	LYAEENAIED	TIFYLGEALR
RGVIDLDVFL	KHVRLLSRKQ	FQLRALMQKA	RKTAGLSDLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, регуляція росту, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

Li L., Li X., Francke U., Cohen S.N. (1997). The TSG101 tumor susceptibility gene is located in chromosome 11 band p15 and is mutated in human breast cancer. Cell. 88: 143—154. PMID 9019400 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81866-8
Li L., Francke U., Cohen S.N. (1998). Cell. 93: 661—661. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 9867424 DOI:10.1016/S0092-8674(00)89342-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wagner K.-U., Dierisseau P., Rucker E.B. III, Robinson G.W., Hennighausen L. (1998). Genomic architecture and transcriptional activation of the mouse and human tumor susceptibility gene TSG101: common types of shorter transcripts are true alternative splice variants. Oncogene. 17: 2761—2770. PMID 9840940 DOI:10.1038/sj.onc.1202529
Rountree M.R., Bachman K.E., Baylin S.B. (2000). DNMT1 binds HDAC2 and a new co-repressor, DMAP1, to form a complex at replication foci. Nat. Genet. 25: 269—277. PMID 10888872 DOI:10.1038/77023
Bishop N., Horman A., Woodman P. (2002). Mammalian class E vps proteins recognize ubiquitin and act in the removal of endosomal protein-ubiquitin conjugates. J. Cell Biol. 157: 91—101. PMID 11916981 DOI:10.1083/jcb.200112080

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15971 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99816 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.