USP18 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

USP18

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5CHT, 5CHV

Ідентифікатори

Символи

USP18, ISG43, UBP43, ubiquitin specific peptidase 18, PTORCH2

Зовнішні ІД

OMIM: 607057 MGI: 1344364 HomoloGene: 8047 GeneCards: USP18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • ISG15-specific protease activity • cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • regulation of inflammatory response • regulation of protein stability
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11274


24110

Ensembl


ENSG00000184979


ENSMUSG00000030107

UniProt


Q9UMW8


Q9WTV6

RefSeq (мРНК)


NM_017414


NM_011909

RefSeq (білок)


NP_059110


NP_036039

Локус (UCSC)

Хр. 22: 18.15 – 18.18 Mb

Хр. 6: 121.22 – 121.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP18 (англ. Ubiquitin specific peptidase 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 43 011^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKAFGLLRQ	ICQSILAESS	QSPADLEEKK	EEDSNMKREQ	PRERPRAWDY
PHGLVGLHNI	GQTCCLNSLI	QVFVMNVDFT	RILKRITVPR	GADEQRRSVP
FQMLLLLEKM	QDSRQKAVRP	LELAYCLQKC	NVPLFVQHDA	AQLYLKLWNL
IKDQITDVHL	VERLQALYTI	RVKDSLICVD	CAMESSRNSS	MLTLPLSLFD
VDSKPLKTLE	DALHCFFQPR	ELSSKSKCFC	ENCGKKTRGK	QVLKLTHLPQ
TLTIHLMRFS	IRNSQTRKIC	HSLYFPQSLD	FSQILPMKRE	SCDAEEQSGG
QYELFAVIAH	VGMADSGHYC	VYIRNAVDGK	WFCFNDSNIC	LVSWEDIQCT
YGNPNYHWQE	TAYLLVYMKM	EC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Malakhov M.P., Malakhova O.A., Kim K.I., Ritchie K.J., Zhang D.-E. (2002). UBP43 (USP18) specifically removes ISG15 from conjugated proteins. J. Biol. Chem. 277: 9976—9981. PMID 11788588 DOI:10.1074/jbc.M109078200
Burkart C., Fan J.B., Zhang D.E. (2012). Two independent mechanisms promote expression of an N-terminal truncated USP18 isoform with higher DeISGylation activity in the nucleus. J. Biol. Chem. 287: 4883—4893. PMID 22170061 DOI:10.1074/jbc.M111.255570

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12616 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UMW8 (англ.) . Архів оригіналу за 18 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.