USP33

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2UZG

Ідентифікатори

Символи

USP33, VDU1, ubiquitin specific peptidase 33

Зовнішні ІД

OMIM: 615146 MGI: 2159711 HomoloGene: 8996 GeneCards: USP33

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • G protein-coupled receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell body • центросома • комплекс Ґольджі • VCB complex • focal adhesion • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • autophagosome • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • гіалоплазма
Біологічний процес	• ендоцитоз • protein K48-linked deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • centrosome duplication • cellular response to starvation • protein stabilization • negative regulation of protein binding • протеоліз • axon guidance • regulation of autophagy • protein K63-linked deubiquitination • positive regulation of protein binding • cell migration • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23032


170822

Ensembl


ENSG00000077254


ENSMUSG00000025437

UniProt


Q8TEY7


Q8R5K2

RefSeq (мРНК)


NM_015017 NM_201624 NM_201626


NM_001076676 NM_001252486 NM_133247 NM_001355666

RefSeq (білок)

NP_055832 NP_963918 NP_963920 NP_001364359 NP_001364360
NP_001364361 NP_001364362 NP_001364363 NP_001364364 NP_001364365 NP_001364366 NP_001364367 NP_001364368


NP_001070144 NP_001239415 NP_573510 NP_001342595

Локус (UCSC)

Хр. 1: 77.7 – 77.76 Mb

Хр. 3: 152.05 – 152.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP33 (англ. Ubiquitin specific peptidase 33) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 942 амінокислот, а молекулярна маса — 106 727^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGSNSHITI	LTLKVLPHFE	SLGKQEKIPN	KMSAFRNHCP	HLDSVGEITK
EDLIQKSLGT	CQDCKVQGPN	LWACLENRCS	YVGCGESQVD	HSTIHSQETK
HYLTVNLTTL	RVWCYACSKE	VFLDRKLGTQ	PSLPHVRQPH	QIQENSVQDF
KIPSNTTLKT	PLVAVFDDLD	IEADEEDELR	ARGLTGLKNI	GNTCYMNAAL
QALSNCPPLT	QFFLDCGGLA	RTDKKPAICK	SYLKLMTELW	HKSRPGSVVP
TTLFQGIKTV	NPTFRGYSQQ	DAQEFLRCLM	DLLHEELKEQ	VMEVEEDPQT
ITTEETMEED	KSQSDVDFQS	CESCSNSDRA	ENENGSRCFS	EDNNETTMLI
QDDENNSEMS	KDWQKEKMCN	KINKVNSEGE	FDKDRDSISE	TVDLNNQETV
KVQIHSRASE	YITDVHSNDL	STPQILPSNE	GVNPRLSASP	PKSGNLWPGL
APPHKKAQSA	SPKRKKQHKK	YRSVISDIFD	GTIISSVQCL	TCDRVSVTLE
TFQDLSLPIP	GKEDLAKLHS	SSHPTSIVKA	GSCGEAYAPQ	GWIAFFMEYV
KRFVVSCVPS	WFWGPVVTLQ	DCLAAFFARD	ELKGDNMYSC	EKCKKLRNGV
KFCKVQNFPE	ILCIHLKRFR	HELMFSTKIS	THVSFPLEGL	DLQPFLAKDS
PAQIVTYDLL	SVICHHGTAS	SGHYIAYCRN	NLNNLWYEFD	DQSVTEVSES
TVQNAEAYVL	FYRKSSEEAQ	KERRRISNLL	NIMEPSLLQF	YISRQWLNKF
KTFAEPGPIS	NNDFLCIHGG	VPPRKAGYIE	DLVLMLPQNI	WDNLYSRYGG
GPAVNHLYIC	HTCQIEAEKI	EKRRKTELEI	FIRLNRAFQK	EDSPATFYCI
SMQWFREWES	FVKGKDGDPP	GPIDNTKIAV	TKCGNVMLRQ	GADSGQISEE
TWNFLQSIYG	GGPEVILRPP	VVHVDPDILQ	AEEKIEVETR	SL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ендоцитоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jeong J.Y., Wang Y., Sytkowski A.J. (2009). Human selenium binding protein-1 (hSP56) interacts with VDU1 in a selenium-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 379: 583—588. PMID 19118533 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.12.110
Berthouze M., Venkataramanan V., Li Y., Shenoy S.K. (2009). The deubiquitinases USP33 and USP20 coordinate beta2 adrenergic receptor recycling and resensitization. EMBO J. 28: 1684—1696. PMID 19424180 DOI:10.1038/emboj.2009.128
Thorne C., Eccles R.L., Coulson J.M., Urbe S., Clague M.J. (2011). Isoform-specific localization of the deubiquitinase USP33 to the Golgi apparatus. Traffic. 12: 1563—1574. PMID 21801292 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01261.x
Allen M.D., Bycroft M. (2007). The solution structure of the ZnF UBP domain of USP33/VDU1. Protein Sci. 16: 2072—2075. PMID 17766394 DOI:10.1110/ps.072967807

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20059 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TEY7 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.