USP34 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP34, ubiquitin specific peptidase 34 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615295 MGI: 109473 HomoloGene: 40978 GeneCards: USP34 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein K48-linked deubiquitination • Wnt signaling pathway • protein deubiquitination • regulation of protein stability |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 61.19 – 61.47 Mb | Хр. 11: 23.26 – 23.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP34 (англ. Ubiquitin specific peptidase 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 546 амінокислот, а молекулярна маса — 404 233[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCENCADLVE | | VLNEISDVEG | | GDGLQLRKEH | | TLKIFTYINS | | WTQRQCLCCF |
KEYKHLEIFN | | QVVCALINLV | | IAQVQVLRDQ | | LCKHCTTINI | | DSTWQDESNQ |
AEEPLNIDRE | | CNEGSTERQK | | SIEKKSNSTR | | ICNLTEEESS | | KSSDPFSLWS |
TDEKEKLLLC | | VAKIFQIQFP | | LYTAYKHNTH | | PTIEDISTQE | | SNILGAFCDM |
NDVEVPLHLL | | RYVCLFCGKN | | GLSLMKDCFE | | YGTPETLPFL | | IAHAFITVVS |
NIRIWLHIPA | | VMQHIIPFRT | | YVIRYLCKLS | | DQELRQSAAR | | NMADLMWSTV |
KEPLDTTLCF | | DKESLDLAFK | | YFMSPTLTMR | | LAGLSQITNQ | | LHTFNDVCNN |
ESLVSDTETS | | IAKELADWLI | | SNNVVEHIFG | | PNLHIEIIKQ | | CQVILNFLAA |
EGRLSTQHID | | CIWAAAQLKH | | CSRYIHDLFP | | SLIKNLDPVP | | LRHLLNLVSA |
LEPSVHTEQT | | LYLASMLIKA | | LWNNALAAKA | | QLSKQSSFAS | | LLNTNIPIGN |
KKEEEELRRT | | APSPWSPAAS | | PQSSDNSDTH | | QSGGSDIEMD | | EQLINRTKHV |
QQRLSDTEES | | MQGSSDETAN | | SGEDGSSGPG | | SSSGHSDGSS | | NEVNSSHASQ |
SAGSPGSEVQ | | SEDIADIEAL | | KEEDEDDDHG | | HNPPKSSCGT | | DLRNRKLESQ |
AGICLGDSQG | | MSERNGTSSG | | TGKDLVFNTE | | SLPSVDNRMR | | MLDACSHSED |
PEHDISGEMN | | ATHIAQGSQE | | SCITRTGDFL | | GETIGNELFN | | CRQFIGPQHH |
HHHHHHHHHH | | DGHMVDDMLS | | ADDVSCSSSQ | | VSAKSEKNMA | | DFDGEESGCE |
EELVQINSHA | | ELTSHLQQHL | | PNLASIYHEH | | LSQGPVVHKH | | QFNSNAVTDI |
NLDNVCKKGN | | TLLWDIVQDE | | DAVNLSEGLI | | NEAEKLLCSL | | VCWFTDRQIR |
MRFIEGCLEN | | LGNNRSVVIS | | LRLLPKLFGT | | FQQFGSSYDT | | HWITMWAEKE |
LNMMKLFFDN | | LVYYIQTVRE | | GRQKHALYSH | | SAEVQVRLQF | | LTCVFSTLGS |
PDHFRLSLEQ | | VDILWHCLVE | | DSECYDDALH | | WFLNQVRSKD | | QHAMGMETYK |
HLFLEKMPQL | | KPETISMTGL | | NLFQHLCNLA | | RLATSAYDGC | | SNSELCGMDQ |
FWGIALRAQS | | GDVSRAAIQY | | INSYYINGKT | | GLEKEQEFIS | | KCMESLMIAS |
SSLEQESHSS | | LMVIERGLLM | | LKTHLEAFRR | | RFAYHLRQWQ | | IEGTGISSHL |
KALSDKQSLP | | LRVVCQPAGL | | PDKMTIEMYP | | SDQVADLRAE | | VTHWYENLQK |
EQINQQAQLQ | | EFGQSNRKGE | | FPGGLMGPVR | | MISSGHELTT | | DYDEKALHEL |
GFKDMQMVFV | | SLGAPRRERK | | GEGVQLPASC | | LPPPQKDNIP | | MLLLLQEPHL |
TTLFDLLEML | | ASFKPPSGKV | | AVDDSESLRC | | EELHLHAENL | | SRRVWELLML |
LPTCPNMLMA | | FQNISDEQSN | | DGFNWKELLK | | IKSAHKLLYA | | LEIIEALGKP |
NRRIRRESTG | | SYSDLYPDSD | | DSSEDQVENS | | KNSWSCKFVA | | AGGLQQLLEI |
FNSGILEPKE | | QESWTVWQLD | | CLACLLKLIC | | QFAVDPSDLD | | LAYHDVFAWS |
GIAESHRKRT | | WPGKSRKAAG | | DHAKGLHIPR | | LTEVFLVLVQ | | GTSLIQRLMS |
VAYTYDNLAP | | RVLKAQSDHR | | SRHEVSHYSM | | WLLVSWAHCC | | SLVKSSLADS |
DHLQDWLKKL | | TLLIPETAVR | | HESCSGLYKL | | SLSGLDGGDS | | INRSFLLLAA |
STLLKFLPDA | | QALKPIRIDD | | YEEEPILKPG | | CKEYFWLLCK | | LVDNIHIKDA |
SQTTLLDLDA | | LARHLADCIR | | SREILDHQDG | | NVEDDGLTGL | | LRLATSVVKH |
KPPFKFSREG | | QEFLRDIFNL | | LFLLPSLKDR | | QQPKCKSHSS | | RAAAYDLLVE |
MVKGSVENYR | | LIHNWVMAQH | | MQSHAPYKWD | | YWPHEDVRAE | | CRFVGLTNLG |
ATCYLASTIQ | | QLYMIPEARQ | | AVFTAKYSED | | MKHKTTLLEL | | QKMFTYLMES |
ECKAYNPRPF | | CKTYTMDKQP | | LNTGEQKDMT | | EFFTDLITKI | | EEMSPELKNT |
VKSLFGGVIT | | NNVVSLDCEH | | VSQTAEEFYT | | VRCQVADMKN | | IYESLDEVTI |
KDTLEGDNMY | | TCSHCGKKVR | | AEKRACFKKL | | PRILSFNTMR | | YTFNMVTMMK |
EKVNTHFSFP | | LRLDMTPYTE | | DFLMGKSERK | | EGFKEVSDHS | | KDSESYEYDL |
IGVTVHTGTA | | DGGHYYSFIR | | DIVNPHAYKN | | NKWYLFNDAE | | VKPFDSAQLA |
SECFGGEMTT | | KTYDSVTDKF | | MDFSFEKTHS | | AYMLFYKRME | | PEEENGREYK |
FDVSSELLEW | | IWHDNMQFLQ | | DKNIFEHTYF | | GFMWQLCSCI | | PSTLPDPKAV |
SLMTAKLSTS | | FVLETFIHSK | | EKPTMLQWIE | | LLTKQFNNSQ | | AACEWFLDRM |
ADDDWWPMQI | | LIKCPNQIVR | | QMFQRLCIHV | | IQRLRPVHAH | | LYLQPGMEDG |
SDDMDTSVED | | IGGRSCVTRF | | VRTLLLIMEH | | GVKPHSKHLT | | EYFAFLYEFA |
KMGEEESQFL | | LSLQAISTMV | | HFYMGTKGPE | | NPQVEVLSEE | | EGEEEEEEED |
ILSLAEEKYR | | PAALEKMIAL | | VALLVEQSRS | | ERHLTLSQTD | | MAALTGGKGF |
PFLFQHIRDG | | INIRQTCNLI | | FSLCRYNNRL | | AEHIVSMLFT | | SIAKLTPEAA |
NPFFKLLTML | | MEFAGGPPGM | | PPFASYILQR | | IWEVIEYNPS | | QCLDWLAVQT |
PRNKLAHSWV | | LQNMENWVER | | FLLAHNYPRV | | RTSAAYLLVS | | LIPSNSFRQM |
FRSTRSLHIP | | TRDLPLSPDT | | TVVLHQVYNV | | LLGLLSRAKL | | YVDAAVHGTT |
KLVPYFSFMT | | YCLISKTEKL | | MFSTYFMDLW | | NLFQPKLSEP | | AIATNHNKQA |
LLSFWYNVCA | | DCPENIRLIV | | QNPVVTKNIA | | FNYILADHDD | | QDVVLFNRGM |
LPAYYGILRL | | CCEQSPAFTR | | QLASHQNIQW | | AFKNLTPHAS | | QYPGAVEELF |
NLMQLFIAQR | | PDMREEELED | | IKQFKKTTIS | | CYLRCLDGRS | | CWTTLISAFR |
ILLESDEDRL | | LVVFNRGLIL | | MTESFNTLHM | | MYHEATACHV | | TGDLVELLSI |
FLSVLKSTRP | | YLQRKDVKQA | | LIQWQERIEF | | AHKLLTLLNS | | YSPPELRNAC |
IDVLKELVLL | | SPHDFLHTLV | | PFLQHNHCTY | | HHSNIPMSLG | | PYFPCRENIK |
LIGGKSNIRP | | PRPELNMCLL | | PTMVETSKGK | | DDVYDRMLLD | | YFFSYHQFIH |
LLCRVAINCE | | KFTETLVKLS | | VLVAYEGLPL | | HLALFPKLWT | | ELCQTQSAMS |
KNCIKLLCED | | PVFAEYIKCI | | LMDERTFLNN | | NIVYTFMTHF | | LLKVQSQVFS |
EANCANLIST | | LITNLISQYQ | | NLQSDFSNRV | | EISKASASLN | | GDLRALALLL |
SVHTPKQLNP | | ALIPTLQELL | | SKCRTCLQQR | | NSLQEQEAKE | | RKTKDDEGAT |
PIKRRRVSSD | | EEHTVDSCIS | | DMKTETREVL | | TPTSTSDNET | | RDSSIIDPGT |
EQDLPSPENS | | SVKEYRMEVP | | SSFSEDMSNI | | RSQHAEEQSN | | NGRYDDCKEF |
KDLHCSKDST | | LAEEESEFPS | | TSISAVLSDL | | ADLRSCDGQA | | LPSQDPEVAL |
SLSCGHSRGL | | FSHMQQHDIL | | DTLCRTIEST | | IHVVTRISGK | | GNQAAS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20066 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q70CQ2 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |