USP36

Ідентифікатори

Символи

USP36, DUB1, ubiquitin specific peptidase 36

Зовнішні ІД

OMIM: 612543 MGI: 1919594 HomoloGene: 11828 GeneCards: USP36

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • nuclear speck
Біологічний процес	• protein deubiquitination • regulation of autophagy of mitochondrion • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57602


72344

Ensembl


ENSG00000055483


ENSMUSG00000033909

UniProt


Q9P275


B1AQJ2

RefSeq (мРНК)


NM_025090 NM_001321291


NM_001033528

RefSeq (білок)


NP_001308220


NP_001028700

Локус (UCSC)

Хр. 17: 78.79 – 78.84 Mb

Хр. 11: 118.15 – 118.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP36 (англ. Ubiquitin specific peptidase 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 121 амінокислот, а молекулярна маса — 122 652^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPIVDKLKEA	LKPGRKDSAD	DGELGKLLAS	SAKKVLLQKI	EFEPASKSFS
YQLEALKSKY	VLLNPKTEGA	SRHKSGDDPP	ARRQGSEHTY	ESCGDGVPAP
QKVLFPTERL	SLRWERVFRV	GAGLHNLGNT	CFLNATIQCL	TYTPPLANYL
LSKEHARSCH	QGSFCMLCVM	QNHIVQAFAN	SGNAIKPVSF	IRDLKKIARH
FRFGNQEDAH	EFLRYTIDAM	QKACLNGCAK	LDRQTQATTL	VHQIFGGYLR
SRVKCSVCKS	VSDTYDPYLD	VALEIRQAAN	IVRALELFVK	ADVLSGENAY
MCAKCKKKVP	ASKRFTIHRT	SNVLTLSLKR	FANFSGGKIT	KDVGYPEFLN
IRPYMSQNNG	DPVMYGLYAV	LVHSGYSCHA	GHYYCYVKAS	NGQWYQMNDS
LVHSSNVKVV	LNQQAYVLFY	LRIPGSKKSP	EGLISRTGSS	SLPGRPSVIP
DHSKKNIGNG	IISSPLTGKR	QDSGTMKKPH	TTEEIGVPIS	RNGSTLGLKS
QNGCIPPKLP	SGSPSPKLSQ	TPTHMPTILD	DPGKKVKKPA	PPQHFSPRTA
QGLPGTSNSN	SSRSGSQRQG	SWDSRDVVLS	TSPKLLATAT	ANGHGLKGND
ESAGLDRRGS	SSSSPEHSAS	SDSTKAPQTP	RSGAAHLCDS	QETNCSTAGH
SKTPPSGADS	KTVKLKSPVL	SNTTTEPAST	MSPPPAKKLA	LSAKKASTLW
RATGNDLRPP	PPSPSSDLTH	PMKTSHPVVA	STWPVHRARA	VSPAPQSSSR
LQPPFSPHPT	LLSSTPKPPG	TSEPRSCSSI	STALPQVNED	LVSLPHQLPE
ASEPPQSPSE	KRKKTFVGEP	QRLGSETRLP	QHIREATAAP	HGKRKRKKKK
RPEDTAASAL	QEGQTQRQPG	SPMYRREGQA	QLPAVRRQED	GTQPQVNGQQ
VGCVTDGHHA	SSRKRRRKGA	EGLGEEGGLH	QDPLRHSCSP	MGDGDPEAME
ESPRKKKKRK	QETQRAVEED	GHLKCPRSAK	PQDAVVPESS	SCAPSANGWC
PGDRMGLSQA	PPVSWNGERE	SDVVQELLKY	SSDKAYGRKV	LTWDGKMSAV
SQDAIEDSRQ	ARTETVVDDW	DEEFDRGKEK	KIKKFKREKR	RNFNAFQKLQ
TRRNFWSVTH	PAKAASLSYR	R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20062 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9P275 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.