USP9X |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP9X, DFFRX, FAF, FAM, MRX99, MRXS99F, ubiquitin specific peptidase 9, X-linked, ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, XLID99 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300072 MGI: 894681 HomoloGene: 3418 GeneCards: USP9X |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
non-syndromic X-linked intellectual disability[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cysteine-type peptidase activity • co-SMAD binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:1904265 deubiquitinase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • мембрана • growth cone |
---|
Біологічний процес | • female gamete generation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • chromosome segregation • neuron migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • протеоліз • поділ клітини • axon extension • клітинний цикл • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • protein targeting to peroxisome • regulation of circadian rhythm • ритмічний процес • protein stabilization • protein K48-linked deubiquitination • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of DNA demethylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001039590 NM_001039591 NM_004652 NM_021906 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 41.09 – 41.24 Mb | Хр. X: 12.94 – 13.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP9X (англ. Ubiquitin specific peptidase 9, X-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 570 амінокислот, а молекулярна маса — 292 280[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTATTRGSPV | | GGNDNQGQAP | | DGQSQPPLQQ | | NQTSSPDSSN | | ENSPATPPDE |
QGQGDAPPQL | | EDEEPAFPHT | | DLAKLDDMIN | | RPRWVVPVLP | | KGELEVLLEA |
AIDLSKKGLD | | VKSEACQRFF | | RDGLTISFTK | | ILTDEAVSGW | | KFEIHRCIIN |
NTHRLVELCV | | AKLSQDWFPL | | LELLAMALNP | | HCKFHIYNGT | | RPCESVSSSV |
QLPEDELFAR | | SPDPRSPKGW | | LVDLLNKFGT | | LNGFQILHDR | | FINGSALNVQ |
IIAALIKPFG | | QCYEFLTLHT | | VKKYFLPIIE | | MVPQFLENLT | | DEELKKEAKN |
EAKNDALSMI | | IKSLKNLASR | | VPGQEETVKN | | LEIFRLKMIL | | RLLQISSFNG |
KMNALNEVNK | | VISSVSYYTH | | RHGNPEEEEW | | LTAERMAEWI | | QQNNILSIVL |
RDSLHQPQYV | | EKLEKILRFV | | IKEKALTLQD | | LDNIWAAQAG | | KHEAIVKNVH |
DLLAKLAWDF | | SPEQLDHLFD | | CFKASWTNAS | | KKQREKLLEL | | IRRLAEDDKD |
GVMAHKVLNL | | LWNLAHSDDV | | PVDIMDLALS | | AHIKILDYSC | | SQDRDTQKIQ |
WIDRFIEELR | | TNDKWVIPAL | | KQIREICSLF | | GEAPQNLSQT | | QRSPHVFYRH |
DLINQLQHNH | | ALVTLVAENL | | ATYMESMRLY | | ARDHEDYDPQ | | TVRLGSRYSH |
VQEVQERLNF | | LRFLLKDGQL | | WLCAPQAKQI | | WKCLAENAVY | | LCDREACFKW |
YSKLMGDEPD | | LDPDINKDFF | | ESNVLQLDPS | | LLTENGMKCF | | ERFFKAVNCR |
EGKLVAKRRA | | YMMDDLELIG | | LDYLWRVVIQ | | SNDDIASRAI | | DLLKEIYTNL |
GPRLQVNQVV | | IHEDFIQSCF | | DRLKASYDTL | | CVLDGDKDSV | | NCARQEAVRM |
VRVLTVLREY | | INECDSDYHE | | ERTILPMSRA | | FRGKHLSFVV | | RFPNQGRQVD |
DLEVWSHTND | | TIGSVRRCIL | | NRIKANVAHT | | KIELFVGGEL | | IDPADDRKLI |
GQLNLKDKSL | | ITAKLTQISS | | NMPSSPDSSS | | DSSTGSPGNH | | GNHYSDGPNP |
EVESCLPGVI | | MSLHPRYISF | | LWQVADLGSS | | LNMPPLRDGA | | RVLMKLMPPD |
STTIEKLRAI | | CLDHAKLGES | | SLSPSLDSLF | | FGPSASQVLY | | LTEVVYALLM |
PAGAPLADDS | | SDFQFHFLKS | | GGLPLVLSML | | TRNNFLPNAD | | METRRGAYLN |
ALKIAKLLLT | | AIGYGHVRAV | | AEACQPGVEG | | VNPMTQINQV | | THDQAVVLQS |
ALQSIPNPSS | | ECMLRNVSVR | | LAQQISDEAS | | RYMPDICVIR | | AIQKIIWASG |
CGSLQLVFSP | | NEEITKIYEK | | TNAGNEPDLE | | DEQVCCEALE | | VMTLCFALIP |
TALDALSKEK | | AWQTFIIDLL | | LHCHSKTVRQ | | VAQEQFFLMC | | TRCCMGHRPL |
LFFITLLFTV | | LGSTARERAK | | HSGDYFTLLR | | HLLNYAYNSN | | INVPNAEVLL |
NNEIDWLKRI | | RDDVKRTGET | | GIEETILEGH | | LGVTKELLAF | | QTSEKKFHIG |
CEKGGANLIK | | ELIDDFIFPA | | SNVYLQYMRN | | GELPAEQAIP | | VCGSPPTINA |
GFELLVALAV | | GCVRNLKQIV | | DSLTEMYYIG | | TAITTCEALT | | EWEYLPPVGP |
RPPKGFVGLK | | NAGATCYMNS | | VIQQLYMIPS | | IRNGILAIEG | | TGSDVDDDMS |
GDEKQDNESN | | VDPRDDVFGY | | PQQFEDKPAL | | SKTEDRKEYN | | IGVLRHLQVI |
FGHLAASRLQ | | YYVPRGFWKQ | | FRLWGEPVNL | | REQHDALEFF | | NSLVDSLDEA |
LKALGHPAML | | SKVLGGSFAD | | QKICQGCPHR | | YECEESFTTL | | NVDIRNHQNL |
LDSLEQYVKG | | DLLEGANAYH | | CEKCNKKVDT | | VKRLLIKKLP | | PVLAIQLKRF |
DYDWERECAI | | KFNDYFEFPR | | ELDMEPYTVA | | GVAKLEGDNV | | NPESQLIQQS |
EQSESETAGS | | TKYRLVGVLV | | HSGQASGGHY | | YSYIIQRNGG | | DGERNRWYKF |
DDGDVTECKM | | DDDEEMKNQC | | FGGEYMGEVF | | DHMMKRMSYR | | RQKRWWNAYI |
LFYERMDTID | | QDDELIRYIS | | ELAITTRPHQ | | IIMPSAIERS | | VRKQNVQFMH |
NRMQYSMEYF | | QFMKKLLTCN | | GVYLNPPPGQ | | DHLLPEAEEI | | TMISIQLAAR |
FLFTTGFHTK | | KVVRGSASDW | | YDALCILLRH | | SKNVRFWFAH | | NVLFNVSNRF |
SEYLLECPSA | | EVRGAFAKLI | | VFIAHFSLQD | | GPCPSPFASP | | GPSSQAYDNL |
SLSDHLLRAV | | LNLLRREVSE | | HGRHLQQYFN | | LFVMYANLGV | | AEKTQLLKLS |
VPATFMLVSL | | DEGPGPPIKY | | QYAELGKLYS | | VVSQLIRCCN | | VSSRMQSSIN |
GNPPLPNPFG | | DPNLSQPIMP | | IQQNVADILF | | VRTSYVKKII | | EDCSNSEETV |
KLLRFCCWEN | | PQFSSTVLSE | | LLWQVAYSYT | | YELRPYLDLL | | LQILLIEDSW |
QTHRIHNALK | | GIPDDRDGLF | | DTIQRSKNHY | | QKRAYQCIKC | | MVALFSNCPV |
AYQILQGNGD | | LKRKWTWAVE | | WLGDELERRP | | YTGNPQYTYN | | NWSPPVQSNE |
TSNGYFLERS | | HSARMTLAKA | | CELCPEEVKK | | ATSVQQIEME | | ESKEPDDQDA |
PDEHESPPPE | | DAPLYPHSPG | | SQYQQNNHVH | | GQPYTGPAAH | | HMNNPQRTGQ |
RAQENYEGSE | | EVSPPQTKDQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, убіквітинування білків, розходження хромосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.
Література
- Vong Q.P., Cao K., Li H.Y., Iglesias P.A., Zheng Y. (2005). Chromosome alignment and segregation regulated by ubiquitination of survivin. Science. 310: 1499—1504. PMID 16322459 DOI:10.1126/science.1120160
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з USP9X переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12632 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q93008 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |