VAMP8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4WY4

Ідентифікатори

Символи

VAMP8, EDB, VAMP-8, vesicle associated membrane protein 8

Зовнішні ІД

OMIM: 603177 MGI: 1336882 HomoloGene: 37846 GeneCards: VAMP8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel inhibitor activity • SNARE binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • везикула • гіалоплазма • ендосома • early endosome membrane • мембрана • secretory granule membrane • late endosome membrane • клітинна мембрана • mucin granule • lysosomal membrane • SNARE complex • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • екзосома • clathrin-coated vesicle membrane • phagocytic vesicle membrane • azurophil granule membrane • specific granule membrane • recycling endosome membrane • tertiary granule membrane • Синаптичні бульбашки
Біологічний процес	• post-Golgi vesicle-mediated transport • автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • negative regulation of secretion by cell • protein transport • viral entry into host cell • vesicle fusion • eosinophil degranulation • vesicle-mediated transport • mucus secretion • regulation of protein localization to plasma membrane • positive regulation of histamine secretion by mast cell • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • autophagosome membrane docking • neutrophil degranulation • membrane organization • regulation of molecular function • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8673


22320

Ensembl


ENSG00000118640


ENSMUSG00000050732

UniProt


Q9BV40


O70404

RefSeq (мРНК)


NM_003761


NM_016794

RefSeq (білок)


NP_003752


NP_058074

Локус (UCSC)

Хр. 2: 85.56 – 85.58 Mb

Хр. 6: 72.36 – 72.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VAMP8 (англ. Vesicle associated membrane protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 11 438^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEASEGGGN	DRVRNLQSEV	EGVKNIMTQN	VERILARGEN	LEHLRNKTED
LEATSEHFKT	TSQKVARKFW	WKNVKMIVLI	CVIVFIIILF	IVLFATGAFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

W: Триптофан

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетиляція. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Polgar J., Chung S.H., Reed G.L. (2002). Vesicle-associated membrane protein 3 (VAMP-3) and VAMP-8 are present in human platelets and are required for granule secretion. Blood. 100: 1081—1083. PMID 12130530 DOI:10.1182/blood.V100.3.1081
Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12647 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BV40 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.