VCAN |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VCAN, CSPG2, ERVR, GHAP, PG-M, WGN, WGN1, versican |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 118661 MGI: 102889 HomoloGene: 3228 GeneCards: VCAN |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Wagner's disease[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • extracellular matrix structural constituent • hyaluronic acid binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • lysosomal lumen • Golgi lumen • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • glycosaminoglycan metabolic process • skeletal system development • cell recognition • chondroitin sulfate biosynthetic process • extracellular matrix organization • multicellular organism development • central nervous system development • адгезія клітин • osteoblast differentiation • chondroitin sulfate catabolic process • dermatan sulfate biosynthetic process • glial cell migration • посттрансляційна модифікація |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3e/PBB_GE_VCAN_204620_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_VCAN_204620_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/PBB_GE_VCAN_204619_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_VCAN_204619_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/83/PBB_GE_VCAN_211571_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_VCAN_211571_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004385 NM_001126336 NM_001164097 NM_001164098 |
| | NM_001081249 NM_001134474 NM_001134475 NM_019389 NM_172955 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001119808 NP_001157569 NP_001157570 NP_004376 NP_001119808.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 83.47 – 83.58 Mb | Хр. 13: 89.8 – 89.89 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VCAN (англ. Versican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 396 амінокислот, а молекулярна маса — 372 820[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFINIKSILW | | MCSTLIVTHA | | LHKVKVGKSP | | PVRGSLSGKV | | SLPCHFSTMP |
TLPPSYNTSE | | FLRIKWSKIE | | VDKNGKDLKE | | TTVLVAQNGN | | IKIGQDYKGR |
VSVPTHPEAV | | GDASLTVVKL | | LASDAGLYRC | | DVMYGIEDTQ | | DTVSLTVDGV |
VFHYRAATSR | | YTLNFEAAQK | | ACLDVGAVIA | | TPEQLFAAYE | | DGFEQCDAGW |
LADQTVRYPI | | RAPRVGCYGD | | KMGKAGVRTY | | GFRSPQETYD | | VYCYVDHLDG |
DVFHLTVPSK | | FTFEEAAKEC | | ENQDARLATV | | GELQAAWRNG | | FDQCDYGWLS |
DASVRHPVTV | | ARAQCGGGLL | | GVRTLYRFEN | | QTGFPPPDSR | | FDAYCFKPKE |
ATTIDLSILA | | ETASPSLSKE | | PQMVSDRTTP | | IIPLVDELPV | | IPTEFPPVGN |
IVSFEQKATV | | QPQAITDSLA | | TKLPTPTGST | | KKPWDMDDYS | | PSASGPLGKL |
DISEIKEEVL | | QSTTGVSHYA | | TDSWDGVVED | | KQTQESVTQI | | EQIEVGPLVT |
SMEILKHIPS | | KEFPVTETPL | | VTARMILESK | | TEKKMVSTVS | | ELVTTGHYGF |
TLGEEDDEDR | | TLTVGSDEST | | LIFDQIPEVI | | TVSKTSEDTI | | HTHLEDLESV |
SASTTVSPLI | | MPDNNGSSMD | | DWEERQTSGR | | ITEEFLGKYL | | STTPFPSQHR |
TEIELFPYSG | | DKILVEGIST | | VIYPSLQTEM | | THRRERTETL | | IPEMRTDTYT |
DEIQEEITKS | | PFMGKTEEEV | | FSGMKLSTSL | | SEPIHVTESS | | VEMTKSFDFP |
TLITKLSAEP | | TEVRDMEEDF | | TATPGTTKYD | | ENITTVLLAH | | GTLSVEAATV |
SKWSWDEDNT | | TSKPLESTEP | | SASSKLPPAL | | LTTVGMNGKD | | KDIPSFTEDG |
ADEFTLIPDS | | TQKQLEEVTD | | EDIAAHGKFT | | IRFQPTTSTG | | IAEKSTLRDS |
TTEEKVPPIT | | STEGQVYATM | | EGSALGEVED | | VDLSKPVSTV | | PQFAHTSEVE |
GLAFVSYSST | | QEPTTYVDSS | | HTIPLSVIPK | | TDWGVLVPSV | | PSEDEVLGEP |
SQDILVIDQT | | RLEATISPET | | MRTTKITEGT | | TQEEFPWKEQ | | TAEKPVPALS |
STAWTPKEAV | | TPLDEQEGDG | | SAYTVSEDEL | | LTGSERVPVL | | ETTPVGKIDH |
SVSYPPGAVT | | EHKVKTDEVV | | TLTPRIGPKV | | SLSPGPEQKY | | ETEGSSTTGF |
TSSLSPFSTH | | ITQLMEETTT | | EKTSLEDIDL | | GSGLFEKPKA | | TELIEFSTIK |
VTVPSDITTA | | FSSVDRLHTT | | SAFKPSSAIT | | KKPPLIDREP | | GEETTSDMVI |
IGESTSHVPP | | TTLEDIVAKE | | TETDIDREYF | | TTSSPPATQP | | TRPPTVEDKE |
AFGPQALSTP | | QPPASTKFHP | | DINVYIIEVR | | ENKTGRMSDL | | SVIGHPIDSE |
SKEDEPCSEE | | TDPVHDLMAE | | ILPEFPDIIE | | IDLYHSEENE | | EEEEECANAT |
DVTTTPSVQY | | INGKHLVTTV | | PKDPEAAEAR | | RGQFESVAPS | | QNFSDSSESD |
THPFVIAKTE | | LSTAVQPNES | | TETTESLEVT | | WKPETYPETS | | EHFSGGEPDV |
FPTVPFHEEF | | ESGTAKKGAE | | SVTERDTEVG | | HQAHEHTEPV | | SLFPEESSGE |
IAIDQESQKI | | AFARATEVTF | | GEEVEKSTSV | | TYTPTIVPSS | | ASAYVSEEEA |
VTLIGNPWPD | | DLLSTKESWV | | EATPRQVVEL | | SGSSSIPITE | | GSGEAEEDED |
TMFTMVTDLS | | QRNTTDTLIT | | LDTSRIITES | | FFEVPATTIY | | PVSEQPSAKV |
VPTKFVSETD | | TSEWISSTTV | | EEKKRKEEEG | | TTGTASTFEV | | YSSTQRSDQL |
ILPFELESPN | | VATSSDSGTR | | KSFMSLTTPT | | QSEREMTDST | | PVFTETNTLE |
NLGAQTTEHS | | SIHQPGVQEG | | LTTLPRSPAS | | VFMEQGSGEA | | AADPETTTVS |
SFSLNVEYAI | | QAEKEVAGTL | | SPHVETTFST | | EPTGLVLSTV | | MDRVVAENIT |
QTSREIVISE | | RLGEPNYGAE | | IRGFSTGFPL | | EEDFSGDFRE | | YSTVSHPIAK |
EETVMMEGSG | | DAAFRDTQTS | | PSTVPTSVHI | | SHISDSEGPS | | STMVSTSAFP |
WEEFTSSAEG | | SGEQLVTVSS | | SVVPVLPSAV | | QKFSGTASSI | | IDEGLGEVGT |
VNEIDRRSTI | | LPTAEVEGTK | | APVEKEEVKV | | SGTVSTNFPQ | | TIEPAKLWSR |
QEVNPVRQEI | | ESETTSEEQI | | QEEKSFESPQ | | NSPATEQTIF | | DSQTFTETEL |
KTTDYSVLTT | | KKTYSDDKEM | | KEEDTSLVNM | | STPDPDANGL | | ESYTTLPEAT |
EKSHFFLATA | | LVTESIPAEH | | VVTDSPIKKE | | ESTKHFPKGM | | RPTIQESDTE |
LLFSGLGSGE | | EVLPTLPTES | | VNFTEVEQIN | | NTLYPHTSQV | | ESTSSDKIED |
FNRMENVAKE | | VGPLVSQTDI | | FEGSGSVTST | | TLIEILSDTG | | AEGPTVAPLP |
FSTDIGHPQN | | QTVRWAEEIQ | | TSRPQTITEQ | | DSNKNSSTAE | | INETTTSSTD |
FLARAYGFEM | | AKEFVTSAPK | | PSDLYYEPSG | | EGSGEVDIVD | | SFHTSATTQA |
TRQESSTTFV | | SDGSLEKHPE | | VPSAKAVTAD | | GFPTVSVMLP | | LHSEQNKSSP |
DPTSTLSNTV | | SYERSTDGSF | | QDRFREFEDS | | TLKPNRKKPT | | ENIIIDLDKE |
DKDLILTITE | | STILEILPEL | | TSDKNTIIDI | | DHTKPVYEDI | | LGMQTDIDTE |
VPSEPHDSND | | ESNDDSTQVQ | | EIYEAAVNLS | | LTEETFEGSA | | DVLASYTQAT |
HDESMTYEDR | | SQLDHMGFHF | | TTGIPAPSTE | | TELDVLLPTA | | TSLPIPRKSA |
TVIPEIEGIK | | AEAKALDDMF | | ESSTLSDGQA | | IADQSEIIPT | | LGQFERTQEE |
YEDKKHAGPS | | FQPEFSSGAE | | EALVDHTPYL | | SIATTHLMDQ | | SVTEVPDVME |
GSNPPYYTDT | | TLAVSTFAKL | | SSQTPSSPLT | | IYSGSEASGH | | TEIPQPSALP |
GIDVGSSVMS | | PQDSFKEIHV | | NIEATFKPSS | | EEYLHITEPP | | SLSPDTKLEP |
SEDDGKPELL | | EEMEASPTEL | | IAVEGTEILQ | | DFQNKTDGQV | | SGEAIKMFPT |
IKTPEAGTVI | | TTADEIELEG | | ATQWPHSTSA | | SATYGVEAGV | | VPWLSPQTSE |
RPTLSSSPEI | | NPETQAALIR | | GQDSTIAASE | | QQVAARILDS | | NDQATVNPVE |
FNTEVATPPF | | SLLETSNETD | | FLIGINEESV | | EGTAIYLPGP | | DRCKMNPCLN |
GGTCYPTETS | | YVCTCVPGYS | | GDQCELDFDE | | CHSNPCRNGA | | TCVDGFNTFR |
CLCLPSYVGA | | LCEQDTETCD | | YGWHKFQGQC | | YKYFAHRRTW | | DAAERECRLQ |
GAHLTSILSH | | EEQMFVNRVG | | HDYQWIGLND | | KMFEHDFRWT | | DGSTLQYENW |
RPNQPDSFFS | | AGEDCVVIIW | | HENGQWNDVP | | CNYHLTYTCK | | KGTVACGQPP |
VVENAKTFGK | | MKPRYEINSL | | IRYHCKDGFI | | QRHLPTIRCL | | GNGRWAIPKI |
TCMNPSAYQR | | TYSMKYFKNS | | SSAKDNSINT | | SKHDHRWSRR | | WQESRR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Zako M., Shinomura T., Ujita M., Ito K., Kimata K. (1995). Expression of PG-M(V3), an alternatively spliced form of PG-M without a chondroitin sulfate attachment in region in mouse and human tissues. J. Biol. Chem. 270: 3914—3918. PMID 7876137 DOI:10.1074/jbc.270.8.3914
- Yao L.Y., Moody C., Schoenherr E., Wight T.N., Sandell L.J. (1994). Identification of the proteoglycan versican in aorta and smooth muscle cells by DNA sequence analysis, in situ hybridization and immunohistochemistry. Matrix Biol. 14: 213—225. PMID 7921538 DOI:10.1016/0945-053X(94)90185-6
- Iozzo R.V., Naso M.F., Cannizzaro L.A., Wasmuth J.J., McPherson J.D. (1992). Mapping of the versican proteoglycan gene (CSPG2) to the long arm of human chromosome 5 (5q12-5q14). Genomics. 14: 845—851. PMID 1478664 DOI:10.1016/S0888-7543(05)80103-X
- Bignami A., Lane W.S., Andrews D., Dahl D. (1989). Structural similarity of hyaluronate binding proteins in brain and cartilage. Brain Res. Bull. 22: 67—70. PMID 2469524 DOI:10.1016/0361-9230(89)90129-9
- Zimmermann D.R., Ruoslahti E. (1989). Multiple domains of the large fibroblast proteoglycan, versican. EMBO J. 8: 2975—2981. PMID 2583089
- Dours-Zimmermann M.T., Zimmermann D.R. (1994). A novel glycosaminoglycan attachment domain identified in two alternative splice variants of human versican. J. Biol. Chem. 269: 32992—32998. PMID 7806529
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з VCAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2464 (англ.) . Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P13611 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |