VPS28 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS28, ESCRT-I subunit, VPS28 subunit of ESCRT-I |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611952 MGI: 1914164 HomoloGene: 69205 GeneCards: VPS28 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0032403 protein-containing complex binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • клітинна мембрана • early endosome • endosome membrane • екзосома • ESCRT I complex • host cell |
---|
Біологічний процес | • GO:0046795 intracellular transport of virus • positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body assembly • endosomal transport • negative regulation of protein ubiquitination • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000160948 ENSG00000285339 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_057292 NP_898880 NP_057292.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 144.42 – 144.43 Mb | Хр. 15: 76.51 – 76.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS28 (англ. VPS28, ESCRT-I subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 425[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFHGIPATPG | | IGAPGNKPEL | | YEEVKLYKNA | | REREKYDNMA | | ELFAVVKTMQ |
ALEKAYIKDC | | VSPSEYTAAC | | SRLLVQYKAA | | FRQVQGSEIS | | SIDEFCRKFR |
LDCPLAMERI | | KEDRPITIKD | | DKGNLNRCIA | | DVVSLFITVM | | DKLRLEIRAM |
DEIQPDLREL | | METMHRMSHL | | PPDFEGRQTV | | SQWLQTLSGM | | SASDELDDSQ |
VRQMLFDLES | | AYNAFNRFLH | | A |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bishop N., Horman A., Woodman P. (2002). Mammalian class E vps proteins recognize ubiquitin and act in the removal of endosomal protein-ubiquitin conjugates. J. Cell Biol. 157: 91—101. PMID 11916981 DOI:10.1083/jcb.200112080
- Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18178 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UK41 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |