VPS4A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YXR, 2JQ9, 2K3W | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS4A, SKD1, SKD1A, SKD2, VPS4, VPS4-1, vacuolar protein sorting 4 homolog A, CIMDAG |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609982 MGI: 1890520 HomoloGene: 69132 GeneCards: VPS4A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein domain specific binding • microtubule-severing ATPase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ESCRT III complex • гіалоплазма • ендосома • late endosome • центросома • spindle pole • vacuolar membrane • late endosome membrane • Flemming body • мембрана • клітинна мембрана • midbody • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • екзосома • клітинне ядро • endosome membrane |
---|
Біологічний процес | • late endosomal microautophagy • endosomal vesicle fusion • viral release from host cell • Листопад (фенологія) • viral budding via host ESCRT complex • nucleus organization • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body assembly • vacuole organization • vesicle uncoating • regulation of protein localization • поділ клітини • intracellular cholesterol transport • ESCRT complex disassembly • vesicle budding from membrane • ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • GO:0015915 транспорт • protein transport • positive regulation of viral life cycle • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • клітинний цикл • negative regulation of cytokinesis • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • positive regulation of exosomal secretion • vesicle-mediated transport • regulation of protein localization to plasma membrane • ESCRT III complex disassembly • cytoplasmic microtubule organization • endosomal transport • macroautophagy • positive regulation of viral budding via host ESCRT complex • actomyosin contractile ring contraction • protein targeting to lysosome • nuclear envelope organization • nuclear membrane reassembly • mitotic cytokinesis checkpoint signaling • cytoskeleton-dependent cytokinesis • midbody abscission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 69.31 – 69.33 Mb | Хр. 8: 107.76 – 107.77 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS4A (англ. Vacuolar protein sorting 4 homolog A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 48 898[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTSTLQKAI | | DLVTKATEED | | KAKNYEEALR | | LYQHAVEYFL | | HAIKYEAHSD |
KAKESIRAKC | | VQYLDRAEKL | | KDYLRSKEKH | | GKKPVKENQS | | EGKGSDSDSE |
GDNPEKKKLQ | | EQLMGAVVME | | KPNIRWNDVA | | GLEGAKEALK | | EAVILPIKFP |
HLFTGKRTPW | | RGILLFGPPG | | TGKSYLAKAV | | ATEANNSTFF | | SVSSSDLMSK |
WLGESEKLVK | | NLFELARQHK | | PSIIFIDEVD | | SLCGSRNENE | | SEAARRIKTE |
FLVQMQGVGN | | NNDGTLVLGA | | TNIPWVLDSA | | IRRRFEKRIY | | IPLPEEAARA |
QMFRLHLGST | | PHNLTDANIH | | ELARKTEGYS | | GADISIIVRD | | SLMQPVRKVQ |
SATHFKKVCG | | PSRTNPSMMI | | DDLLTPCSPG | | DPGAMEMTWM | | DVPGDKLLEP |
VVCMSDMLRS | | LATTRPTVNA | | DDLLKVKKFS | | EDFGQES |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bishop N., Woodman P. (2000). ATPase-defective mammalian VPS4 localizes to aberrant endosomes and impairs cholesterol trafficking. Mol. Biol. Cell. 11: 227—239. PMID 10637304 DOI:10.1091/mbc.11.1.227
- Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
- Sachse M., Strous G.J., Klumperman J. (2004). ATPase-deficient hVPS4 impairs formation of internal endosomal vesicles and stabilizes bilayered clathrin coats on endosomal vacuoles. J. Cell Sci. 117: 1699—1708. PMID 15075231 DOI:10.1242/jcs.00998
- Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
- Howard T.L., Stauffer D.R., Degnin C.R., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 functions as a member of a newly defined family of vesicle trafficking proteins. J. Cell Sci. 114: 2395—2404. PMID 11559748
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13488 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UN37 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |