WAPL |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4K6J, 5HDT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | WAPL, FOE, KIAA0261, WAPAL, WAPL cohesin release factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610754 MGI: 2675859 HomoloGene: 41002 GeneCards: WAPL |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0000798 cohesin complex • хромосома • Хроматин • synaptonemal complex • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of sister chromatid cohesion • negative regulation of chromatin binding • positive regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of DNA replication • regulation of cohesin loading • поділ клітини • regulation of chromosome segregation • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • protein localization to chromatin • response to toxic substance • mitotic sister chromatid cohesion • regulation of chromosome condensation • meiotic chromosome segregation • GO:0007067 мітоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 86.44 – 86.52 Mb | Хр. 14: 34.4 – 34.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WAPL (англ. WAPL cohesin release factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 190 амінокислот, а молекулярна маса — 132 946[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTSRFGKTYS | | RKGGNGSSKF | | DEVFSNKRTT | | LSTKWGETTF | | MAKLGQKRPN |
FKPDIQEIPK | | KPKVEEESTG | | DPFGFDSDDE | | SLPVSSKNLA | | QVKCSSYSES |
SEAAQLEEVT | | SVLEANSKIS | | HVVVEDTVVS | | DKCFPLEDTL | | LGKEKSTNRI |
VEDDASISSC | | NKLITSDKVE | | NFHEEHEKNS | | HHIHKNADDS | | TKKPNAETTV |
ASEIKETNDT | | WNSQFGKRPE | | SPSEISPIKG | | SVRTGLFEWD | | NDFEDIRSED |
CILSLDSDPL | | LEMKDDDFKN | | RLENLNEAIE | | EDIVQSVLRP | | TNCRTYCRAN |
KTKSSQGASN | | FDKLMDGTSQ | | ALAKANSESS | | KDGLNQAKKG | | GVSCGTSFRG |
TVGRTRDYTV | | LHPSCLSVCN | | VTIQDTMERS | | MDEFTASTPA | | DLGEAGRLRK |
KADIATSKTT | | TRFRPSNTKS | | KKDVKLEFFG | | FEDHETGGDE | | GGSGSSNYKI |
KYFGFDDLSE | | SEDDEDDDCQ | | VERKTSKKRT | | KTAPSPSLQP | | PPESNDNSQD |
SQSGTNNAEN | | LDFTEDLPGV | | PESVKKPINK | | QGDKSKENTR | | KIFSGPKRSP |
TKAVYNARHW | | NHPDSEELPG | | PPVVKPQSVT | | VRLSSKEPNQ | | KDDGVFKAPA |
PPSKVIKTVT | | IPTQPYQDIV | | TALKCRREDK | | ELYTVVQHVK | | HFNDVVEFGE |
NQEFTDDIEY | | LLSGLKSTQP | | LNTRCLSVIS | | LATKCAMPSF | | RMHLRAHGMV |
AMVFKTLDDS | | QHHQNLSLCT | | AALMYILSRD | | RLNMDLDRAS | | LDLMIRLLEL |
EQDASSAKLL | | NEKDMNKIKE | | KIRRLCETVH | | NKHLDLENIT | | TGHLAMETLL |
SLTSKRAGDW | | FKEELRLLGG | | LDHIVDKVKE | | CVDHLSRDED | | EEKLVASLWG |
AERCLRVLES | | VTVHNPENQS | | YLIAYKDSQL | | IVSSAKALQH | | CEELIQQYNR |
AEDSICLADS | | KPLPHQNVTN | | HVGKAVEDCM | | RAIIGVLLNL | | TNDNEWGSTK |
TGEQDGLIGT | | ALNCVLQVPK | | YLPQEQRFDI | | RVLGLGLLIN | | LVEYSARNRH |
CLVNMETSCS | | FDSSICSGEG | | DDSLRIGGQV | | HAVQALVQLF | | LERERAAQLA |
ESKTDELIKD | | APTTQHDKSG | | EWQETSGEIQ | | WVSTEKTDGT | | EEKHKKEEED |
EELDLNKALQ | | HAGKHMEDCI | | VASYTALLLG | | CLCQESPINV | | TTVREYLPEG |
DFSIMTEMLK | | KFLSFMNLTC | | AVGTTGQKSI | | SRVIEYLEHC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Kwiatkowski B.A., Ragoczy T., Ehly J., Schubach W.H. (2004). Identification and cloning of a novel chromatin-associated protein partner of Epstein-Barr nuclear protein 2. Exp. Cell Res. 300: 223—233. PMID 15383329 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.06.028
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gandhi R., Gillespie P.J., Hirano T. (2006). Human Wapl is a cohesin-binding protein that promotes sister-chromatid resolution in mitotic prophase. Curr. Biol. 16: 2406—2417. PMID 17112726 DOI:10.1016/j.cub.2006.10.061
- Shintomi K., Hirano T. (2009). Releasing cohesin from chromosome arms in early mitosis: opposing actions of Wapl-Pds5 and Sgo1. Genes Dev. 23: 2224—2236. PMID 19696148 DOI:10.1101/gad.1844309
- Terret M.E., Sherwood R., Rahman S., Qin J., Jallepalli P.V. (2009). Cohesin acetylation speeds the replication fork. Nature. 462: 231—234. PMID 19907496 DOI:10.1038/nature08550
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23293 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q7Z5K2 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |