WDR33 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | WDR33, NET14, WDC146, WD repeat domain 33 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 618082 MGI: 1921570 HomoloGene: 56807 GeneCards: WDR33 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ішемічна хвороба серця[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • колаген • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • mRNA cleavage • postreplication repair • Сперматогенез • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • mRNA polyadenylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001006622 NM_001006623 NM_018383 |
| | NM_001170966 NM_001170967 NM_001170970 NM_028866 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001006623 NP_001006624 NP_060853 |
| | NP_001164437 NP_001164438 NP_001164441 NP_083142 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 127.7 – 127.81 Mb | Хр. 18: 31.94 – 32.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WDR33 (англ. WD repeat domain 33) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 336 амінокислот, а молекулярна маса — 145 891[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATEIGSPPR | | FFHMPRFQHQ | | APRQLFYKRP | | DFAQQQAMQQ | | LTFDGKRMRK |
AVNRKTIDYN | | PSVIKYLENR | | IWQRDQRDMR | | AIQPDAGYYN | | DLVPPIGMLN |
NPMNAVTTKF | | VRTSTNKVKC | | PVFVVRWTPE | | GRRLVTGASS | | GEFTLWNGLT |
FNFETILQAH | | DSPVRAMTWS | | HNDMWMLTAD | | HGGYVKYWQS | | NMNNVKMFQA |
HKEAIREASF | | SPTDNKFATC | | SDDGTVRIWD | | FLRCHEERIL | | RGHGADVKCV |
DWHPTKGLVV | | SGSKDSQQPI | | KFWDPKTGQS | | LATLHAHKNT | | VMEVKLNLNG |
NWLLTASRDH | | LCKLFDIRNL | | KEELQVFRGH | | KKEATAVAWH | | PVHEGLFASG |
GSDGSLLFWH | | VGVEKEVGGM | | EMAHEGMIWS | | LAWHPLGHIL | | CSGSNDHTSK |
FWTRNRPGDK | | MRDRYNLNLL | | PGMSEDGVEY | | DDLEPNSLAV | | IPGMGIPEQL |
KLAMEQEQMG | | KDESNEIEMT | | IPGLDWGMEE | | VMQKDQKKVP | | QKKVPYAKPI |
PAQFQQAWMQ | | NKVPIPAPNE | | VLNDRKEDIK | | LEEKKKTQAE | | IEQEMATLQY |
TNPQLLEQLK | | IERLAQKQVE | | QIQPPPSSGT | | PLLGPQPFPG | | QGPMSQIPQG |
FQQPHPSQQM | | PMNMAQMGPP | | GPQGQFRPPG | | PQGQMGPQGP | | PLHQGGGGPQ |
GFMGPQGPQG | | PPQGLPRPQD | | MHGPQGMQRH | | PGPHGPLGPQ | | GPPGPQGSSG |
PQGHMGPQGP | | PGPQGHIGPQ | | GPPGPQGHLG | | PQGPPGTQGM | | QGPPGPRGMQ |
GPPHPHGIQG | | GPGSQGIQGP | | VSQGPLMGLN | | PRGMQGPPGP | | RENQGPAPQG |
MIMGHPPQEM | | RGPHPPGGLL | | GHGPQEMRGP | | QEIRGMQGPP | | PQGSMLGPPQ |
ELRGPPGSQS | | QQGPPQGSLG | | PPPQGGMQGP | | PGPQGQQNPA | | RGPHPSQGPI |
PFQQQKTPLL | | GDGPRAPFNQ | | EGQSTGPPPL | | IPGLGQQGAQ | | GRIPPLNPGQ |
GPGPNKGDSR | | GPPNHHMGPM | | SERRHEQSGG | | PEHGPERGPF | | RGGQDCRGPP |
DRRGPHPDFP | | DDFSRPDDFH | | PDKRFGHRLR | | EFEGRGGPLP | | QEEKWRRGGP |
GPPFPPDHRE | | FSEGDGRGAA | | RGPPGAWEGR | | RPGDERFPRD | | PEDPRFRGRR |
EESFRRGAPP | | RHEGRAPPRG | | RDGFPGPEDF | | GPEENFDASE | | EAARGRDLRG |
RGRGTPRGGR | | KGLLPTPDEF | | PRFEGGRKPD | | SWDGNREPGP | | GHEHFRDTPR |
PDHPPHDGHS | | PASRERSSSL | | QGMDMASLPP | | RKRPWHDGPG | | TSEHREMEAP |
GGPSEDRGGK | | GRGGPGPAQR | | VPKSGRSSSL | | DGEHHDGYHR | | DEPFGGPPGS |
GTPSRGGRSG | | SNWGRGSNMN | | SGPPRRGASR | | GGGRGR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з WDR33 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25651 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9C0J8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |