XDH |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/dd/Protein_XDH_PDB_1fiq.png/250px-Protein_XDH_PDB_1fiq.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CKJ, 2E1Q | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XDH, XO, XOR, xanthine dehydrogenase, XAN1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607633 MGI: 98973 HomoloGene: 324 GeneCards: XDH |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
алопуринол, topiroxostat[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • iron ion binding • protein homodimerization activity • xanthine oxidase activity • flavin adenine dinucleotide binding • oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • каталітична активність • molybdopterin cofactor binding • electron transfer activity • xanthine dehydrogenase activity • oxidoreductase activity • 2 iron, 2 sulfur cluster binding • oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors • FAD binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • пероксисома • sarcoplasmic reticulum • extracellular region • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of p38MAPK cascade • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of protein kinase B signaling • purine nucleotide catabolic process • negative regulation of endothelial cell differentiation • negative regulation of gene expression • negative regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • negative regulation of vasculogenesis • negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • лактація • regulation of epithelial cell differentiation • xanthine catabolic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • Електронтранспортний ланцюг |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6c/PBB_GE_XDH_210301_at_fs.png/250px-PBB_GE_XDH_210301_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 31.33 – 31.41 Mb | Хр. 17: 74.19 – 74.26 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
XDH (англ. Xanthine dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 333 амінокислот, а молекулярна маса — 146 424[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTADKLVFFV | | NGRKVVEKNA | | DPETTLLAYL | | RRKLGLSGTK | | LGCGEGGCGA |
CTVMLSKYDR | | LQNKIVHFSA | | NACLAPICSL | | HHVAVTTVEG | | IGSTKTRLHP |
VQERIAKSHG | | SQCGFCTPGI | | VMSMYTLLRN | | QPEPTMEEIE | | NAFQGNLCRC |
TGYRPILQGF | | RTFARDGGCC | | GGDGNNPNCC | | MNQKKDHSVS | | LSPSLFKPEE |
FTPLDPTQEP | | IFPPELLRLK | | DTPRKQLRFE | | GERVTWIQAS | | TLKELLDLKA |
QHPDAKLVVG | | NTEIGIEMKF | | KNMLFPMIVC | | PAWIPELNSV | | EHGPDGISFG |
AACPLSIVEK | | TLVDAVAKLP | | AQKTEVFRGV | | LEQLRWFAGK | | QVKSVASVGG |
NIITASPISD | | LNPVFMASGA | | KLTLVSRGTR | | RTVQMDHTFF | | PGYRKTLLSP |
EEILLSIEIP | | YSREGEYFSA | | FKQASRREDD | | IAKVTSGMRV | | LFKPGTTEVQ |
ELALCYGGMA | | NRTISALKTT | | QRQLSKLWKE | | ELLQDVCAGL | | AEELHLPPDA |
PGGMVDFRCT | | LTLSFFFKFY | | LTVLQKLGQE | | NLEDKCGKLD | | PTFASATLLF |
QKDPPADVQL | | FQEVPKGQSE | | EDMVGRPLPH | | LAADMQASGE | | AVYCDDIPRY |
ENELSLRLVT | | STRAHAKIKS | | IDTSEAKKVP | | GFVCFISADD | | VPGSNITGIC |
NDETVFAKDK | | VTCVGHIIGA | | VVADTPEHTQ | | RAAQGVKITY | | EELPAIITIE |
DAIKNNSFYG | | PELKIEKGDL | | KKGFSEADNV | | VSGEIYIGGQ | | EHFYLETHCT |
IAVPKGEAGE | | MELFVSTQNT | | MKTQSFVAKM | | LGVPANRIVV | | RVKRMGGGFG |
GKETRSTVVS | | TAVALAAYKT | | GRPVRCMLDR | | DEDMLITGGR | | HPFLARYKVG |
FMKTGTVVAL | | EVDHFSNVGN | | TQDLSQSIME | | RALFHMDNCY | | KIPNIRGTGR |
LCKTNLPSNT | | AFRGFGGPQG | | MLIAECWMSE | | VAVTCGMPAE | | EVRRKNLYKE |
GDLTHFNQKL | | EGFTLPRCWE | | ECLASSQYHA | | RKSEVDKFNK | | ENCWKKRGLC |
IIPTKFGISF | | TVPFLNQAGA | | LLHVYTDGSV | | LLTHGGTEMG | | QGLHTKMVQV |
ASRALKIPTS | | KIYISETSTN | | TVPNTSPTAA | | SVSADLNGQA | | VYAACQTILK |
RLEPYKKKNP | | SGSWEDWVTA | | AYMDTVSLSA | | TGFYRTPNLG | | YSFETNSGNP |
FHYFSYGVAC | | SEVEIDCLTG | | DHKNLRTDIV | | MDVGSSLNPA | | IDIGQVEGAF |
VQGLGLFTLE | | ELHYSPEGSL | | HTRGPSTYKI | | PAFGSIPIEF | | RVSLLRDCPN |
KKAIYASKAV | | GEPPLFLAAS | | IFFAIKDAIR | | AARAQHTGNN | | VKELFRLDSP |
ATPEKIRNAC | | VDKFTTLCVT | | GVPENCKPWS | | VRV |
Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном заліза, ФАД, флавопротеїном, залізо-сірчаною групою, групою 2fe-2s. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах. Також секретований назовні.
Література
- Xu P., Huecksteadt T.P., Harrison R., Hoidal J.R. (1994). Molecular cloning, tissue expression of human xanthine dehydrogenase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 199: 998—1004. PMID 8135849 DOI:10.1006/bbrc.1994.1328
- Xu P., Huecksteadt T.P., Harrison R., Hoidal J.R. (1995). Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 429—429.
{{cite journal}}
: Пропущений або порожній |title=
(довідка) PMID 7575623 DOI:10.1006/bbrc.1995.2482 - Saksela M., Raivio K.O. (1996). Cloning and expression in vitro of human xanthine dehydrogenase/oxidase. Biochem. J. 315: 235—239. PMID 8670112 DOI:10.1042/bj3150235
- Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
- Yamaguchi Y., Matsumura T., Ichida K., Okamoto K., Nishino T. (2007). Human xanthine oxidase changes its substrate specificity to aldehyde oxidase type upon mutation of amino acid residues in the active site: roles of active site residues in binding and activation of purine substrate. J. Biochem. 141: 513—524. PMID 17301077 DOI:10.1093/jb/mvm053
- Gok F., Ichida K., Topaloglu R. (2003). Mutational analysis of the xanthine dehydrogenase gene in a Turkish family with autosomal recessive classical xanthinuria. Nephrol. Dial. Transplant. 18: 2278—2283. PMID 14551354 DOI:10.1093/ndt/gfg385
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з XDH переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Xanthine dehydrogenase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12805 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P47989 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |