YIPF5 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

YIPF5

Ідентифікатори

Символи

YIPF5, FinGER5, SB140, SMAP-5, SMAP5, YIP1A, Yip1 domain family member 5, MEDS2

Зовнішні ІД

OMIM: 611483 MGI: 1914430 HomoloGene: 56969 GeneCards: YIPF5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • nuclear outer membrane-endoplasmic reticulum membrane network • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum exit site • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• protein transport • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81555


67180

Ensembl


ENSG00000145817


ENSMUSG00000024487

UniProt


Q969M3


Q9EQQ2

RefSeq (мРНК)


NM_030799 NM_001024947 NM_001271732


NM_023311

RefSeq (білок)


NP_001020118 NP_001258661 NP_110426


NP_075800

Локус (UCSC)

Хр. 5: 144.16 – 144.17 Mb

Хр. 18: 40.34 – 40.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YIPF5 (англ. Yip1 domain family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 257 амінокислот, а молекулярна маса — 27 989^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGFENLNTD	FYQTSYSIDD	QSQQSYDYGG	SGGPYSKQYA	GYDYSQQGRF
VPPDMMQPQQ	PYTGQIYQPT	QAYTPASPQP	FYGNNFEDEP	PLLEELGINF
DHIWQKTLTV	LHPLKVADGS	IMNETDLAGP	MVFCLAFGAT	LLLAGKIQFG
YVYGISAIGC	LGMFCLLNLM	SMTGVSFGCV	ASVLGYCLLP	MILLSSFAVI
FSLQGMVGII	LTAGIIGWCS	FSASKIFISA	LAMEGQQLLV	AYPCALLYGV
FALISVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24877 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q969M3 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.