YLPM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | YLPM1, C14orf170, PPP1R169, ZAP113, ZAP3, YLP motif containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1926195 HomoloGene: 87707 GeneCards: YLPM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of telomere maintenance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 74.76 – 74.86 Mb | Хр. 12: 85.04 – 85.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
YLPM1 (англ. YLP motif containing 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 951 амінокислот, а молекулярна маса — 219 985[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYPNWGRYGG | | SSHYPPPPVP | | PPPPVALPEA | | SPGPGYSSST | | TPAAPSSSGF |
MSFREQHLAQ | | LQQLQQMHQK | | QMQCVLQPHH | | LPPPPLPPPP | | VMPGGGYGDW |
QPPPPPMPPP | | PGPALSYQKQ | | QQYKHQMLHH | | QRDGPPGLVP | | MELESPPESP |
PVPPGSYMPP | | SQSYMPPPQP | | PPSYYPPTSS | | QPYLPPAQPS | | PSQSPPSQSY |
LAPTPSYSSS | | SSSSQSYLSH | | SQSYLPSSQA | | SPSRPSQGHS | | KSQLLAPPPP |
SAPPGNKTTV | | QQEPLESGAK | | NKSTEQQQAA | | PEPDPSTMTP | | QEQQQYWYRQ |
HLLSLQQRTK | | VHLPGHKKGP | | VVAKDTPEPV | | KEEVTVPATS | | QVPESPSSEE |
PPLPPPNEEV | | PPPLPPEEPQ | | SEDPEEDARL | | KQLQAAAAHW | | QQHQQHRVGF |
QYQGIMQKHT | | QLQQILQQYQ | | QIIQPPPHIQ | | ATTPPPGIPP | | PGVPQGIPPQ |
LTAAPVPPAS | | SSQSSQVPEK | | PRPALLPTPV | | SFGSAPPTTY | | HPPLQSAGPS |
EQVNSKAPLS | | KSALPYSSFS | | SDQGLGESSA | | APSQPITAVK | | DMPVRSGGLL |
PDPPRSSYLE | | SPRGPRFDGP | | RRFEDLGSRC | | EGPRPKGPRF | | EGNRPDGPRP |
RYEGHPAEGT | | KSKWGMIPRG | | PASQFYITPS | | TSLSPRQSGP | | QWKGPKPAFG |
QQHQQQPKSQ | | AEPLSGNKEP | | LADTSSNQQK | | NFKMQSAAFS | | IAADVKDVKA |
AQSNENLSDS | | QQEPPKSEVS | | EGPVEPSNWD | | QNVQSMETQI | | DKAQAVTQPV |
PLANKPVPAQ | | STFPSKTGGM | | EGGTAVATSS | | LTADNDFKPV | | GIGLPHSENN |
QDKGLPRPDN | | RDNRLEGNRG | | NSSSYRGPGQ | | SRMEDTRDKG | | LVNRGRGQAI |
SRGPGLVKQE | | DFRDKMMGRR | | EDSREKMNRG | | EGSRDRGLVR | | PGSSREKVPG |
GLQGSQDRGA | | AGSRERGPPR | | RAGSQERGPL | | RRAGSRERIP | | PRRAGSRERG |
PPRGPGSRER | | GLGRSDFGRD | | RGPFRPEPGD | | GGEKMYPYHR | | DEPPRAPWNH |
GEERGHEEFP | | LDGRNAPMER | | ERLDDWDRER | | YWRECERDYQ | | DDTLELYNRE |
DRFSAPPSRS | | HDGDRRGPWW | | DDWERDQDMD | | EDYNREMERD | | MDRDVDRISR |
PMDMYDRSLD | | NEWDRDYGRP | | LDEQESQFRE | | RDIPSLPPLP | | PLPPLPPLDR |
YRDDRWREER | | NREHGYDRDF | | RDRGELRIRE | | YPERGDTWRE | | KRDYVPDRMD |
WERERLSDRW | | YPSDVDRHSP | | MAEHMPSSHH | | SSEMMGSDAS | | LDSDQGLGGV |
MVLSQRQHEI | | ILKAAQELKM | | LREQKEQLQK | | MKDFGSEPQM | | ADHLPPQESR |
LQNTSSRPGM | | YPPPGSYRPP | | PPMGKPPGSI | | VRPSAPPARS | | SVPVTRPPVP |
IPPPPPPPPL | | PPPPPVIKPQ | | TSAVEQERWD | | EDSFYGLWDT | | NDEQGLNSEF |
KSETAAIPSA | | PVLPPPPVHS | | SIPPPGPVPM | | GMPPMSKPPP | | VQQTVDYGHG |
RDISTNKVEQ | | IPYGERITLR | | PDPLPERSTF | | ETEHAGQRDR | | YDRERDREPY |
FDRQSNVIAD | | HRDFKRDRET | | HRDRDRDRGV | | IDYDRDRFDR | | ERRPRDDRAQ |
SYRDKKDHSS | | SRRGGFDRPS | | YDRKSDRPVY | | EGPSMFGGER | | RTYPEERMPL |
PAPSLSHQPP | | PAPRVEKKPE | | SKNVDDILKP | | PGRESRPERI | | VVIMRGLPGS |
GKTHVAKLIR | | DKEVEFGGPA | | PRVLSLDDYF | | ITEVEKEEKD | | PDSGKKVKKK |
VMEYEYEAEM | | EETYRTSMFK | | TFKKTLDDGF | | FPFIILDAIN | | DRVRHFDQFW |
SAAKTKGFEV | | YLAEMSADNQ | | TCGKRNIHGR | | KLKEINKMAD | | HWETAPRHMM |
RLDIRSLLQD | | AAIEEVEMED | | FDANIEEQKE | | EKKDAEEEES | | ELGYIPKSKW |
EMDTSEAKLD | | KLDGLRTGTK | | RKRDWEAIAS | | RMEDYLQLPD | | DYDTRASEPG |
KKRVRWADLE | | EKKDADRKRA | | IGFVVGQTDW | | EKITDESGHL | | AEKALNRTKY |
I |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17798 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P49750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |