YLPM1

Ідентифікатори

Символи

YLPM1, C14orf170, PPP1R169, ZAP113, ZAP3, YLP motif containing 1

Зовнішні ІД

MGI: 1926195 HomoloGene: 87707 GeneCards: YLPM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of telomere maintenance
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56252


56531

Ensembl


ENSG00000119596


ENSMUSG00000021244

UniProt


P49750


Q9R0I7

RefSeq (мРНК)


NM_019589


NM_178363 NM_001347421

RefSeq (білок)


NP_062535


NP_001334350 NP_848140

Локус (UCSC)

Хр. 14: 74.76 – 74.86 Mb

Хр. 12: 85.04 – 85.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YLPM1 (англ. YLP motif containing 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 951 амінокислот, а молекулярна маса — 219 985^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYPNWGRYGG	SSHYPPPPVP	PPPPVALPEA	SPGPGYSSST	TPAAPSSSGF
MSFREQHLAQ	LQQLQQMHQK	QMQCVLQPHH	LPPPPLPPPP	VMPGGGYGDW
QPPPPPMPPP	PGPALSYQKQ	QQYKHQMLHH	QRDGPPGLVP	MELESPPESP
PVPPGSYMPP	SQSYMPPPQP	PPSYYPPTSS	QPYLPPAQPS	PSQSPPSQSY
LAPTPSYSSS	SSSSQSYLSH	SQSYLPSSQA	SPSRPSQGHS	KSQLLAPPPP
SAPPGNKTTV	QQEPLESGAK	NKSTEQQQAA	PEPDPSTMTP	QEQQQYWYRQ
HLLSLQQRTK	VHLPGHKKGP	VVAKDTPEPV	KEEVTVPATS	QVPESPSSEE
PPLPPPNEEV	PPPLPPEEPQ	SEDPEEDARL	KQLQAAAAHW	QQHQQHRVGF
QYQGIMQKHT	QLQQILQQYQ	QIIQPPPHIQ	ATTPPPGIPP	PGVPQGIPPQ
LTAAPVPPAS	SSQSSQVPEK	PRPALLPTPV	SFGSAPPTTY	HPPLQSAGPS
EQVNSKAPLS	KSALPYSSFS	SDQGLGESSA	APSQPITAVK	DMPVRSGGLL
PDPPRSSYLE	SPRGPRFDGP	RRFEDLGSRC	EGPRPKGPRF	EGNRPDGPRP
RYEGHPAEGT	KSKWGMIPRG	PASQFYITPS	TSLSPRQSGP	QWKGPKPAFG
QQHQQQPKSQ	AEPLSGNKEP	LADTSSNQQK	NFKMQSAAFS	IAADVKDVKA
AQSNENLSDS	QQEPPKSEVS	EGPVEPSNWD	QNVQSMETQI	DKAQAVTQPV
PLANKPVPAQ	STFPSKTGGM	EGGTAVATSS	LTADNDFKPV	GIGLPHSENN
QDKGLPRPDN	RDNRLEGNRG	NSSSYRGPGQ	SRMEDTRDKG	LVNRGRGQAI
SRGPGLVKQE	DFRDKMMGRR	EDSREKMNRG	EGSRDRGLVR	PGSSREKVPG
GLQGSQDRGA	AGSRERGPPR	RAGSQERGPL	RRAGSRERIP	PRRAGSRERG
PPRGPGSRER	GLGRSDFGRD	RGPFRPEPGD	GGEKMYPYHR	DEPPRAPWNH
GEERGHEEFP	LDGRNAPMER	ERLDDWDRER	YWRECERDYQ	DDTLELYNRE
DRFSAPPSRS	HDGDRRGPWW	DDWERDQDMD	EDYNREMERD	MDRDVDRISR
PMDMYDRSLD	NEWDRDYGRP	LDEQESQFRE	RDIPSLPPLP	PLPPLPPLDR
YRDDRWREER	NREHGYDRDF	RDRGELRIRE	YPERGDTWRE	KRDYVPDRMD
WERERLSDRW	YPSDVDRHSP	MAEHMPSSHH	SSEMMGSDAS	LDSDQGLGGV
MVLSQRQHEI	ILKAAQELKM	LREQKEQLQK	MKDFGSEPQM	ADHLPPQESR
LQNTSSRPGM	YPPPGSYRPP	PPMGKPPGSI	VRPSAPPARS	SVPVTRPPVP
IPPPPPPPPL	PPPPPVIKPQ	TSAVEQERWD	EDSFYGLWDT	NDEQGLNSEF
KSETAAIPSA	PVLPPPPVHS	SIPPPGPVPM	GMPPMSKPPP	VQQTVDYGHG
RDISTNKVEQ	IPYGERITLR	PDPLPERSTF	ETEHAGQRDR	YDRERDREPY
FDRQSNVIAD	HRDFKRDRET	HRDRDRDRGV	IDYDRDRFDR	ERRPRDDRAQ
SYRDKKDHSS	SRRGGFDRPS	YDRKSDRPVY	EGPSMFGGER	RTYPEERMPL
PAPSLSHQPP	PAPRVEKKPE	SKNVDDILKP	PGRESRPERI	VVIMRGLPGS
GKTHVAKLIR	DKEVEFGGPA	PRVLSLDDYF	ITEVEKEEKD	PDSGKKVKKK
VMEYEYEAEM	EETYRTSMFK	TFKKTLDDGF	FPFIILDAIN	DRVRHFDQFW
SAAKTKGFEV	YLAEMSADNQ	TCGKRNIHGR	KLKEINKMAD	HWETAPRHMM
RLDIRSLLQD	AAIEEVEMED	FDANIEEQKE	EKKDAEEEES	ELGYIPKSKW
EMDTSEAKLD	KLDGLRTGTK	RKRDWEAIAS	RMEDYLQLPD	DYDTRASEPG
KKRVRWADLE	EKKDADRKRA	IGFVVGQTDW	EKITDESGHL	AEKALNRTKY
I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17798 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P49750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.