YTHDF3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | YTHDF3, YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3, DF3 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1918850 HomoloGene: 34991 GeneCards: YTHDF3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding • RNA binding • ribosome binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of translation • positive regulation of translational initiation • mRNA destabilization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001277813 NM_001277814 NM_001277815 NM_001277816 NM_001277817
| NM_001277818 NM_152758 |
| | NM_001145919 NM_172677 NM_001358041 NM_001358042 NM_001358043 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001264742 NP_001264743 NP_001264744 NP_001264745 NP_001264746
| NP_001264747 NP_689971 |
| | NP_001139391 NP_766265 NP_001344970 NP_001344971 NP_001344972 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 63.17 – 63.21 Mb | Хр. 3: 16.24 – 16.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
YTHDF3 (англ. YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 63 861[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSATSVDQRP | | KGQGNKVSVQ | | NGSIHQKDAV | | NDDDFEPYLS | | SQTNQSNSYP |
PMSDPYMPSY | | YAPSIGFPYS | | LGEAAWSTAG | | DQPMPYLTTY | | GQMSNGEHHY |
IPDGVFSQPG | | ALGNTPPFLG | | QHGFNFFPGN | | ADFSTWGTSG | | SQGQSTQSSA |
YSSSYGYPPS | | SLGRAITDGQ | | AGFGNDTLSK | | VPGISSIEQG | | MTGLKIGGDL |
TAAVTKTVGT | | ALSSSGMTSI | | ATNSVPPVSS | | AAPKPTSWAA | | IARKPAKPQP |
KLKPKGNVGI | | GGSAVPPPPI | | KHNMNIGTWD | | EKGSVVKAPP | | TQPVLPPQTI |
IQQPQPLIQP | | PPLVQSQLPQ | | QQPQPPQPQQ | | QQGPQPQAQP | | HQVQPQQQQL |
QNRWVAPRNR | | GAGFNQNNGA | | GSENFGLGVV | | PVSASPSSVE | | VHPVLEKLKA |
INNYNPKDFD | | WNLKNGRVFI | | IKSYSEDDIH | | RSIKYSIWCS | | TEHGNKRLDA |
AYRSLNGKGP | | LYLLFSVNGS | | GHFCGVAEMK | | SVVDYNAYAG | | VWSQDKWKGK |
FEVKWIFVKD | | VPNNQLRHIR | | LENNDNKPVT | | NSRDTQEVPL | | EKAKQVLKII |
ATFKHTTSIF | | DDFAHYEKRQ | | EEEEAMRRER | | NRNKQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26465 (англ.) . Архів оригіналу за 1 березня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z739 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |