ZBTB1

Ідентифікатори

Символи

ZBTB1, ZNF909, zinc finger and BTB domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 616578 MGI: 2442326 HomoloGene: 8974 GeneCards: ZBTB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• ядерні тільця • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерна мембрана
Біологічний процес	• positive regulation of T cell differentiation • ремоделювання хроматину • диференціація клітин • positive regulation of pro-T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of natural killer cell differentiation • T cell differentiation in thymus • thymus development • процес імунної системи • cellular response to UV • mRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of T cell mediated immunity • translesion synthesis • B cell differentiation • вроджений імунітет • protein homooligomerization • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22890


268564

Ensembl


ENSG00000126804


ENSMUSG00000033454

UniProt


Q9Y2K1


Q91VL9

RefSeq (мРНК)


NM_001123329 NM_014950


NM_178744 NM_001364323

RefSeq (білок)


NP_001116801 NP_055765


NP_848859 NP_001351252

Локус (UCSC)

Хр. 14: 64.5 – 64.53 Mb

Хр. 12: 76.42 – 76.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZBTB1 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 713 амінокислот, а молекулярна маса — 82 016^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKPSHSSYV	LQQLNNQREW	GFLCDCCIAI	DDIYFQAHKA	VLAACSSYFR
MFFMNHQHST	AQLNLSNMKI	SAECFDLILQ	FMYLGKIMTA	PSSFEQFKVA
MNYLQLYNVP	DCLEDIQDAD	CSSSKCSSSA	SSKQNSKMIF	GVRMYEDTVA
RNGNEANRWC	AEPSSTVNTP	HNREADEESL	QLGNFPEPLF	DVCKKSSVSK
LSTPKERVSR	RFGRSFTCDS	CGFGFSCEKL	LDEHVLTCTN	RHLYQNTRSY
HRIVDIRDGK	DSNIKAEFGE	KDSSKTFSAQ	TDKYRGDTSQ	AADDSASTTG
SRKSSTVESE	IASEEKSRAA	ERKRIIIKME	PEDIPTDELK	DFNIIKVTDK
DCNESTDNDE	LEDEPEEPFY	RYYVEEDVSI	KKSGRKTLKP	RMSVSADERG
GLENMRPPNN	SSPVQEDAEN	ASCELCGLTI	TEEDLSSHYL	AKHIENICAC
GKCGQILVKG	RQLQEHAQRC	GEPQDLTMNG	LGNTEEKMDL	EENPDEQSEI
RDMFVEMLDD	FRDNHYQINS	IQKKQLFKHS	ACPFRCPNCG	QRFETENLVV
EHMSSCLDQD	MFKSAIMEEN	ERDHRRKHFC	NLCGKGFYQR	CHLREHYTVH
TKEKQFVCQT	CGKQFLRERQ	LRLHNDMHKG	MARYVCSICD	QGNFRKHDHV
RHMISHLSAG	ETICQVCFQI	FPNNEQLEQH	MDVHLYTCGI	CGAKFNLRKD
MRSHYNAKHL	KRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20259 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2K1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.