ZFYVE27 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZFYVE27, PROTRUDIN, SPG33, zinc finger FYVE-type containing 27 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610243 MGI: 1919602 HomoloGene: 16939 GeneCards: ZFYVE27 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hereditary spastic paraplegia 33[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein self-association |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • аксон • ендосома • recycling endosome membrane • growth cone membrane • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum tubular network • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • protein localization to plasma membrane • neuron projection development • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • vesicle-mediated transport • positive regulation of axon extension • endoplasmic reticulum tubular network formation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001002261 NM_001002262 NM_001174119 NM_001174120 NM_001174121
| NM_001174122 NM_144588 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001002261 NP_001002262 NP_001167590 NP_001167591 NP_001167592
| NP_001167593 NP_653189 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 97.74 – 97.76 Mb | Хр. 19: 42.15 – 42.18 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZFYVE27 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 45 843[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQTSEREGSG | | PELSPSVMPE | | APLESPPFPT | | KSPAFDLFNL | | VLSYKRLEIY |
LEPLKDAGDG | | VRYLLRWQMP | | LCSLLTCLGL | | NVLFLTLNEG | | AWYSVGALMI |
SVPALLGYLQ | | EVCRARLPDS | | ELMRRKYHSV | | RQEDLQRGRL | | SRPEAVAEVK |
SFLIQLEAFL | | SRLCCTCEAA | | YRVLHWENPV | | VSSQFYGALL | | GTVCMLYLLP |
LCWVLTLLNS | | TLFLGNVEFF | | RVVSEYRASL | | QQRMNPKQEE | | HAFESPPPPD |
VGGKDGLMDS | | TPALTPTEDL | | TPGSVEEAEE | | AEPDEEFKDA | | IEETHLVVLE |
DDEGAPCPAE | | DELALQDNGF | | LSKNEVLRSK | | VSRLTERLRK | | RYPTNNFGNC |
TGCSATFSVL | | KKRRSCSNCG | | NSFCSRCCSF | | KVPKSSMGAT | | APEAQRETVF |
VCASCNQTLS | | K |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shirane M., Nakayama K.I. (2006). Protrudin induces neurite formation by directional membrane trafficking. Science. 314: 818—821. PMID 17082457 DOI:10.1126/science.1134027
- Shirane M., Ogawa M., Motoyama J., Nakayama K.I. (2008). Regulation of apoptosis and neurite extension by FKBP38 is required for neural tube formation in the mouse. Genes Cells. 13: 635—651. PMID 18459960 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01194.x
- Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein. J. Biol. Chem. 284: 13766—13777. PMID 19289470 DOI:10.1074/jbc.M807938200
- Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation. Mol. Biol. Cell. 22: 4602—4620. PMID 21976701 DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068
- Martignoni M., Riano E., Rugarli E.I. (2008). The role of ZFYVE27/protrudin in hereditary spastic paraplegia. Am. J. Hum. Genet. 83: 127—130. PMID 18606302 DOI:10.1016/j.ajhg.2008.05.014
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZFYVE27 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26559 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5T4F4 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |