ZHX1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ECB, 2GHF, 2LY9, 3NAR

Ідентифікатори

Символи

ZHX1, zinc fingers and homeoboxes 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604764 MGI: 109271 HomoloGene: 5225 GeneCards: ZHX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11244


22770

Ensembl


ENSG00000165156


ENSMUSG00000022361

UniProt


Q9UKY1


P70121

RefSeq (мРНК)


NM_001017926 NM_007222


NM_001042438 NM_009572

RefSeq (білок)


NP_001017926 NP_009153


NP_001035903 NP_033598

Локус (UCSC)

Хр. 8: 123.25 – 123.28 Mb

Хр. 15: 57.91 – 57.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZHX1 (англ. Zinc fingers and homeoboxes 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 873 амінокислот, а молекулярна маса — 98 098^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASRRKSTTP	CMVLASEQDP	DLELISDLDE	GPPVLTPVEN	TRAESISSDE
EVHESVDSDN	QQNKKVEGGY	ECKYCTFQTP	DLNMFTFHVD	SEHPNVVLNS
SYVCVECNFL	TKRYDALSEH	NLKYHPGEEN	FKLTMVKRNN	QTIFEQTIND
LTFDGSFVKE	ENAEQAESTE	VSSSGISISK	TPIMKMMKNK	VENKRIAVHH
NSVEDVPEEK	ENEIKPDREE	IVENPSSSAS	ESNTSTSIVN	RIHPSTASTV
VTPAAVLPGL	AQVITAVSAQ	QNSNLIPKVL	IPVNSIPTYN	AALDNNPLLL
NTYNKFPYPT	MSEITVLSAQ	AKYTEEQIKI	WFSAQRLKHG	VSWTPEEVEE
ARRKQFNGTV	HTVPQTITVI	PTHISTGSNG	LPSILQTCQI	VGQPGLVLTQ
VAGTNTLPVT	APIALTVAGV	PSQNNIQKSQ	VPAAQPTAET	KPATAAVPTS
QSVKHETALV	NPDSFGIRAK	KTKEQLAELK	VSYLKNQFPH	DSEIIRLMKI
TGLTKGEIKK	WFSDTRYNQR	NSKSNQCLHL	NNDSSTTIII	DSSDETTESP
TVGTAQPKQS	WNPFPDFTPQ	KFKEKTAEQL	RVLQASFLNS	SVLTDEELNR
LRAQTKLTRR	EIDAWFTEKK	KSKALKEEKM	EIDESNAGSS	KEEAGETSPA
DESGAPKSGS	TGKICKKTPE	QLHMLKSAFV	RTQWPSPEEY	DKLAKESGLA
RTDIVSWFGD	TRYAWKNGNL	KWYYYYQSAN	SSSMNGLSSL	RKRGRGRPKG
RGRGRPRGRP	RGSKRINNWD	RGPSLIKFKT	GTAILKDYYL	KHKFLNEQDL
DELVNKSHMG	YEQVREWFAE	RQRRSELGIE	LFEENEEEDE	VIDDQEEDEE
ETDDSDTWEP	PRHVKRKLSK	SDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Yamada K., Printz R.L., Osawa H., Granner D.K. (1999). Human ZHX1: cloning, chromosomal location, and interaction with transcription factor NF-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 261: 614—621. PMID 10441475 DOI:10.1006/bbrc.1999.1087
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yamada K., Osawa H., Granner D.K. (1999). Identification of proteins that interact with NF-YA. FEBS Lett. 460: 41—45. PMID 10571058 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01311-3
Liu G., Clement L.C., Kanwar Y.S., Avila-Casado C., Chugh S.S. (2006). ZHX proteins regulate podocyte gene expression during the development of nephrotic syndrome. J. Biol. Chem. 281: 39681—39692. PMID 17056598 DOI:10.1074/jbc.M606664200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12871 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UKY1 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.