Laminina, alfa 3

Infotaula de genLaminina, alfa 3
Identificadors
ÀliesLAMA3 (HUGO), BM600, E170, LAMNA, LOCS, lama3a, Laminin, alpha 3, laminin subunit alpha 3, JEB2B, JEB2A, JEB2C
IDs externesOMIM: 600805   MGI: 99909   HomoloGene: 18279   GeneCards: LAMA3   OMA: LAMA3 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 18 (humà)
Crom.Cromosoma 18 (humà)[1]
Cromosoma 18 (humà)
Localització genòmica per Laminina, alfa 3
Localització genòmica per Laminina, alfa 3
Banda18q11.2Inici23.689.453 bp[1]
Fi23.956.222 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 18 (ratolí)
Crom.Cromosoma 18 (ratolí)[2]
Cromosoma 18 (ratolí)
Localització genòmica per Laminina, alfa 3
Localització genòmica per Laminina, alfa 3
Banda18 A1|18 6.2 cMInici12.466.876 bp[2]
Fi12.716.070 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • right lung Podeu traduir-lo

  • skin of leg Podeu traduir-lo

  • lligament periodontal Podeu corregir-lo

  • pell de l'abdomen Podeu corregir-lo

  • mucosa of sigmoid colon Podeu traduir-lo

  • jejunal mucosa Podeu traduir-lo

  • decidu

  • nervi sural Podeu corregir-lo

  • upper lobe of left lung Podeu traduir-lo

  • minor salivary glands Podeu traduir-lo
Més explicacions
  • queixal

  • estroma corneal

  • left lung lobe Podeu traduir-lo

  • right lung lobe Podeu traduir-lo

  • transitional epithelium of urinary bladder Podeu traduir-lo

  • skin of external ear Podeu traduir-lo

  • conjunctival fornix Podeu traduir-lo

  • left colon Podeu traduir-lo

  • ili

  • skin of back Podeu traduir-lo
Més dades d'expressió de referència
BioGPS




Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • signaling receptor binding Podeu traduir-lo
  • structural molecule activity Podeu traduir-lo
  • extracellular matrix structural constituent Podeu traduir-lo
  • integrin binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • regió extracel·lular Podeu corregir-lo
  • membrana basal 
  • laminin-5 complex Podeu traduir-lo
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • matriu extracel·lular 
  • reticle endoplasmàtic 
  • collagen-containing extracellular matrix Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • hemidesmosome assembly Podeu traduir-lo
  • adherència cel·lular 
  • extracellular matrix disassembly Podeu traduir-lo
  • regulation of cell adhesion Podeu traduir-lo
  • extracellular matrix organization Podeu traduir-lo
  • regulation of cell migration Podeu traduir-lo
  • endodermal cell differentiation Podeu traduir-lo
  • regulation of embryonic development Podeu traduir-lo
  • epidermis development Podeu traduir-lo
  • morphogenesis of a polarized epithelium Podeu traduir-lo
  • integrin-mediated signaling pathway Podeu traduir-lo
  • animal organ morphogenesis Podeu traduir-lo
  • Histogènesi 
  • migració cel·lular 
  • cell-cell adhesion Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

3909

16774

Ensembl

ENSG00000053747

ENSMUSG00000024421

UniProt

Q16787

Q61789

RefSeq (ARNm)

NM_000227
NM_001127717
NM_001127718
NM_001302996
NM_198129

NM_010680
NM_001347461

RefSeq (proteïna)

NP_000218
NP_001121189
NP_001121190
NP_001289925
NP_937762

NP_001334390
NP_034810

Localització (UCSC)Chr 18: 23.69 – 23.96 MbChr 18: 12.47 – 12.72 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

La Laminina subunitat alfa 3 és una proteïna que en els humans és codificada pel gen LAMA3.[5][6]

Les laminines són components de la membrana basal que mitjancien la unió, la migració i l'organització de les cèl·lules en teixits durant el desenvolupament embrionari per interacció amb altres components de la matriu extracel·lular. La proteïna codificada per aquest gen és la cadena alfa 3 de la laminina 5, que és una complexa glicopreteïna composta de tres subunitats (alfa, beta i gamma). La laminina 5 es creu que està relacionada amb l'adhesió cel·lular, la transducció de senyal i la diferenciació dels queraticonits. Mutacions en aquest gen s'han identificat com a la causa de l'epidermòlisi ampul·lar de tipus Herlitz. S'han identificat variants de transcrits, provinents d'splicings alternatius, codificant per diferents isoformes.[6]

Interaccions

S'ha demostrat que la laminina, alfa 3 té una interacció amb la SDC2.[7]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000053747 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024421 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Ryan MC, Tizard R, VanDevanter DR, Carter WG «Cloning of the LamA3 gene encoding the alpha 3 chain of the adhesive ligand epiligrin. Expression in wound repair». J Biol Chem, 269, 36, Oct 1994, pàg. 22779-87. PMID: 8077230.
  6. 6,0 6,1 «Entrez Gene: LAMA3 laminin, alpha 3».
  7. Utani, A; Nomizu M, Matsuura H, Kato K, Kobayashi T, Takeda U, Aota S, Nielsen P K, Shinkai H «A unique sequence of the laminin alpha 3 G domain binds to heparin and promotes cell adhesion through syndecan-2 and -4». J. Biol. Chem. [United States], 276, 31, Aug. 2001, pàg. 28779-88. DOI: 10.1074/jbc.M101420200. ISSN: 0021-9258. PMID: 11373281.

Bibliografia relacionada

  • Timpl R «Macromolecular organization of basement membranes.». Curr. Opin. Cell Biol., 8, 5, 1997, pàg. 618–24. DOI: 10.1016/S0955-0674(96)80102-5. PMID: 8939648.
  • Kivirikko S, McGrath JA, Baudoin C, et al. «A homozygous nonsense mutation in the alpha 3 chain gene of laminin 5 (LAMA3) in lethal (Herlitz) junctional epidermolysis bullosa.». Hum. Mol. Genet., 4, 5, 1995, pàg. 959–62. DOI: 10.1093/hmg/4.5.959. PMID: 7633458.
  • Rousselle P, Golbik R, van der Rest M, Aumailley M «Structural requirement for cell adhesion to kalinin (laminin-5).». J. Biol. Chem., 270, 23, 1995, pàg. 13766–70. DOI: 10.1074/jbc.270.23.13766. PMID: 7775432.
  • Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, et al. «A new nomenclature for the laminins.». Matrix Biol., 14, 3, 1994, pàg. 209–11. DOI: 10.1016/0945-053X(94)90184-8. PMID: 7921537.
  • Vidal F, Baudoin C, Miquel C, et al. «Cloning of the laminin alpha 3 chain gene (LAMA3) and identification of a homozygous deletion in a patient with Herlitz junctional epidermolysis bullosa.». Genomics, 30, 2, 1996, pàg. 273–80. DOI: 10.1006/geno.1995.9877. PMID: 8586427.
  • McGrath JA, Kivirikko S, Ciatti S, et al. «A recurrent homozygous nonsense mutation within the LAMA3 gene as a cause of Herlitz junctional epidermolysis bullosa in patients of Pakistani ancestry: evidence for a founder effect.». J. Invest. Dermatol., 106, 4, 1996, pàg. 781–4. DOI: 10.1111/1523-1747.ep12346349. PMID: 8618022.
  • Mizushima H, Miyagi Y, Kikkawa Y, et al. «Differential expression of laminin-5/ladsin subunits in human tissues and cancer cell lines and their induction by tumor promoter and growth factors.». J. Biochem., 120, 6, 1997, pàg. 1196–202. PMID: 9010770.
  • Miner JH, Patton BL, Lentz SI, et al. «The laminin alpha chains: expression, developmental transitions, and chromosomal locations of alpha1-5, identification of heterotrimeric laminins 8-11, and cloning of a novel alpha3 isoform.». J. Cell Biol., 137, 3, 1997, pàg. 685–701. DOI: 10.1083/jcb.137.3.685. PMID: 9151674.
  • Doliana R, Bellina I, Bucciotti F, et al. «The human alpha3b is a 'full-sized' laminin chain variant with a more widespread tissue expression than the truncated alpha3a.». FEBS Lett., 417, 1, 1998, pàg. 65–70. DOI: 10.1016/S0014-5793(97)01251-9. PMID: 9395076.
  • Mrowiec T, Melchar C, Górski A «HIV-protein-mediated alterations in T cell interactions with the extracellular matrix proteins and endothelium.». Arch. Immunol. Ther. Exp. (Warsz.), 45, 2-3, 1998, pàg. 255–9. PMID: 9597096.
  • Pulkkinen L, Cserhalmi-Friedman PB, Tang M, et al. «Molecular analysis of the human laminin alpha3a chain gene (LAMA3a): a strategy for mutation identification and DNA-based prenatal diagnosis in Herlitz junctional epidermolysis bullosa.». Lab. Invest., 78, 9, 1998, pàg. 1067–76. PMID: 9759651.
  • Gonzales M, Haan K, Baker SE, et al. «A cell signal pathway involving laminin-5, alpha3beta1 integrin, and mitogen-activated protein kinase can regulate epithelial cell proliferation.». Mol. Biol. Cell, 10, 2, 1999, pàg. 259–70. PMID: 9950675.
  • Hirosaki T, Mizushima H, Tsubota Y, et al. «Structural requirement of carboxyl-terminal globular domains of laminin alpha 3 chain for promotion of rapid cell adhesion and migration by laminin-5.». J. Biol. Chem., 275, 29, 2000, pàg. 22495–502. DOI: 10.1074/jbc.M001326200. PMID: 10801807.
  • Amano S, Scott IC, Takahara K, et al. «Bone morphogenetic protein 1 is an extracellular processing enzyme of the laminin 5 gamma 2 chain.». J. Biol. Chem., 275, 30, 2000, pàg. 22728–35. DOI: 10.1074/jbc.M002345200. PMID: 10806203.
  • Goldfinger LE, Jiang L, Hopkinson SB, et al. «Spatial regulation and activity modulation of plasmin by high affinity binding to the G domain of the alpha 3 subunit of laminin-5.». J. Biol. Chem., 275, 45, 2001, pàg. 34887–93. DOI: 10.1074/jbc.M006652200. PMID: 10956663.
  • Fujiwara H, Kikkawa Y, Sanzen N, Sekiguchi K «Purification and characterization of human laminin-8. Laminin-8 stimulates cell adhesion and migration through alpha3beta1 and alpha6beta1 integrins.». J. Biol. Chem., 276, 20, 2001, pàg. 17550–8. DOI: 10.1074/jbc.M010155200. PMID: 11278628.
  • McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S «Amplification of extracellular matrix and oncogenes in tat-transfected human salivary gland cell lines with expression of laminin, fibronectin, collagens I, III, IV, c-myc and p53.». Arch. Oral Biol., 46, 6, 2001, pàg. 545–55. DOI: 10.1016/S0003-9969(01)00014-0. PMID: 11311202.
  • Utani A, Nomizu M, Matsuura H, et al. «A unique sequence of the laminin alpha 3 G domain binds to heparin and promotes cell adhesion through syndecan-2 and -4.». J. Biol. Chem., 276, 31, 2001, pàg. 28779–88. DOI: 10.1074/jbc.M101420200. PMID: 11373281.
  • Vegeu aquesta plantilla
Proteïnes fibroses o escleroproteïnes
Matriu
extracel·lular
1-12
tipus I (COL1A1, COL1A2) · tipus II (COL2A1) · tipus III · tipus IV (COL4A1, COL4A2, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6) · tipus V (COL5A1, COL5A2, COL5A3) · tipus VI (COL6A1, COL6A2, COL6A3) · tipus VII (COL7A1) · tipus VIII (COL8A1, COL8A2) · tipus IX (COL9A1, COL9A2, COL9A3) · tipus X (COL10A1) · tipus XI (COL11A1, COL11A2) · tipus XII (COL12A1)
13-29
COL13A1 · COL14A1 · COL15A1 · COL16A1 · COL17A1 · tipus XVIII (COL18A1, Endostatina) · COL19A1 · COL20A1 · COL21A1 · COL22A1 · COL23A1 · COL24A1 · COL25A1 · COL26A1 · COL27A1 · COL28A1 · COL29A1
Prolil hydroxilasa/Lisil hydroxilasa · Proteïna associada al cartíleg/Leprecan · ADAMTS2 · Peptidasa del procol·lagen · Lisil oxidasa
Tenascina C · Tenascina X
alfa (LAMA1, LAMA2, LAMA3, LAMA4, LAMA5) · beta (LAMB1, LAMB2, LAMB3, LAMB4) · gamma (LAMC1, LAMC2, LAMC3)
Altres
ALCAM · Elastina (Tropoelastina) · Vitronectina
Queratina
/Citoqueratina
Queratines epitelials
(alfa-queratines toves)
tipus I/cromosoma 17 (10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 19, 20) · cromosoma 12 (18) · cap (21)
tipus II/cromosoma 12 (1, 2A, 3, 4, 5, 6A, 6B, 7, 8, 9)
Queratines capil·lars
(alfa-queratines dures)
tipus I/cromosoma 17 (31, 32, 33A, 33B, 34, 35, 36, 37, 38)
tipus II/cromosoma 12 (81, 82, 83, 84, 85, 86)
Alfa no agrupades
Cromosoma 17 (23, 24, 25, 26, 27, 28, 39, 40)
Cromosoma 12 (71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80)
No alfa
Beta-queratina
Altres