EIF4A3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF4A3, DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, eukaryotic translation initiation factor 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608546 MGI: 1923731 HomoloGene: 5602 GeneCards: EIF4A3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Richieri Costa-Pereira syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • selenocysteine insertion sequence binding • GO:0008026 helicase activity • poly(A) binding • RNA stem-loop binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ribonucleoprotein complex binding • hydrolase activity • ATP binding • mRNA binding • RNA binding • translation regulator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • exon-exon junction complex • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • glutamatergic synapse • postsynaptic cytosol • Рибонуклеопротеїни • U2-type catalytic step 1 spliceosome |
---|
Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • mRNA transport • negative regulation of translation • associative learning • GO:1904578 response to organic cyclic compound • regulation of mRNA binding • mRNA processing • positive regulation of translation • negative regulation of gene expression • negative regulation of excitatory postsynaptic potential • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus • cellular response to selenite ion • exploration behavior • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг РНК • rRNA processing • embryonic cranial skeleton morphogenesis • negative regulation of selenocysteine insertion sequence binding • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • negative regulation of selenocysteine incorporation • mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • GO:0015915 транспорт • regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 80.13 – 80.15 Mb | Хр. 11: 119.18 – 119.19 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF4A3 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 871[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATTATMATS | | GSARKRLLKE | | EDMTKVEFET | | SEEVDVTPTF | | DTMGLREDLL |
RGIYAYGFEK | | PSAIQQRAIK | | QIIKGRDVIA | | QSQSGTGKTA | | TFSISVLQCL |
DIQVRETQAL | | ILAPTRELAV | | QIQKGLLALG | | DYMNVQCHAC | | IGGTNVGEDI |
RKLDYGQHVV | | AGTPGRVFDM | | IRRRSLRTRA | | IKMLVLDEAD | | EMLNKGFKEQ |
IYDVYRYLPP | | ATQVVLISAT | | LPHEILEMTN | | KFMTDPIRIL | | VKRDELTLEG |
IKQFFVAVER | | EEWKFDTLCD | | LYDTLTITQA | | VIFCNTKRKV | | DWLTEKMREA |
NFTVSSMHGD | | MPQKERESIM | | KEFRSGASRV | | LISTDVWARG | | LDVPQVSLII |
NYDLPNNREL | | YIHRIGRSGR | | YGRKGVAINF | | VKNDDIRILR | | DIEQYYSTQI |
DEMPMNVADL | | I |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, процесинг рРНК, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Shibuya T., Tange T.O., Sonenberg N., Moore M.J. (2004). eIF4AIII binds spliced mRNA in the exon junction complex and is essential for nonsense-mediated decay. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 346—351. PMID 15034551 DOI:10.1038/nsmb750
- Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
- Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
- Shibuya T., Tange T.O., Stroupe M.E., Moore M.J. (2006). Mutational analysis of human eIF4AIII identifies regions necessary for exon junction complex formation and nonsense-mediated mRNA decay. RNA. 12: 360—374. PMID 16495234 DOI:10.1261/rna.2190706
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18683 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P38919 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|