SPTBN5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPTBN5, BSPECV, HUBSPECV, HUSPECV, spectrin beta, non-erythrocytic 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605916 MGI: 2685200 HomoloGene: 41150 GeneCards: SPTBN5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • dynactin binding • protein self-association • kinesin binding • myosin tail binding • actin binding • dynein intermediate chain binding • spectrin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • spectrin • мембрана • photoreceptor connecting cilium • photoreceptor disc membrane • цитоскелет • центр організації мікротрубочок • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • Golgi organization • MAPK cascade • axon guidance • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • actin filament capping • lysosomal transport • protein homooligomerization • actin cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 41.85 – 41.89 Mb | Хр. 2: 119.87 – 119.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPTBN5 (англ. Spectrin beta, non-erythrocytic 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 674 амінокислот, а молекулярна маса — 416 750[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGQPHSPRE | | LLGAAGHRSR | | RPSTELRVPP | | SPSLTMDSQY | | ETGHIRKLQA |
RHMQMQEKTF | | TKWINNVFQC | | GQAGIKIRNL | | YTELADGIHL | | LRLLELISGE |
ALPPPSRGRL | | RVHFLENSSR | | ALAFLRAKVP | | VPLIGPENIV | | DGDQTLILGL |
IWVIILRFQI | | SHISLDKEEF | | GASAALLSTK | | EALLVWCQRK | | TASYTNVNIT |
DFSRSWSDGL | | GFNALIHAHR | | PDLLDYGSLR | | PDRPLHNLAF | | AFLVAEQELG |
IAQLLDPEDV | | AAAQPDERSI | | MTYVSLYYHY | | CSRLHQGQTV | | QRRLTKILLQ |
LQETELLQTQ | | YEQLVADLLR | | WIAEKQMQLE | | ARDFPDSLPA | | MRQLLAAFTI |
FRTQEKPPRL | | QQRGAAEALL | | FRLQTALQAQ | | NRRPFLPHEG | | LGLAELSQCW |
AGLEWAEAAR | | SQALQQRLLQ | | LQRLETLARR | | FQHKAALRES | | FLKDAEQVLD |
QARAPPASLA | | TVEAAVQRLG | | MLEAGILPQE | | GRFQALAEIA | | DILRQEQYHS |
WADVARRQEE | | VTVRWQRLLQ | | HLQGQRKQVA | | DMQAVLSLLQ | | EVEAASHQLE |
ELQEPARSTA | | CGQQLAEVVE | | LLQRHDLLEA | | QVSAHGAHVS | | HLAQQTAELD |
SSLGTSVEVL | | QAKARTLAQL | | QQSLVALVRA | | RRALLEQTLQ | | RAEFLRNCEE |
EEAWLKECGQ | | RVGNAALGRD | | LSQIAGALQK | | HKALEAEVHR | | HQAVCVDLVR |
RGRDLSARRP | | PTQPDPGERA | | EAVQGGWQLL | | QTRVVGRGAR | | LQTALLVLQY |
FADAAEAASW | | LRERRSSLER | | ASCGQDQAAA | | ETLLRRHVRL | | ERVLRAFAAE |
LRRLEEQGRA | | ASARASLFTV | | NSALSPPGES | | LRNPGPWSEA | | SCHPGPGDAW |
KMALPAEPDP | | DFDPNTILQT | | QDHLSQDYES | | LRALAQLRRA | | RLEEAMALFG |
FCSSCGELQL | | WLEKQTVLLQ | | RVQPQADTLE | | VMQLKYENFL | | TALAVGKGLW |
AEVSSSAEQL | | RQRYPGNSTQ | | IQRQQEELSQ | | RWGQLEALKR | | EKAVQLAHSV |
EVCSFLQECG | | PTQVQLRDVL | | LQLEALQPGS | | SEDTCHALQL | | AQKKTLVLER |
RVHFLQSVVV | | KVEEPGYAES | | QPLQGQVETL | | QGLLKQVQEQ | | VAQRARRQAE |
TQARQSFLQE | | SQQLLLWAES | | VQAQLRSKEV | | SVDVASAQRL | | LREHQDLLEE |
IHLWQERLQQ | | LDAQSQPMAA | | LDCPDSQEVP | | NTLRVLGQQG | | QELKVLWEQR |
QQWLQEGLEL | | QKFGREVDGF | | TATCANHQAW | | LHLDNLGEDV | | REALSLLQQH |
REFGRLLSTL | | GPRAEALRAH | | GEKLVQSQHP | | AAHTVREQLQ | | SIQAQWTRLQ |
GRSEQRRRQL | | LASLQLQEWK | | QDVAELMQWM | | EEKGLMAAHE | | PSGARRNILQ |
TLKRHEAAES | | ELLATRRHVE | | ALQQVGRELL | | SRRPCGQEDI | | QTRLQGLRSK |
WEALNRKMTE | | RGDELQQAGQ | | QEQLLRQLQD | | AKEQLEQLEG | | ALQSSETGQD |
LRSSQRLQKR | | HQQLESESRT | | LAAKMAALAS | | MAHGMAASPA | | ILEETQKHLR |
RLELLQGHLA | | IRGLQLQASV | | ELHQFCHLSN | | MELSWVAEHM | | PHGSPTSYTE |
CLNGAQSLHR | | KHKELQVEVK | | AHQGQVQRVL | | SSGRSLAASG | | HPQAQHIVEQ |
CQELEGHWAE | | LERACEARAQ | | CLQQAVTFQQ | | YFLDVSELEG | | WVEEKRPLVS |
SRDYGRDEAA | | TLRLINKHQA | | LQEELAIYWS | | SMEELDQTAQ | | TLTGPEVPEQ |
QRVVQERLRE | | QLRALQELAA | | TRDRELEGTL | | RLHEFLREAE | | DLQGWLASQK |
QAAKGGESLG | | EDPEHALHLC | | TKFAKFQHQV | | EMGSQRVAAC | | RLLAESLLER |
GHSAGPMVRQ | | RQQDLQTAWS | | ELWELTQARG | | HALRDTETTL | | RVHRDLLEVL |
TQVQEKATSL | | PNNVARDLCG | | LEAQLRSHQG | | LERELVGTER | | QLQELLETAG |
RVQKLCPGPQ | | AHAVQQRQQA | | VTQAWAVLQR | | RMEQRRAQLE | | RARLLARFRT |
AVRDYASWAA | | RVRQDLQVEE | | SSQEPSSGPL | | KLSAHQWLRA | | ELEAREKLWQ |
QATQLGQQAL | | LAAGTPTKEV | | QEELRALQDQ | | RDQVYQTWAR | | KQERLQAEQQ |
EQLFLRECGR | | LEEILAAQEV | | SLKTSALGSS | | VEEVEQLIRK | | HEVFLKVLTA |
QDKKEAALRE | | RLKTLRRPRV | | RDRLPILLQR | | RMRVKELAES | | RGHALHASLL |
MASFTQAATQ | | AEDWIQAWAQ | | QLKEPVPPGD | | LRDKLKPLLK | | HQAFEAEVQA |
HEEVMTSVAK | | KGEALLAQSH | | PRAGEVSQRL | | QGLRKHWEDL | | RQAMALRGQE |
LEDRRNFLEF | | LQRVDLAEAW | | IQEKEVKMNV | | GDLGQDLEHC | | LQLRRRLREF |
RGNSAGDTVG | | DACIRSISDL | | SLQLKNRDPE | | EVKIICQRRS | | QLNNRWASFH |
GNLLRYQQQL | | EGALEIHVLS | | RELDNVTKRI | | QEKEALIQAL | | DCGKDLESVQ |
RLLRKHEELE | | REVHPIQAQV | | ESLEREVGRL | | CQRSPEAAHG | | LRHRQQEVAE |
SWWQLRSRAQ | | KRREALDALH | | QAQKLQAMLQ | | ELLVSAQRLR | | AQMDTSPAPR |
SPVEARRMLE | | EHQECKAELD | | SWTDSISLAR | | STGQQLLTAG | | HPFSSDIRQV |
LAGLEQELSS | | LEGAWQEHQL | | QLQQALELQL | | FLSSVEKMER | | WLCSKEDSLA |
SEGLWDPLAP | | MEPLLWKHKM | | LEWDLEVQAG | | KISALEATAR | | GLHQGGHPEA |
QSALGRCQAM | | LLRKEALFRQ | | AGTRRHRLEE | | LRQLQAFLQD | | SQEVAAWLRE |
KNLVALEEGL | | LDTAMLPAQL | | QKQQNFQAEL | | DASMHQQQEL | | QREGQRLLQG |
GHPASEAIQE | | RLEELGALWG | | ELQDNSQKKV | | AKLQKACEAL | | RLRRSMEELE |
NWLEPIEVEL | | RAPTVGQALP | | GVGELLGTQR | | ELEAAVDKKA | | RQAEALLGQA |
QAFVREGHCL | | AQDVEEQARR | | LLQRFKSLRE | | PLQERRTALE | | ARSLLLKFFR |
DADEEMAWVQ | | EKLPLAAAQD | | YGQSLSAVRH | | LQEQHQNLES | | EMSSHEALTR |
VVLGTGYKLV | | QAGHFAAHEV | | AARVQQLEKA | | MAHLRAEAAR | | RRLLLQQAQE |
AQQFLTELLE | | AGSWLAERGH | | VLDSEDMGHS | | AEATQALLRR | | LEATKRDLEA |
FSPRIERLQQ | | TAALLESRKN | | PESPKVLAQL | | QAVREAHAEL | | LRRAEARGHG |
LQEQLQLHQL | | ERETLLLDAW | | LTTKAATAES | | QDYGQDLEGV | | KVLEEKFDAF |
RKEVQSLGQA | | KVYALRKLAG | | TLERGAPRRY | | PHIQAQRSRI | | EAAWERLDQA |
IKARTENLAA | | AHEVHSFQQA | | AAELQGRMQE | | KTALMKGEDG | | GHSLSSVRTL |
QQQHRRLERE | | LEAMEKEVAR | | LQTEACRLGQ | | LHPAAPGGLA | | KVQEAWATLQ |
AKAQERGQWL | | AQAAQGHAFL | | GRCQELLAWA | | QERQELASSE | | ELAEDVAGAE |
QLLGQHEELG | | QEIRECRLQA | | QDLRQEGQQL | | VDNSHFMSAE | | VTECLQELEG |
RLQELEEAWA | | LRWQRCAESW | | GLQKLRQRLE | | QAEAWLACWE | | GLLLKPDYGH |
SVSDVELLLH | | RHQDLEKLLA | | AQEEKFAQMQ | | KTEMEQELLL | | QPQELKPGRA |
GSSLTSFQWR | | PSGHQGLGAQ | | LAETRDPQDA | | KGTPTMEGSL | | EFKQHLLPGG |
RQPSSSSWDS | | CRGNLQGSSL | | SLFLDERMAA | | EKVASIALLD | | LTGARCERLR |
GRHGRKHTFS | | LRLTSGAEIL | | FAAPSEEQAE | | SWWRALGSTA | | AQSLSPKLKA |
KPVSSLNECT | | TKDARPGCLL | | RSDP |
Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Stabach P.R., Morrow J.S. (2000). Identification and characterization of beta V spectrin, a mammalian ortholog of Drosophila beta H spectrin. J. Biol. Chem. 275: 21385—21395. PMID 10764729 DOI:10.1074/jbc.C000159200
- Odell A.F., Van Helden D.F., Scott J.L. (2008). The spectrin cytoskeleton influences the surface expression and activation of human transient receptor potential channel 4 channels. J. Biol. Chem. 283: 4395—4407. PMID 18048348 DOI:10.1074/jbc.M709729200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15680 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NRC6 (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
| Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
| Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
| Незгруповані альфа | |
---|
| Не-альфа | |
---|
|
---|
| Тип 3 | |
---|
| Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
| Тип 5 | |
---|
|
---|
| Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
| Катеніни | |
---|
| Мембранні | |
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Нелюдські | |
---|
|