TRIOBP |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIOBP, DFNB28, TAP68, TARA, dJ37E16.4, HRIHFB2122, TRIO and F-actin binding protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609761 MGI: 1349410 HomoloGene: 5104 GeneCards: TRIOBP |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal recessive nonsyndromic deafness 28[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • actin binding • ubiquitin protein ligase binding • myosin II binding |
---|
Клітинна компонента | • focal adhesion • центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • цитоскелет • midbody • actin cytoskeleton • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • barbed-end actin filament capping • regulation of actin cytoskeleton organization • клітинний цикл • поділ клітини • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • actin modification • слух • auditory receptor cell stereocilium organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_138632 NM_001039141 NM_007032 |
| | NM_001024716 NM_001039155 NM_001039156 NM_138579 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001034230 NP_008963 NP_619538 |
| | NP_001019887 NP_001034244 NP_001034245 NP_613045 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 37.7 – 37.78 Mb | Хр. 15: 78.83 – 78.89 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIOBP (англ. TRIO and F-actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 365 амінокислот, а молекулярна маса — 261 376[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEEVPGDALC | | EHFEANILTQ | | NRCQNCFHPE | | EAHGARYQEL | | RSPSGAEVPY |
CDLPRCPPAP | | EDPLSASTSG | | CQSVVDPGLR | | PGPKRGPSPS | | AGLPEEGPTA |
APRSRSRELE | | AVPYLEGLTT | | SLCGSCNEDP | | GSDPTSSPDS | | ATPDDTSNSS |
SVDWDTVERQ | | EEEAPSWDEL | | AVMIPRRPRE | | GPRADSSQRA | | PSLLTRSPVG |
GDAAGQKKED | | TGGGGRSAGQ | | HWARLRGESG | | LSLERHRSTL | | TQASSMTPHS |
GPRSTTSQAS | | PAQRDTAQAA | | STREIPRASS | | PHRITQRDTS | | RASSTQQEIS |
RASSTQQETS | | RASSTQEDTP | | RASSTQEDTP | | RASSTQWNTP | | RASSPSRSTQ |
LDNPRTSSTQ | | QDNPQTSFPT | | CTPQRENPRT | | PCVQQDDPRA | | SSPNRTTQRE |
NSRTSCAQRD | | NPKASRTSSP | | NRATRDNPRT | | SCAQRDNPRA | | SSPSRATRDN |
PTTSCAQRDN | | PRASRTSSPN | | RATRDNPRTS | | CAQRDNPRAS | | SPSRATRDNP |
TTSCAQRDNP | | RASRTSSPNR | | ATRDNPRTSC | | AQRDNPRASS | | PNRAARDNPT |
TSCAQRDNPR | | ASRTSSPNRA | | TRDNPRTSCA | | QRDNPRASSP | | NRATRDNPTT |
SCAQRDNPRA | | SRTSSPNRAT | | RDNPRTSCAQ | | RDNPRASSPN | | RTTQQDSPRT |
SCARRDDPRA | | SSPNRTIQQE | | NPRTSCALRD | | NPRASSPSRT | | IQQENPRTSC |
AQRDDPRASS | | PNRTTQQENP | | RTSCARRDNP | | RASSRNRTIQ | | RDNPRTSCAQ |
RDNPRASSPN | | RTIQQENLRT | | SCTRQDNPRT | | SSPNRATRDN | | PRTSCAQRDN |
LRASSPIRAT | | QQDNPRTCIQ | | QNIPRSSSTQ | | QDNPKTSCTK | | RDNLRPTCTQ |
RDRTQSFSFQ | | RDNPGTSSSQ | | CCTQKENLRP | | SSPHRSTQWN | | NPRNSSPHRT |
NKDIPWASFP | | LRPTQSDGPR | | TSSPSRSKQS | | EVPWASIALR | | PTQGDRPQTS |
SPSRPAQHDP | | PQSSFGPTQY | | NLPSRATSSS | | HNPGHQSTSR | | TSSPVYPAAY |
GAPLTSPEPS | | QPPCAVCIGH | | RDAPRASSPP | | RYLQHDPFPF | | FPEPRAPESE |
PPHHEPPYIP | | PAVCIGHRDA | | PRASSPPRHT | | QFDPFPFLPD | | TSDAEHQCQS |
PQHEPLQLPA | | PVCIGYRDAP | | RASSPPRQAP | | EPSLLFQDLP | | RASTESLVPS |
MDSLHECPHI | | PTPVCIGHRD | | APSFSSPPRQ | | APEPSLFFQD | | PPGTSMESLA |
PSTDSLHGSP | | VLIPQVCIGH | | RDAPRASSPP | | RHPPSDLAFL | | APSPSPGSSG |
GSRGSAPPGE | | TRHNLEREEY | | TVLADLPPPR | | RLAQRQPGPQ | | AQCSSGGRTH |
SPGRAEVERL | | FGQERRKSEA | | AGAFQAQDEG | | RSQQPSQGQS | | QLLRRQSSPA |
PSRQVTMLPA | | KQAELTRRSQ | | AEPPHPWSPE | | KRPEGDRQLQ | | GSPLPPRTSA |
RTPERELRTQ | | RPLESGQAGP | | RQPLGVWQSQ | | EEPPGSQGPH | | RHLERSWSSQ |
EGGLGPGGWW | | GCGEPSLGAA | | KAPEGAWGGT | | SREYKESWGQ | | PEAWEEKPTH |
ELPRELGKRS | | PLTSPPENWG | | GPAESSQSWH | | SGTPTAVGWG | | AEGACPYPRG |
SERRPELDWR | | DLLGLLRAPG | | EGVWARVPSL | | DWEGLLELLQ | | ARLPRKDPAG |
HRDDLARALG | | PELGPPGTND | | VPEQESHSQP | | EGWAEATPVN | | GHSPALQSQS |
PVQLPSPACT | | STQWPKIKVT | | RGPATATLAG | | LEQTGPLGSR | | STAKGPSLPE |
LQFQPEEPEE | | SEPSRGQDPL | | TDQKQADSAD | | KRPAEGKAGS | | PLKGRLVTSW |
RMPGDRPTLF | | NPFLLSLGVL | | RWRRPDLLNF | | KKGWMSILDE | | PGEPPSPSLT |
TTSTSQWKKH | | WFVLTDSSLK | | YYRDSTAEEA | | DELDGEIDLR | | SCTDVTEYAV |
QRNYGFQIHT | | KDAVYTLSAM | | TSGIRRNWIE | | ALRKTVRPTS | | APDVTKLSDS |
NKENALHSYS | | TQKGPLKAGE | | QRAGSEVISR | | GGPRKADGQR | | QALDYVELSP |
LTQASPQRAR | | TPARTPDRLA | | KQEELERDLA | | QRSEERRKWF | | EATDSRTPEV |
PAGEGPRRGL | | GAPLTEDQQN | | RLSEEIEKKW | | QELEKLPLRE | | NKRVPLTALL |
NQSRGERRGP | | PSDGHEALEK | | EVQALRAQLE | | AWRLQGEAPQ | | SALRSQEDGH |
IPPGYISQEA | | CERSLAEMES | | SHQQVMEELQ | | RHHERELQRL | | QQEKEWLLAE |
ETAATASAIE | | AMKKAYQEEL | | SRELSKTRSL | | QQGPDGLRKQ | | HQSDVEALKR |
ELQVLSEQYS | | QKCLEIGALM | | RQAEEREHTL | | RRCQQEGQEL | | LRHNQELHGR |
LSEEIDQLRG | | FIASQGMGNG | | CGRSNERSSC | | ELEVLLRVKE | | NELQYLKKEV |
QCLRDELQMM | | QKDKRFTSGK | | YQDVYVELSH | | IKTRSEREIE | | QLKEHLRLAM |
AALQEKESMR | | NSLAE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
- Seipel K., O'Brien S.P., Iannotti E., Medley Q.G., Streuli M. (2001). Tara, a novel F-actin binding protein, associates with the Trio guanine nucleotide exchange factor and regulates actin cytoskeletal organization. J. Cell Sci. 114: 389—399. PMID 11148140
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRIOBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17009 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H2D6 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
| Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Інші | - WAS
- Фібрилін
- Філамін
- Еспін
- TRIOBP
|
---|
|
---|
| Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
| Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
| Незгруповані альфа | |
---|
| Не-альфа | |
---|
|
---|
| Тип 3 | |
---|
| Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
| Тип 5 | |
---|
|
---|
| Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
| Катеніни | |
---|
| Мембранні | |
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Нелюдські | |
---|
|