ITGA4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGA4, CD49D, IA4, integrin subunit alpha 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 GeneCards: ITGA4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein antigen binding • зв'язування з іоном металу • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • fibronectin binding • cell adhesion molecule binding • coreceptor activity • C-X3-C chemokine binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • екзосома • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • cell surface • integrin alpha4-beta7 complex • integrin complex • клітинна мембрана • growth cone • neuronal cell body • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • endodermal cell differentiation • B cell differentiation • positive regulation of T cell migration • extracellular matrix organization • heterotypic cell-cell adhesion • substrate adhesion-dependent cell spreading • cellular response to cytokine stimulus • cell-matrix adhesion involved in ameboidal cell migration • cell-matrix adhesion • leukocyte tethering or rolling • Діапедез • regulation of immune response • integrin-mediated signaling pathway • leukocyte migration • positive regulation of leukocyte tethering or rolling • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of leukocyte migration • import into cell • leukocyte cell-cell adhesion • negative regulation of protein homodimerization activity • clathrin-dependent extracellular exosome endocytosis • адгезія клітин • receptor clustering • cell-cell adhesion mediated by integrin • axonogenesis involved in innervation • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus • cellular response to amyloid-beta • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • neuron projection extension • positive regulation of endothelial cell apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 181.46 – 181.54 Mb | Хр. 2: 79.09 – 79.16 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITGA4 (англ. Integrin subunit alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 114 900[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAWEARREPG | | PRRAAVRETV | | MLLLCLGVPT | | GRPYNVDTES | | ALLYQGPHNT |
LFGYSVVLHS | | HGANRWLLVG | | APTANWLANA | | SVINPGAIYR | | CRIGKNPGQT |
CEQLQLGSPN | | GEPCGKTCLE | | ERDNQWLGVT | | LSRQPGENGS | | IVTCGHRWKN |
IFYIKNENKL | | PTGGCYGVPP | | DLRTELSKRI | | APCYQDYVKK | | FGENFASCQA |
GISSFYTKDL | | IVMGAPGSSY | | WTGSLFVYNI | | TTNKYKAFLD | | KQNQVKFGSY |
LGYSVGAGHF | | RSQHTTEVVG | | GAPQHEQIGK | | AYIFSIDEKE | | LNILHEMKGK |
KLGSYFGASV | | CAVDLNADGF | | SDLLVGAPMQ | | STIREEGRVF | | VYINSGSGAV |
MNAMETNLVG | | SDKYAARFGE | | SIVNLGDIDN | | DGFEDVAIGA | | PQEDDLQGAI |
YIYNGRADGI | | SSTFSQRIEG | | LQISKSLSMF | | GQSISGQIDA | | DNNGYVDVAV |
GAFRSDSAVL | | LRTRPVVIVD | | ASLSHPESVN | | RTKFDCVENG | | WPSVCIDLTL |
CFSYKGKEVP | | GYIVLFYNMS | | LDVNRKAESP | | PRFYFSSNGT | | SDVITGSIQV |
SSREANCRTH | | QAFMRKDVRD | | ILTPIQIEAA | | YHLGPHVISK | | RSTEEFPPLQ |
PILQQKKEKD | | IMKKTINFAR | | FCAHENCSAD | | LQVSAKIGFL | | KPHENKTYLA |
VGSMKTLMLN | | VSLFNAGDDA | | YETTLHVKLP | | VGLYFIKILE | | LEEKQINCEV |
TDNSGVVQLD | | CSIGYIYVDH | | LSRIDISFLL | | DVSSLSRAEE | | DLSITVHATC |
ENEEEMDNLK | | HSRVTVAIPL | | KYEVKLTVHG | | FVNPTSFVYG | | SNDENEPETC |
MVEKMNLTFH | | VINTGNSMAP | | NVSVEIMVPN | | SFSPQTDKLF | | NILDVQTTTG |
ECHFENYQRV | | CALEQQKSAM | | QTLKGIVRFL | | SKTDKRLLYC | | IKADPHCLNF |
LCNFGKMESG | | KEASVHIQLE | | GRPSILEMDE | | TSALKFEIRA | | TGFPEPNPRV |
IELNKDENVA | | HVLLEGLHHQ | | RPKRYFTIVI | | ISSSLLLGLI | | VLLLISYVMW |
KAGFFKRQYK | | SILQEENRRD | | SWSYINSKSN | | DD |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Rubio M., Nueda A., Vara A., Corbi-Lopez A.L. (1992). A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80/70 forms of the alpha subunit of VLA4. Eur. J. Immunol. 22: 1099—1102. PMID 1551405 DOI:10.1002/eji.1830220434
- Szabo M.C., McIntyre B.W. (1995). Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit. Mol. Immunol. 32: 1453—1454. PMID 8643114 DOI:10.1016/0161-5890(96)00001-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rosen G.D., Birkenmeier T.M., Dean D.C. (1991). Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4094—4098. PMID 2034655 DOI:10.1073/pnas.88.10.4094
- Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
- Luissint A.C., Lutz P.G., Calderwood D.A., Couraud P.O., Bourdoulous S. (2008). JAM-L-mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation. J. Cell Biol. 183: 1159—1173. PMID 19064666 DOI:10.1083/jcb.200805061
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6140 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P13612 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|