ITGA5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3VI3, 3VI4, 4WJK, 4WK0, 4WK2, 4WK4 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGA5, CD49e, FNRA, VLA5A, VLA-5, integrin subunit alpha 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 135620 MGI: 96604 HomoloGene: 20508 GeneCards: ITGA5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding • virus receptor activity • epidermal growth factor receptor binding • зв'язування з іоном металу • platelet-derived growth factor receptor binding • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • alphav-beta3 integrin-vitronectin complex • мембрана • cell-cell junction • ruffle • клітинна мембрана • синапс • ruffle membrane • cell surface • integrin complex • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • external side of plasma membrane • focal adhesion • міжклітинні контакти |
---|
Біологічний процес | • leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • endodermal cell differentiation • positive regulation of cell migration • heterotypic cell-cell adhesion • wound healing, spreading of epidermal cells • extracellular matrix organization • пам'ять • cell-cell adhesion mediated by integrin • positive regulation of sprouting angiogenesis • cell-substrate adhesion • адгезія клітин • Ангіогенез • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • cell-substrate junction assembly • integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • negative regulation of anoikis • leukocyte migration • positive regulation of cell-substrate adhesion • regulation of angiogenesis • cell adhesion mediated by integrin • жіноча вагітність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/25/PBB_GE_ITGA5_201389_at_fs.png/250px-PBB_GE_ITGA5_201389_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 54.4 – 54.42 Mb | Хр. 15: 103.25 – 103.28 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITGA5 (англ. Integrin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 049 амінокислот, а молекулярна маса — 114 536[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSRTPESPL | | HAVQLRWGPR | | RRPPLLPLLL | | LLLPPPPRVG | | GFNLDAEAPA |
VLSGPPGSFF | | GFSVEFYRPG | | TDGVSVLVGA | | PKANTSQPGV | | LQGGAVYLCP |
WGASPTQCTP | | IEFDSKGSRL | | LESSLSSSEG | | EEPVEYKSLQ | | WFGATVRAHG |
SSILACAPLY | | SWRTEKEPLS | | DPVGTCYLST | | DNFTRILEYA | | PCRSDFSWAA |
GQGYCQGGFS | | AEFTKTGRVV | | LGGPGSYFWQ | | GQILSATQEQ | | IAESYYPEYL |
INLVQGQLQT | | RQASSIYDDS | | YLGYSVAVGE | | FSGDDTEDFV | | AGVPKGNLTY |
GYVTILNGSD | | IRSLYNFSGE | | QMASYFGYAV | | AATDVNGDGL | | DDLLVGAPLL |
MDRTPDGRPQ | | EVGRVYVYLQ | | HPAGIEPTPT | | LTLTGHDEFG | | RFGSSLTPLG |
DLDQDGYNDV | | AIGAPFGGET | | QQGVVFVFPG | | GPGGLGSKPS | | QVLQPLWAAS |
HTPDFFGSAL | | RGGRDLDGNG | | YPDLIVGSFG | | VDKAVVYRGR | | PIVSASASLT |
IFPAMFNPEE | | RSCSLEGNPV | | ACINLSFCLN | | ASGKHVADSI | | GFTVELQLDW |
QKQKGGVRRA | | LFLASRQATL | | TQTLLIQNGA | | REDCREMKIY | | LRNESEFRDK |
LSPIHIALNF | | SLDPQAPVDS | | HGLRPALHYQ | | SKSRIEDKAQ | | ILLDCGEDNI |
CVPDLQLEVF | | GEQNHVYLGD | | KNALNLTFHA | | QNVGEGGAYE | | AELRVTAPPE |
AEYSGLVRHP | | GNFSSLSCDY | | FAVNQSRLLV | | CDLGNPMKAG | | ASLWGGLRFT |
VPHLRDTKKT | | IQFDFQILSK | | NLNNSQSDVV | | SFRLSVEAQA | | QVTLNGVSKP |
EAVLFPVSDW | | HPRDQPQKEE | | DLGPAVHHVY | | ELINQGPSSI | | SQGVLELSCP |
QALEGQQLLY | | VTRVTGLNCT | | TNHPINPKGL | | ELDPEGSLHH | | QQKREAPSRS |
SASSGPQILK | | CPEAECFRLR | | CELGPLHQQE | | SQSLQLHFRV | | WAKTFLQREH |
QPFSLQCEAV | | YKALKMPYRI | | LPRQLPQKER | | QVATAVQWTK | | AEGSYGVPLW |
IIILAILFGL | | LLLGLLIYIL | | YKLGFFKRSL | | PYGTAMEKAQ | | LKPPATSDA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
- Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 DOI:10.1074/jbc.M111838200
- Weigel-Kelley K.A., Yoder M.C., Srivastava A. (2003). Alpha5beta1 integrin as a cellular coreceptor for human parvovirus B19: requirement of functional activation of beta1 integrin for viral entry. Blood. 102: 3927—3933. PMID 12907437 DOI:10.1182/blood-2003-05-1522
- Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
- Paule S., Aljofan M., Simon C., Rombauts L.J., Nie G. (2012). Cleavage of endometrial alpha-integrins into their functional forms is mediated by proprotein convertase 5/6. Hum. Reprod. 27: 2766—2774. PMID 22740495 DOI:10.1093/humrep/des203
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6141 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P08648 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|