MSR1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • low-density lipoprotein particle binding • amyloid-beta binding • cargo receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана • колаген • integral component of plasma membrane • мембрана • low-density lipoprotein particle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • cholesterol transport • plasma lipoprotein particle clearance • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • ендоцитоз • рецептор-опосередкований ендоцитоз • lipoprotein transport • positive regulation of cholesterol storage • phagocytosis, engulfment • negative regulation of gene expression • amyloid-beta clearance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0c/PBB_GE_MSR1_211887_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_MSR1_211887_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4e/PBB_GE_MSR1_208423_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_MSR1_208423_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/58/PBB_GE_MSR1_214770_at_fs.png/250px-PBB_GE_MSR1_214770_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_138716 NM_002445 NM_138715 NM_001363744 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_002436 NP_619729 NP_619730 NP_001350673 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 16.11 – 16.57 Mb | Хр. 8: 40.03 – 40.1 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEQWDHFHNQ | | QEDTDSCSES | | VKFDARSMTA | | LLPPNPKNSP | | SLQEKLKSFK |
AALIALYLLV | | FAVLIPLIGI | | VAAQLLKWET | | KNCSVSSTNA | | NDITQSLTGK |
GNDSEEEMRF | | QEVFMEHMSN | | MEKRIQHILD | | MEANLMDTEH | | FQNFSMTTDQ |
RFNDILLQLS | | TLFSSVQGHG | | NAIDEISKSL | | ISLNTTLLDL | | QLNIENLNGK |
IQENTFKQQE | | EISKLEERVY | | NVSAEIMAMK | | EEQVHLEQEI | | KGEVKVLNNI |
TNDLRLKDWE | | HSQTLRNITL | | IQGPPGPPGE | | KGDRGPTGES | | GPRGFPGPIG |
PPGLKGDRGA | | IGFPGSRGLP | | GYAGRPGNSG | | PKGQKGEKGS | | GNTLTPFTKV |
RLVGGSGPHE | | GRVEILHSGQ | | WGTICDDRWE | | VRVGQVVCRS | | LGYPGVQAVH |
KAAHFGQGTG | | PIWLNEVFCF | | GRESSIEECK | | IRQWGTRACS | | HSEDAGVTCT |
L |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Resnick D., Chatterton J.E., Schwartz K., Slayter H., Krieger M. (1996). Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain. J. Biol. Chem. 271: 26924—26930. PMID 8900177 DOI:10.1074/jbc.271.43.26924
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Gough P.J., Greaves D.R., Gordon S. (1998). A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake. J. Lipid Res. 39: 531—543. PMID 9548586
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7376 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P21757 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |