Толл-подобный рецептор 6 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
4OM7 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | TLR6, CD286, toll like receptor 6 |
---|
Внешние ID | OMIM: 605403 MGI: 1341296 HomoloGene: 21223 GeneCards: TLR6 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 5-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 5 C3.1|5 33.54 cM | Начало | 65,109,374 bp[2] |
---|
Конец | 65,117,440 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
| Наибольшая экспрессия в | - stroma of bone marrow
- muscle of thigh
- tibiofemoral joint
|
| |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - Toll-like receptor 2 binding
- связывание с белками плазмы
- transmembrane signaling receptor activity
- lipopeptide binding
- amyloid-beta binding
- signaling receptor binding
- signaling receptor activity
- связывание похожих белков
- protein heterodimerization activity
| Компонент клетки | - часть мембраны
- phagocytic vesicle membrane
- мембрана
- часть клеточной мембраны
- цитоплазматическая везикула
- аппарат Гольджи
- липидный рафт
- Toll-like receptor 2-Toll-like receptor 6 protein complex
- клеточная мембрана
- внутренний компонент клетки
- receptor complex
| Биологический процесс | - positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly
- immune system process
- positive regulation of JUN kinase activity
- cellular response to diacyl bacterial lipopeptide
- activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
- toll-like receptor 6 signaling pathway
- defense response to bacterium
- positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
- воспалительная реакция
- toll-like receptor TLR6:TLR2 signaling pathway
- detection of diacyl bacterial lipopeptide
- передача сигнала
- врождённый иммунитет
- T-helper 1 type immune response
- MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
- nitric oxide metabolic process
- response to bacterial lipoprotein
- microglial cell activation
- toll-like receptor signaling pathway
- cell activation
- иммунный ответ
- positive regulation of gene expression
- negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway
- TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
- positive regulation of macrophage activation
- positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
- positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
- cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus
- positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response
- positive regulation of oxidative stress-induced neuron death
- positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
- cellular response to amyloid-beta
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
NM_011604 NM_001359180 NM_001384171 |
|
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
NP_035734 NP_001346109 NP_001371100 |
|
---|
Локус (UCSC) | Chr 4: 38.82 – 38.86 Mb | Chr 5: 65.11 – 65.12 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
TLR6 (толл-подобный рецептор 6, CD286) — мембранный белок, входящий в группу толл-подобных рецепторов, обеспечивающих функционирование врождённого иммунитета. Образует гетеродимерный комплекс с TLR2, поэтому его вместе с TLR1 относят к подгруппе «TLR2». Рецептор распознаёт патоген-связанные молекулярные структуры грам-положительных бактерий и грибков. Рецептор был открыт в 1999 году. Обнаружен на поверхности моноцитов, эндотелиальных клеток кожных капилляров и некоторых других клеток.
Лиганды
TLR6 играет важную роль в функционировании врождённого иммунитета. Он образует димер с TLR2 и распознаёт патоген-связанные молекулярные структуры грам-положительных бактерий и грибков. Связывает микоплазменный макрофаг-стимулирующий липопептид-2кДа (MALP-2), растворимый туберкулёзный фактор (STF), фенол-растворимый модулин (PSM) и липопротеин протеин А внешней оболочки B.burgdorferi (OspA-L).
Структура и функции
Ген TLR6 состоит из единственного экзона и кодирует трансмембранный белок из 795 аминокислоты, обладающий 69% гомологичностью с TLR1. Рецептор способен активировать факторы транскрипции NF-kB и JNK. Передача сигнала осуществляется через адаптерные белки MyD88 и TRAF6.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174130 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000051498 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
Библиография
- Tapping R.I., Omueti K.O., Johnson C.M. Genetic polymorphisms within the human Toll-like receptor 2 subfamily (англ.) // Biochem. Soc. Trans.[англ.] : journal. — 2007. — December (vol. 35, no. Pt 6). — P. 1445—1448. — doi:10.1042/BST0351445. — PMID 18031242.
|
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|