LAMP1 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | LAMP1, CD107a, LAMPA, LGP120, lysosomal associated membrane protein 1 |
---|
Внешние ID | OMIM: 153330 MGI: 96745 HomoloGene: 4061 GeneCards: LAMP1 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![8-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1f/Ideogram_house_mouse_chromosome_8.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_8.svg.png) | Хр. | 8-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 8 A1.1|8 5.73 cM | Начало | 13,209,161 bp[2] |
---|
Конец | 13,225,338 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - visceral pleura
- inferior olivary nucleus
- dorsal motor nucleus of vagus nerve
- metanephric glomerulus
- gingival epithelium
- pancreatic ductal cell
|
| Наибольшая экспрессия в | - stroma of bone marrow
- vestibular membrane of cochlear duct
- lactiferous gland
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6b/PBB_GE_LAMP1_201553_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMP1_201553_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/15/PBB_GE_LAMP1_201551_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMP1_201551_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/PBB_GE_LAMP1_201552_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMP1_201552_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - protein domain specific binding
- virus receptor activity
- связывание с белками плазмы
- enzyme binding
| Компонент клетки | - часть мембраны
- multivesicular body
- phagolysosome membrane
- везикула
- эндосома
- late endosome
- мембрана
- синаптический пузырёк
- cytolytic granule
- меланосома
- часть клеточной мембраны
- alveolar lamellar body
- поверхность клетки
- lysosomal membrane
- neuronal cell body
- вакуоль
- дендрит
- phagocytic vesicle
- perinuclear region of cytoplasm
- Сарколемма
- лизосома
- endosome membrane
- экзосома
- цитоплазматическая везикула
- наружная сторона клеточной мембраны
- цитозоль
- цитоплазма
- клеточная мембрана
- azurophil granule membrane
- autolysosome
- ficolin-1-rich granule membrane
- integral component of synaptic vesicle membrane
- late endosome membrane
| Биологический процесс | - protein stabilization
- Golgi to lysosome transport
- positive regulation of natural killer cell degranulation
- regulation of organelle transport along microtubule
- viral entry into host cell
- вирусный процесс
- establishment of protein localization to organelle
- positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity
- granzyme-mediated apoptotic signaling pathway
- autophagic cell death
- neutrophil degranulation
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 13: 113.3 – 113.32 Mb | Chr 8: 13.21 – 13.23 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
LAMP1 (англ. Lysosomal-associated membrane protein 1) — гликопротеин лизосомальной мембраны. Вместе с другим гомологичным белком LAMP2 составляет около 50 % от всех белков мембраны лизосом. Лизосомами считаются внутриклеточные органеллы, которые содержат эти белки.
Структура
Зрелый белок LAMP1 относится к трансмембранным белкам, содержит 389 аминокислот (сигнальный пептид, направляющий вновь синтезированный белок к лизосомам и позже отщепляющийся, содержит 27 аминокислот). Белковая часть молекулы имеет молекулярную массу около 40 кДа. Однако в клетке белок сильно гликозилирован так, что его полная масса составляет около 120 кДа, поэтому когда он был открыт в 1985—1986 годах его назвали «120-кДа лизосомальный мембранный гликопротеин» (120-kDa lysosomal membrane glycoprotein, lgp120).
Около 90 % белковой молекулы находится во внутреннем пространстве лизосомы и сильное гликозилирование защищает белок от агрессивной кислой и богатой гидролазами среды. Короткий цитозольный фрагмент отличается высоким консерватизмом и сохраняется в практически неизменном виде среди млекопитающих и птиц.
Применение в клеточной биологии
Так как по определению лизосомами считаются внутриклеточные органеллы, которые содержат в своей мембране LAMP1 и LAMP2, белок используется как клеточный маркёр лизосом.
См. также
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185896 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031447 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
Библиография
- Eskelinen E.L. Roles of LAMP-1 and LAMP-2 in lysosome biogenesis and autophagy (англ.) // Mol. Aspects Med.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 27, no. 5—6. — P. 495—502. — doi:10.1016/j.mam.2006.08.005. — PMID 16973206.
- Kornfeld S., Mellman I. The biogenesis of lysosomes (англ.) // Annu. Rev. Cell Biol.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 5. — P. 483—525. — doi:10.1146/annurev.cb.05.110189.002411. — PMID 2557062.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|