JAM2 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | JAM2, C21orf43, CD322, JAM-B, JAMB, PRO245, VE-JAM, VEJAM, junctional adhesion molecule 2, IBGC8 |
---|
Внешние ID | OMIM: 606870 MGI: 1933820 HomoloGene: 10929 GeneCards: JAM2 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![16-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/Ideogram_house_mouse_chromosome_16.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_16.svg.png) | Хр. | 16-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 16|16 C3.3 | Начало | 84,571,011 bp[2] |
---|
Конец | 84,622,816 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - ventricular zone
- tendon of biceps brachii
- body of uterus
- epithelium of colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - interventricular septum
- myocardium of ventricle
- cumulus cell
- cardiac muscles
- neural layer of retina
- deep cerebellar nuclei
- epithelium of lens
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/13/PBB_GE_JAM2_219213_at_fs.png/250px-PBB_GE_JAM2_219213_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- protein heterodimerization activity
| Компонент клетки | - часть мембраны
- межклеточные контакты
- клеточная мембрана
- часть клеточной мембраны
- мембрана
- bicellular tight junction
| Биологический процесс | - negative regulation of cell adhesion
- extracellular matrix organization
- leukocyte migration
- cell-cell adhesion
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_001270407 NM_001270408 NM_021219 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001257336 NP_001257337 NP_067042 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 21: 25.64 – 25.72 Mb | Chr 16: 84.57 – 84.62 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
JAM2 (англ. Junctional adhesion molecule B, молекула адгезии плотных контактов B; CD322) — мембранный белок, молекула адгезии, локализованная в клеточных плотных контактах. Продукт гена человека JAM2[5][6][7].
Функции
Плотные контакты представляют собой один из способов межклеточной адгезии слоя эндотелиальных клеток. Они формируют непрерывный межклеточный контакт и физический барьер, который предотвращает проникновение растворённых веществ и воды через межклеточное пространство.
JAM2 относится к суперсемейству иммуноглобулинов и располагается в плотных контактах клеток высокого эндотелия венул. Белок играет роль адгезивного лиганда для взаимодействия с иммунными клетками и может участвовать в хоминге лимфоцитов во вторичных лимфоидных органах[7]. Может способствовать трансэндотелиальной миграции лимфоцитов[8]. Кроме этого, JAM2, как и JAM3, может быть вовлечён в поляризацию эндотелиальных клеток подобно белку PAR-3[9].
Взаимодействия
Взаимодействует с PARD3[9], с интегрином VLA-4 (α4β1).[10]
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154721 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053062 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Palmeri D., van Zante A., Huang C.C., Hemmerich S., Rosen S.D. Vascular endothelial junction-associated molecule, a novel member of the immunoglobulin superfamily, is localized to intercellular boundaries of endothelial cells (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2000. — August (vol. 275, no. 25). — P. 19139—19145. — doi:10.1074/jbc.M003189200. — PMID 10779521.
- ↑ Cunningham S.A., Arrate M.P., Rodriguez J.M., Bjercke R.J., Vanderslice P., Morris A.P., Brock T.A. A novel protein with homology to the junctional adhesion molecule. Characterization of leukocyte interactions (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 44). — P. 34750—34756. — doi:10.1074/jbc.M002718200. — PMID 10945976.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: JAM2 junctional adhesion molecule 2 (неопр.).
- ↑ Johnson-Léger C.A., Aurrand-Lions M., Beltraminelli N., Fasel N., Imhof B.A. Junctional adhesion molecule-2 (JAM-2) promotes lymphocyte transendothelial migration (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — October (vol. 100, no. 7). — P. 2479—2486. — doi:10.1182/blood-2001-11-0098. — PMID 12239159.
- ↑ 1 2 Ebnet K., Aurrand-Lions M., Kuhn A., Kiefer F., Butz S., Zander K., Meyer zu Brickwedde M.K., Suzuki A., Imhof B.A., Vestweber D. The junctional adhesion molecule (JAM) family members JAM-2 and JAM-3 associate with the cell polarity protein PAR-3: a possible role for JAMs in endothelial cell polarity (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2003. — October (vol. 116, no. Pt 19). — P. 3879—3891. — doi:10.1242/jcs.00704. — PMID 12953056.
- ↑ Cunningham S.A., Rodriguez J.M., Arrate M.P., Tran T.M., Brock T.A. JAM2 interacts with alpha4beta1. Facilitation by JAM3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27589—27592. — doi:10.1074/jbc.C200331200. — PMID 12070135.
Литература
- Muller W.A. Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response. (англ.) // Trends Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 24, no. 6. — P. 327—334. — doi:10.1016/S1471-4906(03)00117-0. — PMID 12810109.
- Bazzoni G. The JAM family of junctional adhesion molecules. (англ.) // Curr. Opin. Cell Biol.[англ.]. — Elsevier, 2004. — Vol. 15, no. 5. — P. 525—530. — doi:10.1016/S0955-0674(03)00104-2. — PMID 14519386.
- Hattori M., Fujiyama A., Taylor T.D., etal. The DNA sequence of human chromosome 21. (англ.) // Nature. — 2000. — Vol. 405, no. 6784. — P. 311—319. — doi:10.1038/35012518. — PMID 10830953.
- Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
- Arrate M.P., Rodriguez J.M., Tran T.M., etal. Cloning of human junctional adhesion molecule 3 (JAM3) and its identification as the JAM2 counter-receptor. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 276, no. 49. — P. 45826—45832. — doi:10.1074/jbc.M105972200. — PMID 11590146.
- Liang T.W., Chiu H.H., Gurney A., etal. Vascular endothelial-junctional adhesion molecule (VE-JAM)/JAM 2 interacts with T, NK, and dendritic cells through JAM 3. (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 168, no. 4. — P. 1618—1626. — doi:10.4049/jimmunol.168.4.1618. — PMID 11823489.
- Gardiner K., Slavov D., Bechtel L., Davisson M. Annotation of human chromosome 21 for relevance to Down syndrome: gene structure and expression analysis. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2002. — Vol. 79, no. 6. — P. 833—843. — doi:10.1006/geno.2002.6782. — PMID 12036298.
- Cunningham S.A., Rodriguez J.M., Arrate M.P., etal. JAM2 interacts with alpha4beta1. Facilitation by JAM3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 31. — P. 27589—27592. — doi:10.1074/jbc.C200331200. — PMID 12070135.
- Aurrand-Lions M., Johnson-Leger C., Lamagna C., etal. Junctional adhesion molecules and interendothelial junctions. (англ.) // Cells Tissues Organs (Print) : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 3. — P. 152—160. — doi:10.1159/000066967. — PMID 12476045.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Ebnet K., Aurrand-Lions M., Kuhn A., etal. The junctional adhesion molecule (JAM) family members JAM-2 and JAM-3 associate with the cell polarity protein PAR-3: a possible role for JAMs in endothelial cell polarity. (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2004. — Vol. 116, no. Pt 19. — P. 3879—3891. — doi:10.1242/jcs.00704. — PMID 12953056.
- Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., etal. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
- Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. (англ.) // Protein Sci.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Wiemann S., Arlt D., Huber W., etal. From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336. — PMC 528930.
- Liu T., Qian W.J., Gritsenko M.A., etal. Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry. (англ.) // J. Proteome Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 6. — P. 2070—2080. — doi:10.1021/pr0502065. — PMID 16335952. — PMC 1850943.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|