SIGLEC8 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2N7B, 2N7A |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | SIGLEC8, SAF2, SIGLEC-8, SIGLEC8L, sialic acid binding Ig like lectin 8 |
---|
Внешние ID | OMIM: 605639 MGI: 2681107 HomoloGene: 50482 GeneCards: SIGLEC8 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![7-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e4/Ideogram_house_mouse_chromosome_7.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_7.svg.png) | Хр. | 7-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 7|7 B3 | Начало | 43,000,765 bp[2] |
---|
Конец | 43,008,955 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - C1 segment
- right adrenal cortex
- left adrenal cortex
|
| Наибольшая экспрессия в | - right lung lobe
- primary oocyte
- secondary oocyte
- Intestinal villus
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/PBB_GE_SIGLEC8_216327_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIGLEC8_216327_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/85/PBB_GE_SIGLEC8_208253_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIGLEC8_208253_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/52/PBB_GE_SIGLEC8_216328_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIGLEC8_216328_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- transmembrane signaling receptor activity
- связывание углеводов
| Компонент клетки | | Биологический процесс | - агрегация клеток
- передача сигнала
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 19: 51.45 – 51.46 Mb | Chr 7: 43 – 43.01 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
SIGLEC8 (Sialic acid-binding Ig-like lectin 8; Ig-подобный лектин 8, связывающий сиаловую кислоту; CD329) — белок, молекула клеточной адгезии. Взаимодействует с сиаловыми кислотами. Продукт гена человека SIGLEC8[5][6]. Ген расположен на хромосоме 19 на расстоянии 330 kb от гена того же семейства SIGLEC9[5][7]. В семействе SIGLEC SIGLEC8 относится к подсемейству CD33-подобных белков, которые подвержены быстрым эволюционным изменениям[8][9][10].
Локализация
Siglec-8 экспрессирован на эозинофилах, тучных клетках и в меньшей степени на базофилах[8]. Уникальность белка состоит в его экспрессии иммунными эффекторными клетками при астме и аллергии. В эозинофилах и тучных клетках Siglec-8 появляется позже в развитии, т.е. на поздних этапах дифференцировки[11][12].
На тканевом уровне Siglec-8 mRNA наиболее высоко экспрессирован в лёгких, мононуклеарных клетках периферической крови, селезёнке и почках.[8]
Функции
В эозинофилах
В полном соответствии с наличием ингибирующего домена ITIM было показано, что Siglec-8 является ингибиторным иммунорегуляторным рецептором. Связывание этого рецептора вызывает апоптоз эозинофилов[13]. Связывание рецептора приводит к генерации активных форм кислорода и активации каспазы, что и вызывает апоптоз[14].
В тучных клетках
В тучных клетках связывание Siglec-8 не вызывает апоптоза, но ингибирует FcεRIα-опосредованный вход кальция и высвобождение простогландина D2 и гистамина[15]
Литература
- Munday J., Kerr S., Ni J., Cornish A. L., Zhang J. Q., Nicoll G., Floyd H., Mattei M. G., Moore P., Liu D., Crocker P. R. Identification, characterization and leucocyte expression of Siglec-10, a novel human sialic acid-binding receptor (англ.) // The Biochemical Journal[англ.] : journal. — 2001. — April (vol. 355, no. Pt 2). — P. 489—497. — doi:10.1042/0264-6021:3550489. — PMID 11284738. — PMC 1221762.
- Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y., Ota T., Nishikawa T., Yamashita R., Yamamoto J., Sekine M., Tsuritani K., Wakaguri H., Ishii S., Sugiyama T., Saito K., Isono Y., Irie R., Kushida N., Yoneyama T., Otsuka R., Kanda K., Yokoi T., Kondo H., Wagatsuma M., Murakawa K., Ishida S., Ishibashi T., Takahashi-Fujii A., Tanase T., Nagai K., Kikuchi H., Nakai K., Isogai T., Sugano S. Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2006. — January (vol. 16, no. 1). — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560. — PMC 1356129.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105366 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039013 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ 1 2 Floyd H., Ni J., Cornish A. L., Zeng Z., Liu D., Carter K. C., Steel J., Crocker P. R. Siglec-8. A novel eosinophil-specific member of the immunoglobulin superfamily (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — January (vol. 275, no. 2). — P. 861—866. — doi:10.1074/jbc.275.2.861. — PMID 10625619.
- ↑ Entrez Gene: SIGLEC8 sialic acid binding Ig-like lectin 8 (неопр.).
- ↑ Foussias G., Yousef G. M., Diamandis E. P. Molecular characterization of a Siglec8 variant containing cytoplasmic tyrosine-based motifs, and mapping of the Siglec8 gene (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2000. — November (vol. 278, no. 3). — P. 775—781. — doi:10.1006/bbrc.2000.3866. — PMID 11095983.
- ↑ 1 2 3 Kikly K. K., Bochner B. S., Freeman S. D., Tan K. B., Gallagher K. T., D'alessio K. J., Holmes S. D., Abrahamson J. A., Erickson-Miller C. L., Murdock P. R., Tachimoto H., Schleimer R. P., White J. R. Identification of SAF-2, a novel siglec expressed on eosinophils, mast cells, and basophils (англ.) // The Journal of Allergy and Clinical Immunology[англ.] : journal. — 2000. — June (vol. 105, no. 6 Pt 1). — P. 1093—1100. — doi:10.1067/mai.2000.107127. — PMID 10856141.
- ↑ Angata T., Margulies E. H., Green E. D., Varki A. Large-scale sequencing of the CD33-related Siglec gene cluster in five mammalian species reveals rapid evolution by multiple mechanisms (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2004. — September (vol. 101, no. 36). — P. 13251—13256. — doi:10.1073/pnas.0404833101. — PMID 15331780. — PMC 516556.
- ↑ Padler-Karavani V., Hurtado-Ziola N., Chang Y. C., Sonnenburg J. L., Ronaghy A., Yu H., Verhagen A., Nizet V., Chen X., Varki N., Varki A., Angata T. Rapid evolution of binding specificities and expression patterns of inhibitory CD33-related Siglecs in primates (англ.) // The FASEB Journal[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology[англ.], 2014. — March (vol. 28, no. 3). — P. 1280—1293. — doi:10.1096/fj.13-241497. — PMID 24308974. — PMC 3929681.
- ↑ Hudson S. A., Herrmann H., Du J., Cox P., ((Haddad el-B)), Butler B., Crocker P. R., Ackerman S. J., Valent P., Bochner B. S. Developmental, malignancy-related, and cross-species analysis of eosinophil, mast cell, and basophil siglec-8 expression (англ.) // Journal of Clinical Immunology[англ.] : journal. — 2011. — December (vol. 31, no. 6). — P. 1045—1053. — doi:10.1007/s10875-011-9589-4. — PMID 21938510. — PMC 3329870.
- ↑ Ellis A. K., Ackerman S. J., Crawford L., Du J., Bedi R., Denburg J. A. Cord blood molecular biomarkers of eosinophilopoiesis: kinetic analysis of GATA-1, MBP1 and IL-5R alpha mRNA expression (англ.) // Pediatric Allergy and Immunology[англ.] : journal. — 2010. — June (vol. 21, no. 4 Pt 1). — P. 640—648. — doi:10.1111/j.1399-3038.2010.01003.x. — PMID 20337967.
- ↑ Nutku E., Aizawa H., Hudson S. A., Bochner B. S. Ligation of Siglec-8: a selective mechanism for induction of human eosinophil apoptosis (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2003. — June (vol. 101, no. 12). — P. 5014—5020. — doi:10.1182/blood-2002-10-3058. — PMID 12609831.
- ↑ Nutku E., Hudson S. A., Bochner B. S. Mechanism of Siglec-8-induced human eosinophil apoptosis: role of caspases and mitochondrial injury (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2005. — October (vol. 336, no. 3). — P. 918—924. — doi:10.1016/j.bbrc.2005.08.202. — PMID 16157303.
- ↑ Yokoi H., Choi O. H., Hubbard W., Lee H. S., Canning B. J., Lee H. H., Ryu S. D., von Gunten S., Bickel C. A., Hudson S. A., Macglashan D. W., Bochner B. S. Inhibition of FcepsilonRI-dependent mediator release and calcium flux from human mast cells by sialic acid-binding immunoglobulin-like lectin 8 engagement (англ.) // The Journal of Allergy and Clinical Immunology[англ.] : journal. — 2008. — February (vol. 121, no. 2). — P. 499—505.e1. — doi:10.1016/j.jaci.2007.10.004. — PMID 18036650.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|