ATP1B3 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | ATP1B3, ATPB-3, CD298, ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 |
---|
Внешние ID | OMIM: 601867 MGI: 107788 HomoloGene: 37510 GeneCards: ATP1B3 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![9-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/41/Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg.png) | Хр. | 9-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 9 E3.3|9 50.31 cM | Начало | 96,214,708 bp[2] |
---|
Конец | 96,246,495 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - skin of thigh
- skin of hip
- gingival epithelium
- mucosa of colon
- mucosa of pharynx
- stromal cell of endometrium
- mucosa of sigmoid colon
- mucosa of transverse colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - epithelium of lens
- seminiferous tubule
- choroid plexus of fourth ventricle
- utricle
- skin of external ear
- superior surface of tongue
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - ATPase binding
- P-type sodium:potassium-exchanging transporter activity
- ATPase activator activity
| Компонент клетки | - цитоплазма
- часть мембраны
- мембрана
- меланосома
- клеточная мембрана
- sodium:potassium-exchanging ATPase complex
- Кавеола
- экзосома
| Биологический процесс | - regulation of cardiac conduction
- positive regulation of ATP-dependent activity
- positive regulation of sodium ion export across plasma membrane
- sodium ion transport
- cellular sodium ion homeostasis
- sodium ion export across plasma membrane
- metal ion transport
- positive regulation of potassium ion import across plasma membrane
- protein stabilization
- ion transport
- cellular potassium ion homeostasis
- potassium ion transport
- membrane repolarization
- ion transmembrane transport
- protein localization to plasma membrane
- leukocyte migration
- positive regulation of potassium ion transmembrane transporter activity
- establishment or maintenance of transmembrane electrochemical gradient
- перенос
- potassium ion import across plasma membrane
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
NM_007502 NM_001357212 NM_001357213 |
|
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
NP_031528 NP_001344141 NP_001344142 |
|
---|
Локус (UCSC) | Chr 3: 141.88 – 141.93 Mb | Chr 9: 96.21 – 96.25 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Бета-цепь 3 Na+/K+-АТФ-азы (ATP1B3) (англ. Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3; CD298) — белок, некаталитический компонент фермента, продукт гена человека ATP1B3[5][6][7]. Бета-цепь Na+/K+-АТФ-аза, принадлежит к семейству бета-цепей Na+/K+-АТФ-аз и Н+/К+-АТФаз.
Функции
ATP1B3 входит в семейство бета-цепей Na+/K+- и Н+/К+-АТФаз. Na+/K+-АТФазы являются интегральными белками, которые отвечают за установку и обеспечение электрохимических градиентов ионов натрия и калия на плазматической мембране. Эти градиенты играют важную роль в осморегуляции, в натрий-связанном транспорте органических и неорганических молекул и в электрической возбудимости нервных и мышечных клеток. Фермент состоит из двух субъединиц: большой каталитической альфа-субъединицы и меньшей гликопротеиновой бета-субъединицы. Бета-субъединица является регулирующей цепью, которая модулирует каталитическую активность комплекса за счёт формирования альфа/бета гетеродимера и регулирует количество ионов натрия, перенесённых через мембрану клетки. Несколько генов кодируют бета-цепь Na+/K+-АТФазы. Ген ATP1B3 кодирует бета-цепь 3. Кроме этого, на хромосоме 2 имеется псевдоген этого гена[7].
Наиболее высокая экспрессия обнаружена в левой коронарной артерии.
Структура
Белок состоит из 279 аминокислот, молекулярная масса 31,5 кДа, содержит один иммуноглобулино-подобный домен. Более короткая изоформа 2 включает 193 аминокислоты (молекулярная масса 21,7 кДа).
См. также
Литература
- Lingrel J. B., Orlowski J., Shull M. M., Price E. M. Molecular genetics of Na,K-ATPase (неопр.) // Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol.. — 1990. — Т. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. — С. 37—89. — ISBN 978-0-12-540038-1. — doi:10.1016/S0079-6603(08)60708-4. — PMID 2158121.
- Jørgensen P. L. Mechanism of the Na+, K+ pump. Protein structure and conformations of the pure (Na+ +K+)-ATPase (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 1982. — Vol. 694, no. 1. — P. 27—68. — doi:10.1016/0304-4157(82)90013-2. — PMID 6289898.
- Chiampanichayakul S., Szekeres A., Khunkaewla P. et al. Engagement of Na,K-ATPase beta3 subunit by a specific mAb suppresses T and B lymphocyte activation (англ.) // Int. Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 14, no. 12. — P. 1407—1414. — doi:10.1093/intimm/dxf112. — PMID 12456588.
- Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Zhang H., Li X. J., Martin D. B., Aebersold R. Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2003. — Vol. 21, no. 6. — P. 660—666. — doi:10.1038/nbt827. — PMID 12754519.
- Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
- Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Chi A., Valencia J. C., Hu Z. Z. et al. Proteomic and bioinformatic characterization of the biogenesis and function of melanosomes (англ.) // J. Proteome Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 5, no. 11. — P. 3135—3144. — doi:10.1021/pr060363j. — PMID 17081065.
- Chiampanichayakul S., Khunkaewla P., Pata S., Kasinrerk W. Na, K ATPase beta3 subunit (CD298): association with alpha subunit and expression on peripheral blood cells (англ.) // Tissue Antigens[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 68, no. 6. — P. 509—517. — doi:10.1111/j.1399-0039.2006.00726.x. — PMID 17176442.
- Ewing R. M., Chu P., Elisma F. et al. Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry (англ.) // Mol. Syst. Biol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 3, no. 1. — P. 89. — doi:10.1038/msb4100134. — PMID 17353931. — PMC 1847948.
- Aughey R. J., Murphy K. T., Clark S. A. et al. Muscle Na+-K+-ATPase activity and isoform adaptations to intense interval exercise and training in well-trained athletes (англ.) // J. Appl. Physiol. : journal. — 2007. — Vol. 103, no. 1. — P. 39—47. — doi:10.1152/japplphysiol.00236.2006. — PMID 17446412.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000069849 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032412 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Malik N., Canfield V. A., Beckers M. C., Gros P., Levenson R. Identification of the mammalian Na,K-ATPase 3 subunit (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1996. — November (vol. 271, no. 37). — P. 22754—22758. — doi:10.1074/jbc.271.37.22754. — PMID 8798450.
- ↑ Malik N., Canfield V., Sanchez-Watts G., Watts A. G., Scherer S., Beatty B. G., Gros P., Levenson R. Structural organization and chromosomal localization of the human Na,K-ATPase beta 3 subunit gene and pseudogene (англ.) // Mamm Genome[англ.] : journal. — 1998. — March (vol. 9, no. 2). — P. 136—143. — doi:10.1007/s003359900704. — PMID 9457675.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: ATP1B3 ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (неопр.).
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|