SLAMF7 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | SLAMF7, 19A, CD319, CRACC, CS1, SLAM family member 7 |
---|
Внешние ID | OMIM: 606625 MGI: 1922595 HomoloGene: 49660 GeneCards: SLAMF7 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![1-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fb/Ideogram_house_mouse_chromosome_1.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_1.svg.png) | Хр. | 1-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 1|1 H3 | Начало | 171,459,971 bp[2] |
---|
Конец | 171,480,603 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - epithelium of colon
- mucosa of sigmoid colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - interventricular septum
- seminiferous tubule
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/64/PBB_GE_SLAMF7_219159_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SLAMF7_219159_s_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание похожих белков
| Компонент клетки | - часть мембраны
- клеточная мембрана
- мембрана
| Биологический процесс | - агрегация клеток
- natural killer cell activation
- врождённый иммунитет
- adaptive immune response
- natural killer cell mediated cytotoxicity
- regulation of immune response
- immune system process
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001282588 NM_001282589 NM_001282590 NM_001282591 NM_001282592
|
---|
NM_001282593 NM_001282594 NM_001282595 NM_001282596 NM_021181 |
| |
---|
RefSeq (белок) | NP_001269517 NP_001269518 NP_001269519 NP_001269520 NP_001269521
|
---|
NP_001269522 NP_001269523 NP_001269524 NP_001269525 NP_067004 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 1: 160.74 – 160.75 Mb | Chr 1: 171.46 – 171.48 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
SLAMF7 (CD319) — мембранный белок, продукт гена человека SLAMF7[5][6][7]. Белок входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации (англ. Signaling lymphocytic activation molecule, SLAM).
Является маркёром нормальных плазматических клеток и злокачественных плазматических клеток при множественной миеломе. В отличие от типического маркёра плазматических клеток CD138 SLAMF7/CD319 — более стабильный белок, что позволяет использовать его для выделения злокачественных плазматических клеток из долгохранившихся и даже замороженных образцов[8].
Роль в терапии
SLAMF7 является мишенью терапевтического моноклонального антитела элотузумаб, использующегося при рецидивах миеломной болезни.
Структура
Белок состоит из 313 аминокислот, молекулярная масса 37,4 кДа. Внеклеточный участок содержит Ig-домены типов V и C2, 7 участков N-гликозилорования и 2 дисульфидные связи.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000026751 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038179 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Murphy J.J., Hobby P., Vilarino-Varela J., Bishop B., Iordanidou P., Sutton B.J., Norton J.D. A novel immunoglobulin superfamily receptor (19A) related to CD2 is expressed on activated lymphocytes and promotes homotypic B-cell adhesion (англ.) // The Biochemical Journal[англ.] : journal. — 2002. — February (vol. 361, no. Pt 3). — P. 431—436. — doi:10.1042/0264-6021:3610431. — PMID 11802771. — PMC 1222324.
- ↑ Boles K.S., Mathew P.A. Molecular cloning of CS1, a novel human natural killer cell receptor belonging to the CD2 subset of the immunoglobulin superfamily (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2001. — February (vol. 52, no. 3—4). — P. 302—307. — doi:10.1007/s002510000274. — PMID 11220635.
- ↑ Entrez Gene: SLAMF7 SLAM family member 7 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
- ↑ Frigyesi I., Adolfsson J., Ali M., Christophersen M.K., Johnsson E., Turesson I., Gullberg U., Hansson M., Nilsson B. Robust isolation of malignant plasma cells in multiple myeloma (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2014. — February (vol. 123, no. 9). — P. 1336—1340. — doi:10.1182/blood-2013-09-529800. — PMID 24385542.
Литература
- Claus M., Meinke S., Bhat R., Watzl C. Regulation of NK cell activity by 2B4, NTB-A and CRACC (англ.) // Frontiers in Bioscience[англ.] : journal. — Frontiers in Bioscience[англ.], 2007. — Vol. 13, no. 13. — P. 956—965. — doi:10.2741/2735. — PMID 17981603.
- Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2000. — November (vol. 10, no. 11). — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
- Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., Gassenhuber J., Glassl S., Ansorge W., Böcher M., Blöcker H., Bauersachs S., Blum H., Lauber J., Düsterhöft A., Beyer A., Köhrer K., Strack N., Mewes H.W., Ottenwälder B., Obermaier B., Tampe J., Heubner D., Wambutt R., Korn B., Klein M., Poustka A. Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2001. — March (vol. 11, no. 3). — P. 422—435. — doi:10.1101/gr.GR1547R. — PMID 11230166. — PMC 311072.
- Bouchon A., Cella M., Grierson H.L., Cohen J.I., Colonna M. Activation of NK cell-mediated cytotoxicity by a SAP-independent receptor of the CD2 family (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2001. — November (vol. 167, no. 10). — P. 5517—5521. — doi:10.4049/jimmunol.167.10.5517. — PMID 11698418.
- Tovar V., del Valle J., Zapater N., Martin M., Romero X., Pizcueta P., Bosch J., Terhorst C., Engel P. Mouse novel Ly9: a new member of the expanding CD150 (SLAM) family of leukocyte cell-surface receptors (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2002. — September (vol. 54, no. 6). — P. 394—402. — doi:10.1007/s00251-002-0483-3. — PMID 12242590.
- Del Valle J.M., Engel P., Martín M. The cell surface expression of SAP-binding receptor CD229 is regulated via its interaction with clathrin-associated adaptor complex 2 (AP-2) (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — May (vol. 278, no. 19). — P. 17430—17437. — doi:10.1074/jbc.M301569200. — PMID 12621057.
- Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Science[англ.] : journal. — 2004. — October (vol. 13, no. 10). — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
- Lee J.K., Boles K.S., Mathew P.A. Molecular and functional characterization of a CS1 (CRACC) splice variant expressed in human NK cells that does not contain immunoreceptor tyrosine-based switch motifs (англ.) // European Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2004. — October (vol. 34, no. 10). — P. 2791—2799. — doi:10.1002/eji.200424917. — PMID 15368295.
- Wiemann S., Arlt D., Huber W., Wellenreuther R., Schleeger S., Mehrle A., Bechtel S., Sauermann M., Korf U., Pepperkok R., Sültmann H., Poustka A. From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2004. — October (vol. 14, no. 10B). — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336. — PMC 528930.
- Mehrle A., Rosenfelder H., Schupp I., del Val C., Arlt D., Hahne F., Bechtel S., Simpson J., Hofmann O., Hide W., Glatting K.H., Huber W., Pepperkok R., Poustka A., Wiemann S. The LIFEdb database in 2006 (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2006. — January (vol. 34, no. Database issue). — P. D415—8. — doi:10.1093/nar/gkj139. — PMID 16381901. — PMC 1347501.
- Stark S., Watzl C. 2B4 (CD244), NTB-A and CRACC (CS1) stimulate cytotoxicity but no proliferation in human NK cells (англ.) // International Immunology[англ.] : journal. — 2006. — February (vol. 18, no. 2). — P. 241—247. — doi:10.1093/intimm/dxh358. — PMID 16410313.
- Lee J.K., Mathew S.O., Vaidya S.V., Kumaresan P.R., Mathew P.A. CS1 (CRACC, CD319) induces proliferation and autocrine cytokine expression on human B lymphocytes (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 179, no. 7). — P. 4672—4678. — doi:10.4049/jimmunol.179.7.4672. — PMID 17878365.
- Malaer J.D., Mathew P.A. CS1 (SLAMF7, CD319) is an effective immunotherapeutic target for multiple myeloma (англ.) // American Journal of Cancer Research[англ.] : journal. — 2017. — August (vol. 7, no. 8). — P. 1637—1641. — PMID 28861320.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|