CACNA1E |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CACNA1E, BII, CACH6, CACNL1A6, Cav2.3, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E, gm139, EIEE69, DEE69 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601013 MGI: 106217 HomoloGene: 20185 GeneCards: CACNA1E |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
bepridil hydrochloride monohydrate[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • high voltage-gated calcium channel activity • ion channel activity • calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • voltage-gated calcium channel complex • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • membrane depolarization during action potential • regulation of insulin secretion • regulation of ion transmembrane transport • membrane depolarization • ion transport • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion transport • chemical synaptic transmission • calcium ion import |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000721 NM_001205293 NM_001205294 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000712 NP_001192222 NP_001192223 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 181.32 – 181.81 Mb | Хр. 1: 154.27 – 154.76 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CACNA1E (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 313 амінокислот, а молекулярна маса — 261 731[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARFGEAVVA | | RPGSGDGDSD | | QSRNRQGTPV | | PASGQAAAYK | | QTKAQRARTM |
ALYNPIPVRQ | | NCFTVNRSLF | | IFGEDNIVRK | | YAKKLIDWPP | | FEYMILATII |
ANCIVLALEQ | | HLPEDDKTPM | | SRRLEKTEPY | | FIGIFCFEAG | | IKIVALGFIF |
HKGSYLRNGW | | NVMDFIVVLS | | GILATAGTHF | | NTHVDLRTLR | | AVRVLRPLKL |
VSGIPSLQIV | | LKSIMKAMVP | | LLQIGLLLFF | | AILMFAIIGL | | EFYSGKLHRA |
CFMNNSGILE | | GFDPPHPCGV | | QGCPAGYECK | | DWIGPNDGIT | | QFDNILFAVL |
TVFQCITMEG | | WTTVLYNTND | | ALGATWNWLY | | FIPLIIIGSF | | FVLNLVLGVL |
SGEFAKERER | | VENRRAFMKL | | RRQQQIEREL | | NGYRAWIDKA | | EEVMLAEENK |
NAGTSALEVL | | RRATIKRSRT | | EAMTRDSSDE | | HCVDISSVGT | | PLARASIKSA |
KVDGVSYFRH | | KERLLRISIR | | HMVKSQVFYW | | IVLSLVALNT | | ACVAIVHHNQ |
PQWLTHLLYY | | AEFLFLGLFL | | LEMSLKMYGM | | GPRLYFHSSF | | NCFDFGVTVG |
SIFEVVWAIF | | RPGTSFGISV | | LRALRLLRIF | | KITKYWASLR | | NLVVSLMSSM |
KSIISLLFLL | | FLFIVVFALL | | GMQLFGGRFN | | FNDGTPSANF | | DTFPAAIMTV |
FQILTGEDWN | | EVMYNGIRSQ | | GGVSSGMWSA | | IYFIVLTLFG | | NYTLLNVFLA |
IAVDNLANAQ | | ELTKDEQEEE | | EAFNQKHALQ | | KAKEVSPMSA | | PNMPSIERDR |
RRRHHMSMWE | | PRSSHLRERR | | RRHHMSVWEQ | | RTSQLRKHMQ | | MSSQEALNRE |
EAPTMNPLNP | | LNPLSSLNPL | | NAHPSLYRRP | | RAIEGLALGL | | ALEKFEEERI |
SRGGSLKGDG | | GDRSSALDNQ | | RTPLSLGQRE | | PPWLARPCHG | | NCDPTQQEAG |
GGEAVVTFED | | RARHRQSQRR | | SRHRRVRTEG | | KESSSASRSR | | SASQERSLDE |
AMPTEGEKDH | | ELRGNHGAKE | | PTIQEERAQD | | LRRTNSLMVS | | RGSGLAGGLD |
EADTPLVLPH | | PELEVGKHVV | | LTEQEPEGSS | | EQALLGNVQL | | DMGRVISQSE |
PDLSCITANT | | DKATTESTSV | | TVAIPDVDPL | | VDSTVVHISN | | KTDGEASPLK |
EAEIREDEEE | | VEKKKQKKEK | | RETGKAMVPH | | SSMFIFSTTN | | PIRRACHYIV |
NLRYFEMCIL | | LVIAASSIAL | | AAEDPVLTNS | | ERNKVLRYFD | | YVFTGVFTFE |
MVIKMIDQGL | | ILQDGSYFRD | | LWNILDFVVV | | VGALVAFALA | | NALGTNKGRD |
IKTIKSLRVL | | RVLRPLKTIK | | RLPKLKAVFD | | CVVTSLKNVF | | NILIVYKLFM |
FIFAVIAVQL | | FKGKFFYCTD | | SSKDTEKECI | | GNYVDHEKNK | | MEVKGREWKR |
HEFHYDNIIW | | ALLTLFTVST | | GEGWPQVLQH | | SVDVTEEDRG | | PSRSNRMEMS |
IFYVVYFVVF | | PFFFVNIFVA | | LIIITFQEQG | | DKMMEECSLE | | KNERACIDFA |
ISAKPLTRYM | | PQNRHTFQYR | | VWHFVVSPSF | | EYTIMAMIAL | | NTVVLMMKYY |
SAPCTYELAL | | KYLNIAFTMV | | FSLECVLKVI | | AFGFLNYFRD | | TWNIFDFITV |
IGSITEIILT | | DSKLVNTSGF | | NMSFLKLFRA | | ARLIKLLRQG | | YTIRILLWTF |
VQSFKALPYV | | CLLIAMLFFI | | YAIIGMQVFG | | NIKLDEESHI | | NRHNNFRSFF |
GSLMLLFRSA | | TGEAWQEIML | | SCLGEKGCEP | | DTTAPSGQNE | | NERCGTDLAY |
VYFVSFIFFC | | SFLMLNLFVA | | VIMDNFEYLT | | RDSSILGPHH | | LDEFVRVWAE |
YDRAACGRIH | | YTEMYEMLTL | | MSPPLGLGKR | | CPSKVAYKRL | | VLMNMPVAED |
MTVHFTSTLM | | ALIRTALDIK | | IAKGGADRQQ | | LDSELQKETL | | AIWPHLSQKM |
LDLLVPMPKA | | SDLTVGKIYA | | AMMIMDYYKQ | | SKVKKQRQQL | | EEQKNAPMFQ |
RMEPSSLPQE | | IIANAKALPY | | LQQDPVSGLS | | GRSGYPSMSP | | LSPQDIFQLA |
CMDPADDGQF | | QERQSLEPEV | | SELKSVQPSN | | HGIYLPSDTQ | | EHAGSGRASS |
MPRLTVDPQV | | VTDPSSMRRS | | FSTIRDKRSN | | SSWLEEFSME | | RSSENTYKSR |
RRSYHSSLRL | | SAHRLNSDSG | | HKSDTHRSGG | | RERGRSKERK | | HLLSPDVSRC |
NSEERGTQAD | | WESPERRQSR | | SPSEGRSQTP | | NRQGTGSLSE | | SSIPSVSDTS |
TPRRSRRQLP | | PVPPKPRPLL | | SYSSLIRHAG | | SISPPADGSE | | EGSPLTSQAL |
ESNNACLTES | | SNSPHPQQSQ | | HASPQRYISE | | PYLALHEDSH | | ASDCGEEETL |
TFEAAVATSL | | GRSNTIGSAP | | PLRHSWQMPN | | GHYRRRRRGG | | PGPGMMCGAV |
NNLLSDTEED | | DKC |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Mori M.X., Vander Kooi C.W., Leahy D.J., Yue D.T. (2008). Crystal structure of the CaV2 IQ domain in complex with Ca2+/calmodulin: high-resolution mechanistic implications for channel regulation by Ca2+. Structure. 16: 607—620. PMID 18400181 DOI:10.1016/j.str.2008.01.011
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1392 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q15878 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|