CACNA1G |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CACNA1G, Ca(V)T.1, Cav3.1, NBR13, SCA42, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G, SCA42ND |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604065 MGI: 1201678 HomoloGene: 22544 GeneCards: CACNA1G |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хвороба Альцгеймера, spinocerebellar ataxia type 42[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Анандамід, mibefradil, bepridil hydrochloride monohydrate[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • voltage-gated calcium channel activity • calcium channel activity • scaffold protein binding • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • voltage-gated calcium channel activity involved in AV node cell action potential • voltage-gated calcium channel activity involved SA node cell action potential • low voltage-gated calcium channel activity • voltage-gated sodium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • voltage-gated calcium channel complex • цитоплазма • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • membrane depolarization during action potential • calcium ion import • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • regulation of atrial cardiac muscle cell membrane depolarization • ion transport • регуляція серцевого ритму • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • трансмембранний транспорт • потенціал дії • response to nickel cation • calcium ion transport • chemical synaptic transmission • AV node cell to bundle of His cell signaling • regulation of heart rate by cardiac conduction • SA node cell action potential • AV node cell action potential • SA node cell to atrial cardiac muscle cell signaling • membrane depolarization during AV node cell action potential • calcium ion transmembrane transport • membrane depolarization during SA node cell action potential • cardiac muscle cell action potential involved in contraction • neuronal action potential • sodium ion transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001256324 NM_001256325 NM_001256326 NM_001256327 NM_001256328
| NM_001256329 NM_001256330 NM_001256331 NM_001256332 NM_001256333 NM_001256334 NM_001256359 NM_001256360 NM_001256361 NM_018896 NM_198376 NM_198377 NM_198378 NM_198379 NM_198380 NM_198382 NM_198383 NM_198384 NM_198385 NM_198386 NM_198387 NM_198388 NM_198396 NM_198397 |
| | NM_001112813 NM_001177888 NM_001177890 NM_009783 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001243253 NP_001243254 NP_001243255 NP_001243256 NP_001243257
| NP_001243258 NP_001243259 NP_001243260 NP_001243261 NP_001243262 NP_001243263 NP_001243288 NP_001243289 NP_001243290 NP_061496 NP_938190 NP_938191 NP_938192 NP_938193 NP_938194 NP_938196 NP_938197 NP_938198 NP_938199 NP_938200 NP_938201 NP_938202 NP_938406 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 50.56 – 50.63 Mb | Хр. 11: 94.3 – 94.37 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CACNA1G (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 377 амінокислот, а молекулярна маса — 262 472[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDEEEDGAGA | | EESGQPRSFM | | RLNDLSGAGG | | RPGPGSAEKD | | PGSADSEAEG |
LPYPALAPVV | | FFYLSQDSRP | | RSWCLRTVCN | | PWFERISMLV | | ILLNCVTLGM |
FRPCEDIACD | | SQRCRILQAF | | DDFIFAFFAV | | EMVVKMVALG | | IFGKKCYLGD |
TWNRLDFFIV | | IAGMLEYSLD | | LQNVSFSAVR | | TVRVLRPLRA | | INRVPSMRIL |
VTLLLDTLPM | | LGNVLLLCFF | | VFFIFGIVGV | | QLWAGLLRNR | | CFLPENFSLP |
LSVDLERYYQ | | TENEDESPFI | | CSQPRENGMR | | SCRSVPTLRG | | DGGGGPPCGL |
DYEAYNSSSN | | TTCVNWNQYY | | TNCSAGEHNP | | FKGAINFDNI | | GYAWIAIFQV |
ITLEGWVDIM | | YFVMDAHSFY | | NFIYFILLII | | VGSFFMINLC | | LVVIATQFSE |
TKQRESQLMR | | EQRVRFLSNA | | STLASFSEPG | | SCYEELLKYL | | VYILRKAARR |
LAQVSRAAGV | | RVGLLSSPAP | | LGGQETQPSS | | SCSRSHRRLS | | VHHLVHHHHH |
HHHHYHLGNG | | TLRAPRASPE | | IQDRDANGSR | | RLMLPPPSTP | | ALSGAPPGGA |
ESVHSFYHAD | | CHLEPVRCQA | | PPPRSPSEAS | | GRTVGSGKVY | | PTVHTSPPPE |
TLKEKALVEV | | AASSGPPTLT | | SLNIPPGPYS | | SMHKLLETQS | | TGACQSSCKI |
SSPCLKADSG | | ACGPDSCPYC | | ARAGAGEVEL | | ADREMPDSDS | | EAVYEFTQDA |
QHSDLRDPHS | | RRQRSLGPDA | | EPSSVLAFWR | | LICDTFRKIV | | DSKYFGRGIM |
IAILVNTLSM | | GIEYHEQPEE | | LTNALEISNI | | VFTSLFALEM | | LLKLLVYGPF |
GYIKNPYNIF | | DGVIVVISVW | | EIVGQQGGGL | | SVLRTFRLMR | | VLKLVRFLPA |
LQRQLVVLMK | | TMDNVATFCM | | LLMLFIFIFS | | ILGMHLFGCK | | FASERDGDTL |
PDRKNFDSLL | | WAIVTVFQIL | | TQEDWNKVLY | | NGMASTSSWA | | ALYFIALMTF |
GNYVLFNLLV | | AILVEGFQAE | | EISKREDASG | | QLSCIQLPVD | | SQGGDANKSE |
SEPDFFSPSL | | DGDGDRKKCL | | ALVSLGEHPE | | LRKSLLPPLI | | IHTAATPMSL |
PKSTSTGLGE | | ALGPASRRTS | | SSGSAEPGAA | | HEMKSPPSAR | | SSPHSPWSAA |
SSWTSRRSSR | | NSLGRAPSLK | | RRSPSGERRS | | LLSGEGQESQ | | DEEESSEEER |
ASPAGSDHRH | | RGSLEREAKS | | SFDLPDTLQV | | PGLHRTASGR | | GSASEHQDCN |
GKSASGRLAR | | ALRPDDPPLD | | GDDADDEGNL | | SKGERVRAWI | | RARLPACCLE |
RDSWSAYIFP | | PQSRFRLLCH | | RIITHKMFDH | | VVLVIIFLNC | | ITIAMERPKI |
DPHSAERIFL | | TLSNYIFTAV | | FLAEMTVKVV | | ALGWCFGEQA | | YLRSSWNVLD |
GLLVLISVID | | ILVSMVSDSG | | TKILGMLRVL | | RLLRTLRPLR | | VISRAQGLKL |
VVETLMSSLK | | PIGNIVVICC | | AFFIIFGILG | | VQLFKGKFFV | | CQGEDTRNIT |
NKSDCAEASY | | RWVRHKYNFD | | NLGQALMSLF | | VLASKDGWVD | | IMYDGLDAVG |
VDQQPIMNHN | | PWMLLYFISF | | LLIVAFFVLN | | MFVGVVVENF | | HKCRQHQEEE |
EARRREEKRL | | RRLEKKRRNL | | MLDDVIASGS | | SASAASEAQC | | KPYYSDYSRF |
RLLVHHLCTS | | HYLDLFITGV | | IGLNVVTMAM | | EHYQQPQILD | | EALKICNYIF |
TVIFVLESVF | | KLVAFGFRRF | | FQDRWNQLDL | | AIVLLSIMGI | | TLEEIEVNAS |
LPINPTIIRI | | MRVLRIARVL | | KLLKMAVGMR | | ALLDTVMQAL | | PQVGNLGLLF |
MLLFFIFAAL | | GVELFGDLEC | | DETHPCEGLG | | RHATFRNFGM | | AFLTLFRVST |
GDNWNGIMKD | | TLRDCDQEST | | CYNTVISPIY | | FVSFVLTAQF | | VLVNVVIAVL |
MKHLEESNKE | | AKEEAELEAE | | LELEMKTLSP | | QPHSPLGSPF | | LWPGVEGPDS |
PDSPKPGALH | | PAAHARSASH | | FSLEHPTDRQ | | LFDTISLLIQ | | GSLEWELKLM |
DELAGPGGQP | | SAFPSAPSLG | | GSDPQIPLAE | | MEALSLTSEI | | VSEPSCSLAL |
TDDSLPDDMH | | TLLLSALESN | | MQPHPTELPG | | PDLLTVRKSG | | VSRTHSLPND |
SYMCRHGSTA | | EGPLGHRGWG | | LPKAQSGSVL | | SVHSQPADTS | | YILQLPKDAP |
HLLQPHSAPT | | WGTIPKLPPP | | GRSPLAQRPL | | RRQAAIRTDS | | LDVQGLGSRE |
DLLAEVSGPS | | PPLARAYSFW | | GQSSTQAQQH | | SRSHSKISKH | | MTPPAPCPGP |
EPNWGKGPPE | | TRSSLELDTE | | LSWISGDLLP | | PGGQEEPPSP | | RDLKKCYSVE |
AQSCQRRPTS | | WLDEQRRHSI | | AVSCLDSGSQ | | PHLGTDPSNL | | GGQPLGGPGS |
RPKKKLSPPS | | ITIDPPESQG | | PRTPPSPGIC | | LRRRAPSSDS | | KDPLASGPPD |
SMAASPSPKK | | DVLSLSGLSS | | DPADLDP |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- Mittman S., Guo J., Agnew W.S. (1999). Structure and alternative splicing of the gene encoding alpha1G, a human brain T calcium channel alpha1 subunit. Neurosci. Lett. 274: 143—146. PMID 10548410 DOI:10.1016/S0304-3940(99)00716-8
- Cribbs L.L., Gomora J.C., Daud A.N., Lee J.-H., Perez-Reyes E. (2000). Molecular cloning and functional expression of ca(v)3.1c, a T-type calcium channel from human brain. FEBS Lett. 466: 54—58. PMID 10648811 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01756-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Toyota M., Ho C., Ohe-Toyota M., Baylin S.B., Issa J.-P.J. (1999). Inactivation of CACNA1G, a T-type calcium channel gene, by aberrant methylation of its 5' CpG island in human tumors. Cancer Res. 59: 4535—4541. PMID 10493502
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CACNA1G переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1394 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O43497 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|