KCNK4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3UM7, 4I9W, 4RUE, 4RUF, 4WFE, 4WFF, 4WFG, 4WFH | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNK4, K2p4.1, TRAAK, TRAAK1, potassium two pore domain channel subfamily K member 4, FHEIG |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605720 MGI: 1298234 HomoloGene: 7391 GeneCards: KCNK4 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Рилузол[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • potassium channel activity • mechanosensitived potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • temperature-gated cation channel activity • potassium ion leak channel activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • potassium channel complex |
---|
Біологічний процес | • sensory perception of temperature stimulus • regulation of ion transmembrane transport • cellular response to alkaline pH • пам'ять • ion transport • cellular response to temperature stimulus • potassium ion transport • cellular response to mechanical stimulus • cellular response to fatty acid • potassium ion transmembrane transport • sensory perception of pain • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of touch • stabilization of membrane potential |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e3/PBB_GE_KCNK4_219883_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNK4_219883_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016611 NM_033310 NM_001317090 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 64.29 – 64.3 Mb | Хр. 19: 6.9 – 6.91 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNK4 (англ. Potassium two pore domain channel subfamily K member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 42 704[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRSTTLLALL | | ALVLLYLVSG | | ALVFRALEQP | | HEQQAQRELG | | EVREKFLRAH |
PCVSDQELGL | | LIKEVADALG | | GGADPETNST | | SNSSHSAWDL | | GSAFFFSGTI |
ITTIGYGNVA | | LRTDAGRLFC | | IFYALVGIPL | | FGILLAGVGD | | RLGSSLRHGI |
GHIEAIFLKW | | HVPPELVRVL | | SAMLFLLIGC | | LLFVLTPTFV | | FCYMEDWSKL |
EAIYFVIVTL | | TTVGFGDYVA | | GADPRQDSPA | | YQPLVWFWIL | | LGLAYFASVL |
TTIGNWLRVV | | SRRTRAEMGG | | LTAQAASWTG | | TVTARVTQRA | | GPAAPPPEKE |
QPLLPPPPCP | | AQPLGRPRSP | | SPPEKAQPPS | | PPTASALDYP | | SENLAFIDES |
SDTQSERGCP | | LPRAPRGRRR | | PNPPRKPVRP | | RGPGRPRDKG | | VPV |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Lesage F., Maingret F., Lazdunski M. (2000). Cloning and expression of human TRAAK, a polyunsaturated fatty acids-activated and mechano-sensitive K(+) channel. FEBS Lett. 471: 137—140. PMID 10767409 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01388-0
- Ozaita A., Vega-Saenz de Miera E. (2002). Cloning of two transcripts, HKT4.1a and HKT4.1b, from the human two-pore K+ channel gene KCNK4. Chromosomal localization, tissue distribution and functional expression. Brain Res. Mol. Brain Res. 102: 18—27. PMID 12191490 DOI:10.1016/S0169-328X(02)00157-2
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Brohawn S.G., del Marmol J., MacKinnon R. (2012). Crystal structure of the human K2P TRAAK, a lipid- and mechano-sensitive K+ ion channel. Science. 335: 436—441. PMID 22282805 DOI:10.1126/science.1213808
- Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2013). Domain-swapped chain connectivity and gated membrane access in a Fab-mediated crystal of the human TRAAK K+ channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 2129—2134. PMID 23341632 DOI:10.1073/pnas.1218950110
- Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2014). Physical mechanism for gating and mechanosensitivity of the human TRAAK K+ channel. Nature. 516: 126—130. PMID 25471887 DOI:10.1038/nature14013
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium two pore domain channel subfamily K member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6279 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NYG8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|