CLCN5 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/81/Protein_CLCN5_PDB_2j9l.png/250px-Protein_CLCN5_PDB_2j9l.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2J9L, 2JA3 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCN5, CLC5, CLCK2, ClC-5, DENTS, NPHL1, NPHL2, XLRH, XRN, hCIC-K2, chloride voltage-gated channel 5, DENT1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300008 MGI: 99486 HomoloGene: 73872 GeneCards: CLCN5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • ion channel activity • ATP binding • chloride channel activity • antiporter activity • voltage-gated chloride channel activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • solute:proton antiporter activity • chloride ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • Golgi membrane • apical part of cell • integral component of plasma membrane • lysosomal membrane • endosome membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • клітинна мембрана • early endosome |
---|
Біологічний процес | • виділення • ion transport • ion transmembrane transport • regulation of anion transmembrane transport • chloride transport • chloride transmembrane transport • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт • proton transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f4/PBB_GE_CLCN5_206704_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCN5_206704_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000084 NM_001127898 NM_001127899 NM_001272102 NM_001282163 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000075 NP_001121370 NP_001121371 NP_001259031 NP_001269092 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 49.92 – 50.1 Mb | Хр. X: 7.02 – 7.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCN5 (англ. Chloride voltage-gated channel 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 746 амінокислот, а молекулярна маса — 83 147[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDFLEEPIPG | | VGTYDDFNTI | | DWVREKSRDR | | DRHREITNKS | | KESTWALIHS |
VSDAFSGWLL | | MLLIGLLSGS | | LAGLIDISAH | | WMTDLKEGIC | | TGGFWFNHEH |
CCWNSEHVTF | | EERDKCPEWN | | SWSQLIISTD | | EGAFAYIVNY | | FMYVLWALLF |
AFLAVSLVKV | | FAPYACGSGI | | PEIKTILSGF | | IIRGYLGKWT | | LVIKTITLVL |
AVSSGLSLGK | | EGPLVHVACC | | CGNILCHCFN | | KYRKNEAKRR | | EVLSAAAAAG |
VSVAFGAPIG | | GVLFSLEEVS | | YYFPLKTLWR | | SFFAALVAAF | | TLRSINPFGN |
SRLVLFYVEF | | HTPWHLFELV | | PFILLGIFGG | | LWGALFIRTN | | IAWCRKRKTT |
QLGKYPVIEV | | LVVTAITAIL | | AFPNEYTRMS | | TSELISELFN | | DCGLLDSSKL |
CDYENRFNTS | | KGGELPDRPA | | GVGVYSAMWQ | | LALTLILKIV | | ITIFTFGMKI |
PSGLFIPSMA | | VGAIAGRLLG | | VGMEQLAYYH | | QEWTVFNSWC | | SQGADCITPG |
LYAMVGAAAC | | LGGVTRMTVS | | LVVIMFELTG | | GLEYIVPLMA | | AAMTSKWVAD |
ALGREGIYDA | | HIRLNGYPFL | | EAKEEFAHKT | | LAMDVMKPRR | | NDPLLTVLTQ |
DSMTVEDVET | | IISETTYSGF | | PVVVSRESQR | | LVGFVLRRDL | | IISIENARKK |
QDGVVSTSII | | YFTEHSPPLP | | PYTPPTLKLR | | NILDLSPFTV | | TDLTPMEIVV |
DIFRKLGLRQ | | CLVTHNGRLL | | GIITKKDVLK | | HIAQMANQDP | | DSILFN |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Meyer S., Savaresi S., Forster I.C., Dutzler R. (2007). Nucleotide recognition by the cytoplasmic domain of the human chloride transporter ClC-5. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 60—67. PMID 17195847 DOI:10.1038/nsmb1188
- Schurman S.J., Norden A.G., Scheinman S.J. (1998). X-linked recessive nephrolithiasis: presentation and diagnosis in children. J. Pediatr. 132: 859—862. PMID 9602200 DOI:10.1016/S0022-3476(98)70318-X
- Smith A.J., Reed A.A., Loh N.Y., Thakker R.V., Lippiat J.D. (2009). Characterization of Dent's disease mutations of CLC-5 reveals a correlation between functional and cell biological consequences and protein structure. Am. J. Physiol. 296: F390—F397. PMID 19019917 DOI:10.1152/ajprenal.90526.2008
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2023 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P51795 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|