KCNIP1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c6/Protein_KCNIP1_PDB_1s1e.png/250px-Protein_KCNIP1_PDB_1s1e.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1S1E, 2I2R, 2NZ0 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNIP1, KCHIP1, VABP, potassium voltage-gated channel interacting protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 GeneCards: KCNIP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • potassium channel regulator activity • potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • cell projection • дендрит (нейробіологія) • мембрана |
---|
Біологічний процес | • potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cardiac conduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/PBB_GE_KCNIP1_221307_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNIP1_221307_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001034837 NM_001034838 NM_001278339 NM_001278340 NM_014592 |
| | NM_001190885 NM_001190886 NM_001290690 NM_027398 NM_001363115 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001030009 NP_001030010 NP_001265268 NP_001265269 NP_055407 |
| | NP_001177814 NP_001177815 NP_001277619 NP_081674 NP_001350044 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 170.35 – 170.74 Mb | Хр. 11: 33.58 – 33.94 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNIP1 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 817[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGAVMGTFSS | | LQTKQRRPSK | | DIAWWYYQYQ | | RDKIEDELEM | | TMVCHRPEGL |
EQLEAQTNFT | | KRELQVLYRG | | FKNECPSGVV | | NEDTFKQIYA | | QFFPHGDAST |
YAHYLFNAFD | | TTQTGSVKFE | | DFVTALSILL | | RGTVHEKLRW | | TFNLYDINKD |
GYINKEEMMD | | IVKAIYDMMG | | KYTYPVLKED | | TPRQHVDVFF | | QKMDKNKDGI |
VTLDEFLESC | | QEDDNIMRSL | | QLFQNVM |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Van Hoorick D., Raes A., Keysers W., Mayeur E., Snyders D.J. (2003). Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants. Mol. Cell. Neurosci. 24: 357—366. PMID 14572458 DOI:10.1016/S1044-7431(03)00174-X
- Lin Y.-L., Lin S.-R., Wu T.T., Chang L.-S. (2004). Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 720—724. PMID 15184042 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.05.064
- Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
- Pioletti M., Findeisen F., Hura G.L., Minor D.L. Jr. (2006). Three-dimensional structure of the KChIP1-Kv4.3 T1 complex reveals a cross-shaped octamer. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 987—995. PMID 17057713 DOI:10.1038/nsmb1164
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15521 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NZI2 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|