CNGB1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNGB1, CNCG2, CNCG3L, CNCG4, CNG4, CNGB1B, GAR1, GARP, GARP2, RCNC2, RCNCb, RCNCbeta, RP45, cyclic nucleotide gated channel beta 1, cyclic nucleotide gated channel subunit beta 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600724 HomoloGene: 993 GeneCards: CNGB1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
retinitis pigmentosa 45[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • intracellular cyclic nucleotide activated cation channel activity • cyclic nucleotide-gated ion channel activity • cAMP binding • cGMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligand-gated ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • intracellular cGMP-activated cation channel activity • intracellular cAMP-activated cation channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • Golgi membrane • photoreceptor outer segment • ciliary membrane • Golgi-associated vesicle membrane • transmembrane transporter complex • terminal bouton • intracellular cyclic nucleotide activated cation channel complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • protein localization to organelle • відповідь на стимул • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway • regulation of membrane potential • cation transport • ion transport • photoreceptor cell outer segment organization • cation transmembrane transport • detection of light stimulus involved in visual perception • sensory perception of smell • retina homeostasis • photoreceptor cell maintenance • зір • rhodopsin mediated signaling pathway • phototransduction • regulation of cytosolic calcium ion concentration • potassium ion transmembrane transport • protein heterotetramerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/37/PBB_GE_CNGB1_210769_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNGB1_210769_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/31/PBB_GE_CNGB1_211099_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNGB1_211099_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4e/PBB_GE_CNGB1_207342_at_fs.png/250px-PBB_GE_CNGB1_207342_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001135639 NM_001286130 NM_001297 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001129111 NP_001273059 NP_001288 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 57.88 – 57.97 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNGB1 (англ. Cyclic nucleotide gated channel beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 251 амінокислот, а молекулярна маса — 139 678[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLGWVQRVLP | | QPPGTPRKTK | | MQEEEEVEPE | | PEMEAEVEPE | | PNPEEAETES |
ESMPPEESFK | | EEEVAVADPS | | PQETKEAALT | | STISLRAQGA | | EISEMNSPSR |
RVLTWLMKGV | | EKVIPQPVHS | | ITEDPAQILG | | HGSTGDTGCT | | DEPNEALEAQ |
DTRPGLRLLL | | WLEQNLERVL | | PQPPKSSEVW | | RDEPAVATGA | | ASDPAPPGRP |
QEMGPKLQAR | | ETPSLPTPIP | | LQPKEEPKEA | | PAPEPQPGSQ | | AQTSSLPPTR |
DPARLVAWVL | | HRLEMALPQP | | VLHGKIGEQE | | PDSPGICDVQ | | TISILPGGQV |
EPDLVLEEVE | | PPWEDAHQDV | | STSPQGTEVV | | PAYEEENKAV | | EKMPRELSRI |
EEEKEDEEEE | | EEEEEEEEEE | | EVTEVLLDSC | | VVSQVGVGQS | | EEDGTRPQST |
SDQKLWEEVG | | EEAKKEAEEK | | AKEEAEEVAE | | EEAEKEPQDW | | AETKEEPEAE |
AEAASSGVPA | | TKQHPEVQVE | | DTDADSCPLM | | AEENPPSTVL | | PPPSPAKSDT |
LIVPSSASGT | | HRKKLPSEDD | | EAEELKALSP | | AESPVVAWSD | | PTTPKDTDGQ |
DRAASTASTN | | SAIINDRLQE | | LVKLFKERTE | | KVKEKLIDPD | | VTSDEESPKP |
SPAKKAPEPA | | PDTKPAEAEP | | VEEEHYCDML | | CCKFKHRPWK | | KYQFPQSIDP |
LTNLMYVLWL | | FFVVMAWNWN | | CWLIPVRWAF | | PYQTPDNIHH | | WLLMDYLCDL |
IYFLDITVFQ | | TRLQFVRGGD | | IITDKKDMRN | | NYLKSRRFKM | | DLLSLLPLDF |
LYLKVGVNPL | | LRLPRCLKYM | | AFFEFNSRLE | | SILSKAYVYR | | VIRTTAYLLY |
SLHLNSCLYY | | WASAYQGLGS | | THWVYDGVGN | | SYIRCYYFAV | | KTLITIGGLP |
DPKTLFEIVF | | QLLNYFTGVF | | AFSVMIGQMR | | DVVGAATAGQ | | TYYRSCMDST |
VKYMNFYKIP | | KSVQNRVKTW | | YEYTWHSQGM | | LDESELMVQL | | PDKMRLDLAI |
DVNYNIVSKV | | ALFQGCDRQM | | IFDMLKRLRS | | VVYLPNDYVC | | KKGEIGREMY |
IIQAGQVQVL | | GGPDGKSVLV | | TLKAGSVFGE | | ISLLAVGGGN | | RRTANVVAHG |
FTNLFILDKK | | DLNEILVHYP | | ESQKLLRKKA | | RRMLRSNNKP | | KEEKSVLILP |
PRAGTPKLFN | | AALAMTGKMG | | GKGAKGGKLA | | HLRARLKELA | | ALEAAAKQQE |
LVEQAKSSQD | | VKGEEGSAAP | | DQHTHPKEAA | | TDPPAPRTPP | | EPPGSPPSSP |
PPASLGRPEG | | EEEGPAEPEE | | HSVRICMSPG | | PEPGEQILSV | | KMPEEREEKA |
E |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у мембрані.
Література
- Grunwald M.E., Yu W.P., Yu H.H., Yau K.W. (1998). Identification of a domain on the beta-subunit of the rod cGMP-gated cation channel that mediates inhibition by calcium-calmodulin. J. Biol. Chem. 273: 9148—9157. PMID 9535905 DOI:10.1074/jbc.273.15.9148
- Ardell M.D., Bedsole D.L., Schoborg R.V., Pittler S.J. (2000). Genomic organization of the human rod photoreceptor cGMP-gated cation channel beta-subunit gene. Gene. 245: 311—318. PMID 10717482 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00023-8
- Bradley J., Boenigk W., Yau K.-W., Frings S. (2004). Calmodulin permanently associates with rat olfactory CNG channels under native conditions. Nat. Neurosci. 7: 705—710. PMID 15195096 DOI:10.1038/nn1266
- Pentia D.C., Hosier S., Cote R.H. (2006). The glutamic acid-rich protein-2 (GARP2) is a high affinity rod photoreceptor phosphodiesterase (PDE6)-binding protein that modulates its catalytic properties. J. Biol. Chem. 281: 5500—5505. PMID 16407240 DOI:10.1074/jbc.M507488200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNGB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2151 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14028 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|