KCNT2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNT2, KCa4.2, SLICK, SLO2.1, potassium sodium-activated channel subfamily T member 2, EIEE57, DEE57 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610044 MGI: 3036273 HomoloGene: 16121 GeneCards: KCNT2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
early infantile epileptic encephalopathy 57[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
niflumic acid, tetraethylammonium[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • voltage-gated potassium channel activity • ATP binding • nucleotide binding • potassium channel activity • calcium-activated potassium channel activity • intracellular sodium activated potassium channel activity • outward rectifier potassium channel activity • chloride-activated potassium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • voltage-gated potassium channel complex • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана |
---|
Біологічний процес | • potassium ion transmembrane transport • potassium ion transport • ion transport • regulation of membrane potential • potassium ion export across plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001287819 NM_001287820 NM_198503 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001274748 NP_001274749 NP_940905 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 196.23 – 196.61 Mb | Хр. 1: 140.17 – 140.54 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNT2 (англ. Potassium sodium-activated channel subfamily T member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 135 амінокислот, а молекулярна маса — 130 501[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVDLESEVPP | | LPPRYRFRDL | | LLGDQGWQND | | DRVQVEFYMN | | ENTFKERLKL |
FFIKNQRSSL | | RIRLFNFSLK | | LLSCLLYIIR | | VLLENPSQGN | | EWSHIFWVNR |
SLPLWGLQVS | | VALISLFETI | | LLGYLSYKGN | | IWEQILRIPF | | ILEIINAVPF |
IISIFWPSLR | | NLFVPVFLNC | | WLAKHALENM | | INDLHRAIQR | | TQSAMFNQVL |
ILISTLLCLI | | FTCICGIQHL | | ERIGKKLNLF | | DSLYFCIVTF | | STVGFGDVTP |
ETWSSKLFVV | | AMICVALVVL | | PIQFEQLAYL | | WMERQKSGGN | | YSRHRAQTEK |
HVVLCVSSLK | | IDLLMDFLNE | | FYAHPRLQDY | | YVVILCPTEM | | DVQVRRVLQI |
PMWSQRVIYL | | QGSALKDQDL | | LRAKMDDAEA | | CFILSSRCEV | | DRTSSDHQTI |
LRAWAVKDFA | | PNCPLYVQIL | | KPENKFHIKF | | ADHVVCEEEF | | KYAMLALNCI |
CPATSTLITL | | LVHTSRGQEG | | QQSPEQWQKM | | YGRCSGNEVY | | HIVLEESTFF |
AEYEGKSFTY | | ASFHAHKKFG | | VCLIGVRRED | | NKNILLNPGP | | RYIMNSTDIC |
FYINITKEEN | | SAFKNQDQQR | | KSNVSRSFYH | | GPSRLPVHSI | | IASMGTVAID |
LQDTSCRSAS | | GPTLSLPTEG | | SKEIRRPSIA | | PVLEVADTSS | | IQTCDLLSDQ |
SEDETTPDEE | | MSSNLEYAKG | | YPPYSPYIGS | | SPTFCHLLHE | | KVPFCCLRLD |
KSCQHNYYED | | AKAYGFKNKL | | IIVAAETAGN | | GLYNFIVPLR | | AYYRPKKELN |
PIVLLLDNPP | | DMHFLDAICW | | FPMVYYMVGS | | IDNLDDLLRC | | GVTFAANMVV |
VDKESTMSAE | | EDYMADAKTI | | VNVQTLFRLF | | SSLSIITELT | | HPANMRFMQF |
RAKDCYSLAL | | SKLEKKERER | | GSNLAFMFRL | | PFAAGRVFSI | | SMLDTLLYQS |
FVKDYMISIT | | RLLLGLDTTP | | GSGFLCSMKI | | TADDLWIRTY | | ARLYQKLCSS |
TGDVPIGIYR | | TESQKLTTSE | | SQISISVEEW | | EDTKDSKEQG | | HHRSNHRNST |
SSDQSDHPLL | | RRKSMQWARR | | LSRKGPKHSG | | KTAEKITQQR | | LNLYRRSERQ |
ELAELVKNRM | | KHLGLSTVGY | | DEMNDHQSTL | | SYILINPSPD | | TRIELNDVVY |
LIRPDPLAYL | | PNSEPSRRNS | | ICNVTGQDSR | | EETQL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium sodium-activated channel subfamily T member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18866 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q6UVM3 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|