GJD2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GJD2, CX36, GJA9, gap junction protein delta 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607058 MGI: 1334209 HomoloGene: 7734 GeneCards: GJD2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
carbenoxolone, flufenamic acid, 1-Октанол[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • gap junction channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • щілинні контакти • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • connexin complex • мембрана |
---|
Біологічний процес | • потенціал дії • cell communication • cell-cell signaling • зір • chemical synaptic transmission • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fb/PBB_GE_GJA9_221407_at_fs.png/250px-PBB_GE_GJA9_221407_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 34.75 – 34.75 Mb | Хр. 2: 113.84 – 113.84 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GJD2 (англ. Gap junction protein delta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 321 амінокислот, а молекулярна маса — 36 093[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEWTILERL | | LEAAVQQHST | | MIGRILLTVV | | VIFRILIVAI | | VGETVYDDEQ |
TMFVCNTLQP | | GCNQACYDRA | | FPISHIRYWV | | FQIIMVCTPS | | LCFITYSVHQ |
SAKQRERRYS | | TVFLALDRDP | | PESIGGPGGT | | GGGGSGGGKR | | EDKKLQNAIV |
NGVLQNTENT | | SKETEPDCLE | | VKELTPHPSG | | LRTASKSKLR | | RQEGISRFYI |
IQVVFRNALE | | IGFLVGQYFL | | YGFSVPGLYE | | CNRYPCIKEV | | ECYVSRPTEK |
TVFLVFMFAV | | SGICVVLNLA | | ELNHLGWRKI | | KLAVRGAQAK | | RKSIYEIRNK |
DLPRVSVPNF | | GRTQSSDSAY | | V |
Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Belluardo N., Trovato-Salinaro A., Mudo G., Hurd Y.L., Condorelli D.F. (1999). Structure, chromosomal localization, and brain expression of human Cx36 gene. J. Neurosci. Res. 57: 740—752. PMID 10462698 DOI:10.1002/(SICI)1097-4547(19990901)57:5<740::AID-JNR16>3.0.CO;2-Z
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kitano T., Liu Y.-H., Ueda S., Saitou N. (2004). Human-specific amino acid changes found in 103 protein-coding genes. Mol. Biol. Evol. 21: 936—944. PMID 15014171 DOI:10.1093/molbev/msh100
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Gap junction protein delta 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19154 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UKL4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|