KCNJ4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNJ4, HIR, HIRK2, HRK1, IRK-3, IRK3, Kir2.3, potassium voltage-gated channel subfamily J member 4, potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600504 MGI: 104743 HomoloGene: 3653 GeneCards: KCNJ4 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Арахідонова кислота, Путресцин, SCH-23390, spermidine, spermine, tetraethylammonium, гідрон[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated ion channel activity • PDZ domain binding • inward rectifier potassium channel activity • G-protein activated inward rectifier potassium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • синапс • cytoplasmic vesicle membrane • voltage-gated potassium channel complex • міжклітинні контакти • integral component of membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • basolateral plasma membrane • postsynaptic membrane • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • potassium ion import across plasma membrane • cardiac conduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e1/PBB_GE_KCNJ4_211451_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNJ4_211451_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c1/PBB_GE_KCNJ4_208359_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNJ4_208359_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 38.43 – 38.46 Mb | Хр. 15: 79.37 – 79.39 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNJ4 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily J member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 49 500[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHGHSRNGQA | | HVPRRKRRNR | | FVKKNGQCNV | | YFANLSNKSQ | | RYMADIFTTC |
VDTRWRYMLM | | IFSAAFLVSW | | LFFGLLFWCI | | AFFHGDLEAS | | PGVPAAGGPA |
AGGGGAAPVA | | PKPCIMHVNG | | FLGAFLFSVE | | TQTTIGYGFR | | CVTEECPLAV |
IAVVVQSIVG | | CVIDSFMIGT | | IMAKMARPKK | | RAQTLLFSHH | | AVISVRDGKL |
CLMWRVGNLR | | KSHIVEAHVR | | AQLIKPYMTQ | | EGEYLPLDQR | | DLNVGYDIGL |
DRIFLVSPII | | IVHEIDEDSP | | LYGMGKEELE | | SEDFEIVVIL | | EGMVEATAMT |
TQARSSYLAS | | EILWGHRFEP | | VVFEEKSHYK | | VDYSRFHKTY | | EVAGTPCCSA |
RELQESKITV | | LPAPPPPPSA | | FCYENELALM | | SQEEEEMEEE | | AAAAAAVAAG |
LGLEAGSKEE | | AGIIRMLEFG | | SHLDLERMQA | | SLPLDNISYR | | RESAI |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.
Література
- Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1994). Primary structure and characterization of a small-conductance inwardly rectifying potassium channel from human hippocampus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6240—6244. PMID 8016146 DOI:10.1073/pnas.91.13.6240
- Tang W., Yang X.-C. (1994). Cloning a novel human brain inward rectifier potassium channel and its functional expression in Xenopus oocytes. FEBS Lett. 348: 239—243. PMID 8034048 DOI:10.1016/0014-5793(94)00612-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Coulter K.L., Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1995). Identification and molecular localization of a pH-sensing domain for the inward rectifier potassium channel HIR. Neuron. 15: 1157—1168. PMID 7576658 DOI:10.1016/0896-6273(95)90103-5
- Makhina E.N., Kelly A.J., Lopatin A.N., Mercer R.W., Nichols C.G. (1994). Cloning and expression of a novel human brain inward rectifier potassium channel. J. Biol. Chem. 269: 20468—20474. PMID 8051145
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6265 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P48050 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|