CLIC2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e3/Protein_CLIC2_PDB_2PER.png/250px-Protein_CLIC2_PDB_2PER.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2PER, 2R4V, 2R5G | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLIC2, CLIC2b, MRXS32, XAP121, chloride intracellular channel 2, CLCNL2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300138 HomoloGene: 48010 GeneCards: CLIC2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
X-linked intellectual disability-cardiomegaly-congestive heart failure syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • glutathione transferase activity • voltage-gated ion channel activity • glutathione peroxidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • chloride channel complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • positive regulation of binding • chloride transport • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular oxidant detoxification • glutathione metabolic process • chloride transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c8/PBB_GE_CLIC2_213415_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLIC2_213415_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 155.28 – 155.33 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLIC2 (англ. Chloride intracellular channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 28 356[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGLRPGTQV | | DPEIELFVKA | | GSDGESIGNC | | PFCQRLFMIL | | WLKGVKFNVT |
TVDMTRKPEE | | LKDLAPGTNP | | PFLVYNKELK | | TDFIKIEEFL | | EQTLAPPRYP |
HLSPKYKESF | | DVGCNLFAKF | | SAYIKNTQKE | | ANKNFEKSLL | | KEFKRLDDYL |
NTPLLDEIDP | | DSAEEPPVSR | | RLFLDGDQLT | | LADCSLLPKL | | NIIKVAAKKY |
RDFDIPAEFS | | GVWRYLHNAY | | AREEFTHTCP | | EDKEIENTYA | | NVAKQKS |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Heiss N.S., Poustka A. (1997). Genomic structure of a novel chloride channel gene, CLIC2, in Xq28. Genomics. 45: 224—228. PMID 9339381 DOI:10.1006/geno.1997.4922
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fan L., Yu W., Zhu X. (2003). Interaction of sedlin with chloride intracellular channel proteins. FEBS Lett. 540: 77—80. PMID 12681486 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00228-X
- Board P.G., Coggan M., Watson S., Gage P.W., Dulhunty A.F. (2004). CLIC-2 modulates cardiac ryanodine receptor Ca2+ release channels. Int. J. Biochem. Cell Biol. 36: 1599—1612. PMID 15147738 DOI:10.1016/j.biocel.2004.01.026
- Dulhunty A.F., Pouliquin P., Coggan M., Gage P.W., Board P.G. (2005). A recently identified member of the glutathione transferase structural family modifies cardiac RyR2 substate activity, coupled gating and activation by Ca2+ and ATP. Biochem. J. 390: 333—343. PMID 15916532 DOI:10.1042/BJ20042113
- Mi W., Liang Y.-H., Li L., Su X.-D. (2008). The crystal structure of human chloride intracellular channel protein 2: a disulfide bond with functional implications. Proteins. 71: 509—513. PMID 18186468 DOI:10.1002/prot.21922
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLIC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2063 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15247 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|