KCNIP3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNIP3, CSEN, DREAM, KCHIP3, potassium voltage-gated channel interacting protein 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604662 MGI: 1929258 HomoloGene: 8382 GeneCards: KCNIP3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • calcium ion binding • sequence-specific DNA binding • potassium channel activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • voltage-gated ion channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • potassium channel regulator activity • transmembrane transporter binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • axon terminus • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • аксон • дендрит (нейробіологія) • protein-DNA complex • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of ion transmembrane transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ion transport • transcription, DNA-templated • potassium ion transport • potassium ion transmembrane transport • protein localization to plasma membrane • intracellular protein transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • cardiac conduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001111331 NM_001291005 NM_019789 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001104801 NP_001277934 NP_062763 |
|
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 2: 127.3 – 127.36 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNIP3 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 256 амінокислот, а молекулярна маса — 29 231[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQPAKEVTKA | | SDGSLLGDLG | | HTPLSKKEGI | | KWQRPRLSRQ | | ALMRCCLVKW |
ILSSTAPQGS | | DSSDSELELS | | TVRHQPEGLD | | QLQAQTKFTK | | KELQSLYRGF |
KNECPTGLVD | | EDTFKLIYAQ | | FFPQGDATTY | | AHFLFNAFDA | | DGNGAIHFED |
FVVGLSILLR | | GTVHEKLKWA | | FNLYDINKDG | | YITKEEMLAI | | MKSIYDMMGR |
HTYPILREDA | | PAEHVERFFE | | KMDRNQDGVV | | TIEEFLEACQ | | KDENIMSSMQ |
LFENVI |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.
Література
- Carrion A.M., Link W.A., Ledo F., Mellstrom B., Naranjo J.R. (1999). DREAM is a Ca2+-regulated transcriptional repressor. Nature. 398: 80—84. PMID 10078534 DOI:10.1038/18044
- Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kunjilwar K., Strang C., DeRubeis D., Pfaffinger P.J. (2004). KChIP3 rescues the functional expression of Shal channel tetramerization mutants. J. Biol. Chem. 279: 54542—54551. PMID 15485870 DOI:10.1074/jbc.M409721200
- Jerng H.H., Kunjilwar K., Pfaffinger P.J. (2005). Multiprotein assembly of Kv4.2, KChIP3 and DPP10 produces ternary channel complexes with ISA-like properties. J. Physiol. (Lond.). 568: 767—788. PMID 16123112 DOI:10.1113/jphysiol.2005.087858
- Jerng H.H., Pfaffinger P.J. (2008). Multiple Kv channel-interacting proteins contain an N-terminal transmembrane domain that regulates Kv4 channel trafficking and gating. J. Biol. Chem. 283: 36046—36059. PMID 18957440 DOI:10.1074/jbc.M806852200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15523 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2W7 (англ.) . Архів оригіналу за 15 листопада 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|