CLCNKA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCNKA, CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, chloride voltage-gated channel Ka |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602024 MGI: 1930643 HomoloGene: 107317 GeneCards: CLCNKA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Bartter disease type 4b[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
niflumic acid, DIDS[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • chloride channel activity • voltage-gated chloride channel activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • chloride channel complex • мембрана |
---|
Біологічний процес | • ion transmembrane transport • chloride transport • виділення • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • трансмембранний транспорт • chloride transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/40/PBB_GE_CLCNKA_207047_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCNKA_207047_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004070 NM_001042704 NM_001257139 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001036169 NP_001244068 NP_004061 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 16.02 – 16.03 Mb | Хр. 4: 141.13 – 141.14 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCNKA (англ. Chloride voltage-gated channel Ka) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 75 285[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEELVGLREG | | FSGDPVTLQE | | LWGPCPHIRR | | AIQGGLEWLK | | QKVFRLGEDW |
YFLMTLGVLM | | ALVSYAMNFA | | IGCVVRAHQW | | LYREIGDSHL | | LRYLSWTVYP |
VALVSFSSGF | | SQSITPSSGG | | SGIPELKTML | | AGVILEDYLD | | IKNFGAKVVG |
LSCTLATGST | | LFLGKVGPFV | | HLSVMIAAYL | | GRVRTTTIGE | | PENKSKQNEM |
LVAAAAVGVA | | TVFAAPFSGV | | LFSIEVMSSH | | FSVRDYWRGF | | FAATCGAFIF |
RLLAVFNSEQ | | ETITSLYKTS | | FRVDVPFDLP | | EIFFFVALGG | | ICGVLSCAYL |
FCQRTFLSFI | | KTNRYSSKLL | | ATSKPVYSAL | | ATLLLASITY | | PPGVGHFLAS |
RLSMKQHLDS | | LFDNHSWALM | | TQNSSPPWPE | | ELDPQHLWWE | | WYHPRFTIFG |
TLAFFLVMKF | | WMLILATTIP | | MPAGYFMPIF | | ILGAAIGRLL | | GEALAVAFPE |
GIVTGGVTNP | | IMPGGYALAG | | AAAFSGAVTH | | TISTALLAFE | | LTGQIVHALP |
VLMAVLAANA | | IAQSCQPSFY | | DGTIIVKKLP | | YLPRILGRNI | | GSHHVRVEHF |
MNHSITTLAK | | DTPLEEVVKV | | VTSTDVTEYP | | LVESTESQIL | | VGIVQRAQLV |
QALQAEPPSR | | APGHQQCLQD | | ILARGCPTEP | | VTLTLFSETT | | LHQAQNLFKL |
LNLQSLFVTS | | RGRAVGCVSW | | VEMKKAISNL | | TNPPAPK |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у мембрані.
Література
- Kieferle S., Fong P., Bens M., Vandewalle A., Jentsch T. (1994). Two highly homologous members of the ClC chloride channel family in both rat and human kidney. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6943—6947. PMID 8041726 DOI:10.1073/pnas.91.15.6943
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gradogna A., Fenollar-Ferrer C., Forrest L.R., Pusch M. (2012). Dissecting a regulatory calcium-binding site of CLC-K kidney chloride channels. J. Gen. Physiol. 140: 681—696. PMID 23148261 DOI:10.1085/jgp.201210878
- Markovic S., Dutzler R. (2007). The structure of the cytoplasmic domain of the chloride channel ClC-Ka reveals a conserved interaction interface. Structure. 15: 715—725. PMID 17562318 DOI:10.1016/j.str.2007.04.013
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLCNKA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel Ka переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2026 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P51800 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|