CLCC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCC1, MCLC, chloride channel CLIC like 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617539 MGI: 2385186 HomoloGene: 9032 GeneCards: CLCC1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • chloride channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • клітинне ядро • chloride channel complex • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • chloride transport • chloride transmembrane transport • ion transport • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015127 NM_001048210 NM_001278202 NM_001278203 |
| | NM_001177770 NM_001177771 NM_145543 NM_001355632 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001041675 NP_001265131 NP_001265132 NP_055942 NP_001364387
| NP_001364388 NP_001364389 NP_001364390 NP_001364391 NP_001364392 NP_001364393 NP_001364394 NP_001364395 NP_001364396 NP_001364397 NP_001364398 NP_001364399 |
| | NP_001171241 NP_001171242 NP_663518 NP_001342561 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 108.93 – 108.96 Mb | Хр. 3: 108.56 – 108.59 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCC1 (англ. Chloride channel CLIC like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 62 023[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLCSLLLCEC | | LLLVAGYAHD | | DDWIDPTDML | | NYDAASGTMR | | KSQAKYGISG |
EKDVSPDLSC | | ADEISECYHK | | LDSLTYKIDE | | CEKKKREDYE | | SQSNPVFRRY |
LNKILIEAGK | | LGLPDENKGD | | MHYDAEIILK | | RETLLEIQKF | | LNGEDWKPGA |
LDDALSDILI | | NFKFHDFETW | | KWRFEDSFGV | | DPYNVLMVLL | | CLLCIVVLVA |
TELWTYVRWY | | TQLRRVLIIS | | FLFSLGWNWM | | YLYKLAFAQH | | QAEVAKMEPL |
NNVCAKKMDW | | TGSIWEWFRS | | SWTYKDDPCQ | | KYYELLLVNP | | IWLVPPTKAL |
AVTFTTFVTE | | PLKHIGKGTG | | EFIKALMKEI | | PALLHLPVLI | | IMALAILSFC |
YGAGKSVHVL | | RHIGGPESEP | | PQALRPRDRR | | RQEEIDYRPD | | GGAGDADFHY |
RGQMGPTEQG | | PYAKTYEGRR | | EILRERDVDL | | RFQTGNKSPE | | VLRAFDVPDA |
EAREHPTVVP | | SHKSPVLDTK | | PKETGGILGE | | GTPKESSTES | | SQSAKPVSGQ |
DTSGNTEGSP | | AAEKAQLKSE | | AAGSPDQGST | | YSPARGVAGP | | RGQDPVSSPC |
G |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.
Література
- Nagasawa M., Kanzaki M., Iino Y., Morishita Y., Kojima I. (2001). Identification of a novel chloride channel expressed in the endoplasmic reticulum, Golgi apparatus, and nucleus. J. Biol. Chem. 276: 20413—20418. PMID 11279057 DOI:10.1074/jbc.M100366200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride channel CLIC like 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29675 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q96S66 (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|