TRPC4AP |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC4AP, C20orf188, PPP1R158, TRRP4AP, TRUSS, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608430 MGI: 1930751 HomoloGene: 9224 GeneCards: TRPC4AP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинна мембрана • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex |
---|
Біологічний процес | • calcium ion transmembrane transport • Убіквітин-залежний протеоліз • hair follicle maturation • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2a/PBB_GE_TRPC4AP_212059_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPC4AP_212059_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 35 – 35.09 Mb | Хр. 2: 155.48 – 155.53 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC4AP (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 90 852[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAPVAAGS | | GAGRGRRSAA | | TVAAWGGWGG | | RPRPGNILLQ | | LRQGQLTGRG |
LVRAVQFTET | | FLTERDKQSK | | WSGIPQLLLK | | LHTTSHLHSD | | FVECQNILKE |
ISPLLSMEAM | | AFVTEERKLT | | QETTYPNTYI | | FDLFGGVDLL | | VEILMRPTIS |
IRGQKLKISD | | EMSKDCLSIL | | YNTCVCTEGV | | TKRLAEKNDF | | VIFLFTLMTS |
KKTFLQTATL | | IEDILGVKKE | | MIRLDEVPNL | | SSLVSNFDQQ | | QLANFCRILA |
VTISEMDTGN | | DDKHTLLAKN | | AQQKKSLSLG | | PSAAEINQAA | | LLSIPGFVER |
LCKLATRKVS | | ESTGTASFLQ | | ELEEWYTWLD | | NALVLDALMR | | VANEESEHNQ |
ASIVFPPPGA | | SEENGLPHTS | | ARTQLPQSMK | | IMHEIMYKLE | | VLYVLCVLLM |
GRQRNQVHRM | | IAEFKLIPGL | | NNLFDKLIWR | | KHSASALVLH | | GHNQNCDCSP |
DITLKIQFLR | | LLQSFSDHHE | | NKYLLLNNQE | | LNELSAISLK | | ANIPEVEAVL |
NTDRSLVCDG | | KRGLLTRLLQ | | VMKKEPAESS | | FRFWQARAVE | | SFLRGTTSYA |
DQMFLLKRGL | | LEHILYCIVD | | SECKSRDVLQ | | SYFDLLGELM | | KFNVDAFKRF |
NKYINTDAKF | | QVFLKQINSS | | LVDSNMLVRC | | VTLSLDRFEN | | QVDMKVAEVL |
SECRLLAYIS | | QVPTQMSFLF | | RLINIIHVQT | | LTQENVSCLN | | TSLVILMLAR |
RKERLPLYLR | | LLQRMEHSKK | | YPGFLLNNFH | | NLLRFWQQHY | | LHKDKDSTCL |
ENSSCISFSY | | WKETVSILLN | | PDRQSPSALV | | SYIEEPYMDI | | DRDFTEE |
Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Choi S.H., Wright J.B., Gerber S.A., Cole M.D. (2010). Myc protein is stabilized by suppression of a novel E3 ligase complex in cancer cells. Genes Dev. 24: 1236—1241. PMID 20551172 DOI:10.1101/gad.1920310
- Li T., Robert E.I., van Breugel P.C., Strubin M., Zheng N. (2010). A promiscuous alpha-helical motif anchors viral hijackers and substrate receptors to the CUL4-DDB1 ubiquitin ligase machinery. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 105—111. PMID 19966799 DOI:10.1038/nsmb.1719
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16181 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TEL6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|