KCND2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b9/Protein_KCND2_PDB_1nn7.png/250px-Protein_KCND2_PDB_1nn7.png) |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCND2, KV4.2, RK5, potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605410 MGI: 102663 HomoloGene: 40828 GeneCards: KCND2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
токсикоманія[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Гуанідин[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • potassium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • A-type (transient outward) potassium channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • перикаріон • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • plasma membrane raft • intrinsic component of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • dendritic spine • синапс • integral component of plasma membrane • neuronal cell body membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення |
---|
Біологічний процес | • chemical synaptic transmission • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • потенціал дії • sensory perception of pain • protein homooligomerization • cellular response to hypoxia • neuronal action potential • locomotor rhythm • regulation of postsynaptic membrane potential • cardiac conduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 120.27 – 120.75 Mb | Хр. 6: 21.22 – 21.73 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCND2 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily D member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 70 537[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAGVAAWLP | | FARAAAIGWM | | PVASGPMPAP | | PRQERKRTQD | | ALIVLNVSGT |
RFQTWQDTLE | | RYPDTLLGSS | | ERDFFYHPET | | QQYFFDRDPD | | IFRHILNFYR |
TGKLHYPRHE | | CISAYDEELA | | FFGLIPEIIG | | DCCYEEYKDR | | RRENAERLQD |
DADTDTAGES | | ALPTMTARQR | | VWRAFENPHT | | STMALVFYYV | | TGFFIAVSVI |
ANVVETVPCG | | SSPGHIKELP | | CGERYAVAFF | | CLDTACVMIF | | TVEYLLRLAA |
APSRYRFVRS | | VMSIIDVVAI | | LPYYIGLVMT | | DNEDVSGAFV | | TLRVFRVFRI |
FKFSRHSQGL | | RILGYTLKSC | | ASELGFLLFS | | LTMAIIIFAT | | VMFYAEKGSS |
ASKFTSIPAA | | FWYTIVTMTT | | LGYGDMVPKT | | IAGKIFGSIC | | SLSGVLVIAL |
PVPVIVSNFS | | RIYHQNQRAD | | KRRAQKKARL | | ARIRAAKSGS | | ANAYMQSKRN |
GLLSNQLQSS | | EDEQAFVSKS | | GSSFETQHHH | | LLHCLEKTTN | | HEFVDEQVFE |
ESCMEVATVN | | RPSSHSPSLS | | SQQGVTSTCC | | SRRHKKTFRI | | PNANVSGSHQ |
GSIQELSTIQ | | IRCVERTPLS | | NSRSSLNAKM | | EECVKLNCEQ | | PYVTTAIISI |
PTPPVTTPEG | | DDRPESPEYS | | GGNIVRVSAL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Baehring R., Boland L.M., Varghese A., Gebauer M., Pongs O. (2001). Kinetic analysis of open- and closed-state inactivation transitions in human Kv4.2 A-type potassium channels. J. Physiol. (Lond.). 535: 65—81. PMID 11507158 DOI:10.1111/j.1469-7793.2001.00065.x
- Bertaso F., Sharpe C.C., Hendry B.M., James A.F. (2002). Expression of voltage-gated K+ channels in human atrium. Basic Res. Cardiol. 97: 424—433. PMID 12395204 DOI:10.1007/s00395-002-0377-4
- Jerng H.H., Qian Y., Pfaffinger P.J. (2004). Modulation of Kv4.2 channel expression and gating by dipeptidyl peptidase 10 (DPP10). Biophys. J. 87: 2380—2396. PMID 15454437 DOI:10.1529/biophysj.104.042358
- Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
- Baranauskas G. (2007). Ionic channel function in action potential generation: current perspective. Mol. Neurobiol. 35: 129—150. PMID 17917103 DOI:10.1007/s12035-007-8001-0
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCND2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6238 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NZV8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|