TRPM2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPM2, Trpm2, 9830168K16Rik, C79133, LTRPC2, TRPC7, Trp7, Trrp7, EREG1, KNP3, NUDT9H, NUDT9L1, LTrpC-2, transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603749 MGI: 1351901 HomoloGene: 20709 GeneCards: TRPM2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
cyclic ADP-ribose, Перекис водню, NAADP, Арахідонова кислота, 2-aminoethoxydiphenylborate, клотримазол, Еконазол, flufenamic acid, міконазол, гідрон[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium channel activity • sodium channel activity • ion channel activity • cation channel activity • calcium ion binding • calcium-release channel activity • hydrolase activity • ligand-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • ADP-ribose diphosphatase activity • mono-ADP-D-ribose binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • лізосома • lysosomal membrane • integral component of plasma membrane • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • specific granule membrane • cell projection • перикаріон • tertiary granule membrane • ficolin-1-rich granule membrane |
---|
Біологічний процес | • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • cation transport • ion transport • GO:0001306 response to oxidative stress • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • temperature homeostasis • dendritic cell chemotaxis • response to purine-containing compound • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • neutrophil degranulation • release of sequestered calcium ion into cytosol • regulation of filopodium assembly • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to calcium ion • cellular response to purine-containing compound • cellular response to temperature stimulus • zinc ion transmembrane transport • dendritic cell differentiation • GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol • regulation of actin cytoskeleton reorganization • calcium ion import across plasma membrane • protein homotetramerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001001188 NM_003307 NM_001320350 NM_001320351 NM_001320352 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001307279 NP_001307280 NP_001307281 NP_003298 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 21: 44.35 – 44.44 Mb | Хр. 10: 77.91 – 77.97 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPM2 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 503 амінокислот, а молекулярна маса — 171 198[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEPSALRKAG | | SEQEEGFEGL | | PRRVTDLGMV | | SNLRRSNSSL | | FKSWRLQCPF |
GNNDKQESLS | | SWIPENIKKK | | ECVYFVESSK | | LSDAGKVVCQ | | CGYTHEQHLE |
EATKPHTFQG | | TQWDPKKHVQ | | EMPTDAFGDI | | VFTGLSQKVK | | KYVRVSQDTP |
SSVIYHLMTQ | | HWGLDVPNLL | | ISVTGGAKNF | | NMKPRLKSIF | | RRGLVKVAQT |
TGAWIITGGS | | HTGVMKQVGE | | AVRDFSLSSS | | YKEGELITIG | | VATWGTVHRR |
EGLIHPTGSF | | PAEYILDEDG | | QGNLTCLDSN | | HSHFILVDDG | | THGQYGVEIP |
LRTRLEKFIS | | EQTKERGGVA | | IKIPIVCVVL | | EGGPGTLHTI | | DNATTNGTPC |
VVVEGSGRVA | | DVIAQVANLP | | VSDITISLIQ | | QKLSVFFQEM | | FETFTESRIV |
EWTKKIQDIV | | RRRQLLTVFR | | EGKDGQQDVD | | VAILQALLKA | | SRSQDHFGHE |
NWDHQLKLAV | | AWNRVDIARS | | EIFMDEWQWK | | PSDLHPTMTA | | ALISNKPEFV |
KLFLENGVQL | | KEFVTWDTLL | | YLYENLDPSC | | LFHSKLQKVL | | VEDPERPACA |
PAAPRLQMHH | | VAQVLRELLG | | DFTQPLYPRP | | RHNDRLRLLL | | PVPHVKLNVQ |
GVSLRSLYKR | | SSGHVTFTMD | | PIRDLLIWAI | | VQNRRELAGI | | IWAQSQDCIA |
AALACSKILK | | ELSKEEEDTD | | SSEEMLALAE | | EYEHRAIGVF | | TECYRKDEER |
AQKLLTRVSE | | AWGKTTCLQL | | ALEAKDMKFV | | SHGGIQAFLT | | KVWWGQLSVD |
NGLWRVTLCM | | LAFPLLLTGL | | ISFREKRLQD | | VGTPAARARA | | FFTAPVVVFH |
LNILSYFAFL | | CLFAYVLMVD | | FQPVPSWCEC | | AIYLWLFSLV | | CEEMRQLFYD |
PDECGLMKKA | | ALYFSDFWNK | | LDVGAILLFV | | AGLTCRLIPA | | TLYPGRVILS |
LDFILFCLRL | | MHIFTISKTL | | GPKIIIVKRM | | MKDVFFFLFL | | LAVWVVSFGV |
AKQAILIHNE | | RRVDWLFRGA | | VYHSYLTIFG | | QIPGYIDGVN | | FNPEHCSPNG |
TDPYKPKCPE | | SDATQQRPAF | | PEWLTVLLLC | | LYLLFTNILL | | LNLLIAMFNY |
TFQQVQEHTD | | QIWKFQRHDL | | IEEYHGRPAA | | PPPFILLSHL | | QLFIKRVVLK |
TPAKRHKQLK | | NKLEKNEEAA | | LLSWEIYLKE | | NYLQNRQFQQ | | KQRPEQKIED |
ISNKVDAMVD | | LLDLDPLKRS | | GSMEQRLASL | | EEQVAQTAQA | | LHWIVRTLRA |
SGFSSEADVP | | TLASQKAAEE | | PDAEPGGRKK | | TEEPGDSYHV | | NARHLLYPNC |
PVTRFPVPNE | | KVPWETEFLI | | YDPPFYTAER | | KDAAAMDPMG | | DTLEPLSTIQ |
YNVVDGLRDR | | RSFHGPYTVQ | | AGLPLNPMGR | | TGLRGRGSLS | | CFGPNHTLYP |
MVTRWRRNED | | GAICRKSIKK | | MLEVLVVKLP | | LSEHWALPGG | | SREPGEMLPR |
KLKRILRQEH | | WPSFENLLKC | | GMEVYKGYMD | | DPRNTDNAWI | | ETVAVSVHFQ |
DQNDVELNRL | | NSNLHACDSG | | ASIRWQVVDR | | RIPLYANHKT | | LLQKAAAEFG |
AHY |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.
Література
- Uemura T., Kudoh J., Noda S., Kanba S., Shimizu N. (2005). Characterization of human and mouse TRPM2 genes: identification of a novel N-terminal truncated protein specifically expressed in human striatum. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 1232—1243. PMID 15708008 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.01.086
- Csanady L., Toerocsik B. (2009). Four Ca2+ ions activate TRPM2 channels by binding in deep crevices near the pore but intracellularly of the gate. J. Gen. Physiol. 133: 189—203. PMID 19171771 DOI:10.1085/jgp.200810109
- Toth B., Csanady L. (2010). Identification of direct and indirect effectors of the transient receptor potential melastatin 2 (TRPM2) cation channel. J. Biol. Chem. 285: 30091—30102. PMID 20650899 DOI:10.1074/jbc.M109.066464
- Toth B., Iordanov I., Csanady L. (2015). Ruling out pyridine dinucleotides as true TRPM2 channel activators reveals novel direct agonist ADP-ribose-2'-phosphate. J. Gen. Physiol. 145: 419—430. PMID 25918360 DOI:10.1085/jgp.201511377
- Iordanov I., Mihalyi C., Toth B., Csanady L. (2016). The proposed channel-enzyme transient receptor potential melastatin 2 does not possess ADP ribose hydrolase activity. Elife. 5: —. PMID 27383051 DOI:10.7554/eLife.17600
- Li F., Abuarab N., Sivaprasadarao A. (2016). Reciprocal regulation of actin cytoskeleton remodelling and cell migration by Ca2+ and Zn2+: role of TRPM2 channels. J. Cell Sci. 129: 2016—2029. PMID 27068538 DOI:10.1242/jcs.179796
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12339 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O94759 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|