TRPC5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC5, PPP1R159, TRP5, transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300334 MGI: 109524 HomoloGene: 74915 GeneCards: TRPC5 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Розиглітазон, Дайджеїн, Геністейн, 2-aminoethoxydiphenylborate, Прогестерон, хлорпромазин, flufenamic acid[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • store-operated calcium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity • clathrin binding • actin binding • actinin binding • ATPase binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Кальцієві канали • мембрана • цитоплазма • growth cone • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • membrane raft • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • manganese ion transport • ion transport • regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • нейробіологія розвитку • regulation of membrane hyperpolarization • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of axon extension • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of dendrite morphogenesis • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/42/PBB_GE_TRPC5_220552_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPC5_220552_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 111.77 – 112.08 Mb | Хр. X: 143.16 – 143.47 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 111 412[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQLYYKKVN | | YSPYRDRIPL | | QIVRAETELS | | AEEKAFLNAV | | EKGDYATVKQ |
ALQEAEIYYN | | VNINCMDPLG | | RSALLIAIEN | | ENLEIMELLL | | NHSVYVGDAL |
LYAIRKEVVG | | AVELLLSYRR | | PSGEKQVPTL | | MMDTQFSEFT | | PDITPIMLAA |
HTNNYEIIKL | | LVQKRVTIPR | | PHQIRCNCVE | | CVSSSEVDSL | | RHSRSRLNIY |
KALASPSLIA | | LSSEDPILTA | | FRLGWELKEL | | SKVENEFKAE | | YEELSQQCKL |
FAKDLLDQAR | | SSRELEIILN | | HRDDHSEELD | | PQKYHDLAKL | | KVAIKYHQKE |
FVAQPNCQQL | | LATLWYDGFP | | GWRRKHWVVK | | LLTCMTIGFL | | FPMLSIAYLI |
SPRSNLGLFI | | KKPFIKFICH | | TASYLTFLFM | | LLLASQHIVR | | TDLHVQGPPP |
TVVEWMILPW | | VLGFIWGEIK | | EMWDGGFTEY | | IHDWWNLMDF | | AMNSLYLATI |
SLKIVAYVKY | | NGSRPREEWE | | MWHPTLIAEA | | LFAISNILSS | | LRLISLFTAN |
SHLGPLQISL | | GRMLLDILKF | | LFIYCLVLLA | | FANGLNQLYF | | YYETRAIDEP |
NNCKGIRCEK | | QNNAFSTLFE | | TLQSLFWSVF | | GLLNLYVTNV | | KARHEFTEFV |
GATMFGTYNV | | ISLVVLLNML | | IAMMNNSYQL | | IADHADIEWK | | FARTKLWMSY |
FDEGGTLPPP | | FNIIPSPKSF | | LYLGNWFNNT | | FCPKRDPDGR | | RRRRNLRSFT |
ERNADSLIQN | | QHYQEVIRNL | | VKRYVAAMIR | | NSKTHEGLTE | | ENFKELKQDI |
SSFRYEVLDL | | LGNRKHPRSF | | STSSTELSQR | | DDNNDGSGGA | | RAKSKSVSFN |
LGCKKKTCHG | | PPLIRTMPRS | | SGAQGKSKAE | | SSSKRSFMGP | | SLKKLGLLFS |
KFNGHMSEPS | | SEPMYTISDG | | IVQQHCMWQD | | IRYSQMEKGK | | AEACSQSEIN |
LSEVELGEVQ | | GAAQSSECPL | | ACSSSLHCAS | | SICSSNSKLL | | DSSEDVFETW |
GEACDLLMHK | | WGDGQEEQVT | | TRL |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
- Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12337 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UL62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|