TRPM6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPM6, CHAK2, HMGX, HOMG, HOMG1, HSH, transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607009 MGI: 2675603 HomoloGene: 9767 GeneCards: TRPM6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
intestinal hypomagnesemia 1[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate, гідрон[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cation channel activity • ATP binding • calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • brush border membrane • apical plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • фосфорилювання • GO:0070839 metal ion transport • cation transport • ion transport • protein tetramerization • protein phosphorylation • calcium ion transmembrane transport • response to toxic substance • calcium ion transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/21/PBB_GE_TRPM6_221102_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPM6_221102_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001177310 NM_001177311 NM_017662 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001170781 NP_001170782 NP_060132 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 74.72 – 74.89 Mb | Хр. 19: 18.73 – 18.87 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPM6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 022 амінокислот, а молекулярна маса — 231 708[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKEQPVLERL | | QSQKSWIKGV | | FDKRECSTII | | PSSKNPHRCT | | PVCQVCQNLI |
RCYCGRLIGD | | HAGIDYSWTI | | SAAKGKESEQ | | WSVEKHTTKS | | PTDTFGTINF |
QDGEHTHHAK | | YIRTSYDTKL | | DHLLHLMLKE | | WKMELPKLVI | | SVHGGIQNFT |
MPSKFKEIFS | | QGLVKAAETT | | GAWIITEGIN | | TGVSKHVGDA | | LKSHSSHSLR |
KIWTVGIPPW | | GVIENQRDLI | | GKDVVCLYQT | | LDNPLSKLTT | | LNSMHSHFIL |
SDDGTVGKYG | | NEMKLRRNLE | | KYLSLQKIHC | | RSRQGVPVVG | | LVVEGGPNVI |
LSVWETVKDK | | DPVVVCEGTG | | RAADLLAFTH | | KHLADEGMLR | | PQVKEEIICM |
IQNTFNFSLK | | QSKHLFQILM | | ECMVHRDCIT | | IFDADSEEQQ | | DLDLAILTAL |
LKGTNLSASE | | QLNLAMAWDR | | VDIAKKHILI | | YEQHWKPDAL | | EQAMSDALVM |
DRVDFVKLLI | | EYGVNLHRFL | | TIPRLEELYN | | TKQGPTNTLL | | HHLVQDVKQH |
TLLSGYRITL | | IDIGLVVEYL | | IGRAYRSNYT | | RKHFRALYNN | | LYRKYKHQRH |
SSGNRNESAE | | STLHSQFIRT | | AQPYKFKEKS | | IVLHKSRKKS | | KEQNVSDDPE |
STGFLYPYND | | LLVWAVLMKR | | QKMAMFFWQH | | GEEATVKAVI | | ACILYRAMAH |
EAKESHMVDD | | ASEELKNYSK | | QFGQLALDLL | | EKAFKQNERM | | AMTLLTYELR |
NWSNSTCLKL | | AVSGGLRPFV | | SHTCTQMLLT | | DMWMGRLKMR | | KNSWLKIIIS |
IILPPTILTL | | EFKSKAEMSH | | VPQSQDFQFM | | WYYSDQNASS | | SKESASVKEY |
DLERGHDEKL | | DENQHFGLES | | GHQHLPWTRK | | VYEFYSAPIV | | KFWFYTMAYL |
AFLMLFTYTV | | LVEMQPQPSV | | QEWLVSIYIF | | TNAIEVVREI | | CISEPGKFTQ |
KVKVWISEYW | | NLTETVAIGL | | FSAGFVLRWG | | DPPFHTAGRL | | IYCIDIIFWF |
SRLLDFFAVN | | QHAGPYVTMI | | AKMTANMFYI | | VIIMAIVLLS | | FGVARKAILS |
PKEPPSWSLA | | RDIVFEPYWM | | IYGEVYAGEI | | DVCSSQPSCP | | PGSFLTPFLQ |
AVYLFVQYII | | MVNLLIAFFN | | NVYLDMESIS | | NNLWKYNRYR | | YIMTYHEKPW |
LPPPLILLSH | | VGLLLRRLCC | | HRAPHDQEEG | | DVGLKLYLSK | | EDLKKLHDFE |
EQCVEKYFHE | | KMEDVNCSCE | | ERIRVTSERV | | TEMYFQLKEM | | NEKVSFIKDS |
LLSLDSQVGH | | LQDLSALTVD | | TLKVLSAVDT | | LQEDEALLAK | | RKHSTCKKLP |
HSWSNVICAE | | VLGSMEIAGE | | KKYQYYSMPS | | SLLRSLAGGR | | HPPRVQRGAL |
LEITNSKREA | | TNVRNDQERQ | | ETQSSIVVSG | | VSPNRQAHSK | | YGQFLLVPSN |
LKRVPFSAET | | VLPLSRPSVP | | DVLATEQDIQ | | TEVLVHLTGQ | | TPVVSDWASV |
DEPKEKHEPI | | AHLLDGQDKA | | EQVLPTLSCT | | PEPMTMSSPL | | SQAKIMQTGG |
GYVNWAFSEG | | DETGVFSIKK | | KWQTCLPSTC | | DSDSSRSEQH | | QKQAQDSSLS |
DNSTRSAQSS | | ECSEVGPWLQ | | PNTSFWINPL | | RRYRPFARSH | | SFRFHKEEKL |
MKICKIKNLS | | GSSEIGQGAW | | VKAKMLTKDR | | RLSKKKKNTQ | | GLQVPIITVN |
ACSQSDQLNP | | EPGENSISEE | | EYSKNWFTVS | | KFSHTGVEPY | | IHQKMKTKEI |
GQCAIQISDY | | LKQSQEDLSK | | NSLWNSRSTN | | LNRNSLLKSS | | IGVDKISASL |
KSPQEPHHHY | | SAIERNNLMR | | LSQTIPFTPV | | QLFAGEEITV | | YRLEESSPLN |
LDKSMSSWSQ | | RGRAAMIQVL | | SREEMDGGLR | | KAMRVVSTWS | | EDDILKPGQV |
FIVKSFLPEV | | VRTWHKIFQE | | STVLHLCLRE | | IQQQRAAQKL | | IYTFNQVKPQ |
TIPYTPRFLE | | VFLIYCHSAN | | QWLTIEKYMT | | GEFRKYNNNN | | GDEITPTNTL |
EELMLAFSHW | | TYEYTRGELL | | VLDLQGVGEN | | LTDPSVIKPE | | VKQSRGMVFG |
PANLGEDAIR | | NFIAKHHCNS | | CCRKLKLPDL | | KRNDYSPERI | | NSTFGLEIKI |
ESAEEPPARE | | TGRNSPEDDM | | QL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Riazanova L.V., Pavur K.S., Petrov A.N., Dorovkov M.V., Riazanov A.G. (2001). Novel type of signaling molecules: protein kinases covalently linked to ion channels. Mol. Biol. (Mosk.). 35: 321—332. PMID 11357414
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPM6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17995 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BX84 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|